More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3103 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_3103  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  100 
 
 
660 aa  1332    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.133099  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0560  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  52.45 
 
 
657 aa  634  1e-180  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.341867  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1063  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  50.31 
 
 
663 aa  560  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.39661  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2039  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  45.1 
 
 
707 aa  548  1e-154  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4325  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  50.88 
 
 
691 aa  545  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.79538  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4426  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  48.16 
 
 
692 aa  521  1e-146  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2644  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  46.04 
 
 
651 aa  493  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2410  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  45.7 
 
 
658 aa  485  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0321  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  45.41 
 
 
652 aa  479  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3568  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  45.9 
 
 
701 aa  469  1.0000000000000001e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4193  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  44.19 
 
 
765 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8320  hydantoin utilization protein  40.48 
 
 
676 aa  458  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0475  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.36 
 
 
680 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3091  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.43 
 
 
681 aa  437  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.435048  normal  0.0725739 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20940  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  40 
 
 
706 aa  431  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796393  normal  0.0791884 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3493  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.08 
 
 
681 aa  429  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.875843  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0377  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.59 
 
 
676 aa  429  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5966  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.77 
 
 
694 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.858122  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1577  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.1 
 
 
739 aa  430  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2412  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  43.43 
 
 
662 aa  429  1e-119  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0201127  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8176  hydantoin utilization protein  39.47 
 
 
681 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6536  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.32 
 
 
678 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.234426 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0413  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.73 
 
 
648 aa  422  1e-117  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96856  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9148  hydantoin utilization protein  38.61 
 
 
687 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9128  hydantoin utilization protein  39.05 
 
 
680 aa  425  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6263  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.56 
 
 
673 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1496  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.11 
 
 
706 aa  421  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0678775  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6595  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.82 
 
 
674 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3601  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.19 
 
 
682 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0728  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.28 
 
 
649 aa  414  1e-114  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5632  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.74 
 
 
698 aa  414  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0796839 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3957  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.31 
 
 
674 aa  414  1e-114  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1245  Hydantoinase/oxoprolinase  40.69 
 
 
679 aa  412  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529227  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4047  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.79 
 
 
676 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0166577  decreased coverage  0.00142198 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3664  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.73 
 
 
691 aa  409  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00438442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1876  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.39 
 
 
690 aa  408  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5220  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.82 
 
 
680 aa  405  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46382  normal  0.858688 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1967  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.28 
 
 
683 aa  405  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.471219  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0803  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.42 
 
 
684 aa  403  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148951  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0038  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.39 
 
 
661 aa  404  1e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0079  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40 
 
 
687 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2083  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.84 
 
 
712 aa  401  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359641  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0466  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40 
 
 
649 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.162226  hitchhiker  0.000000366174 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3765  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.11 
 
 
690 aa  401  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.32896  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1127  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.85 
 
 
641 aa  399  9.999999999999999e-111  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.814296  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5988  N-methylhydantoinase A (Hydantoin utilization protein A)  38.64 
 
 
685 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.553202  normal  0.148202 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1913  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39 
 
 
684 aa  399  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0388506 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3641  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.24 
 
 
676 aa  396  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2226  5-oxoprolinase  40.56 
 
 
680 aa  394  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460045  normal  0.133433 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0425  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.14 
 
 
647 aa  394  1e-108  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1980  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.05 
 
 
693 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0124  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.32 
 
 
690 aa  389  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256267  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0640  putative N-methylhydantoinase A  41.27 
 
 
672 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.221754  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1696  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.03 
 
 
684 aa  392  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2293  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.12 
 
 
672 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.278366 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0132  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.8 
 
 
647 aa  390  1e-107  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.367806  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4581  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.46 
 
 
690 aa  386  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6260  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.82 
 
 
691 aa  389  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00292738  normal  0.765217 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3416  Hydantoinase/oxoprolinase  40.35 
 
 
698 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0371  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.41 
 
 
707 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1392  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.02 
 
 
657 aa  387  1e-106  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.307503  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0985  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  44.01 
 
 
726 aa  383  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.623858  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2447  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.02 
 
 
683 aa  383  1e-105  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4353  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.89 
 
 
692 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0176  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.74 
 
 
682 aa  382  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2130  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.76 
 
 
687 aa  383  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2368  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.4 
 
 
680 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.773275  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1857  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.15 
 
 
674 aa  385  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0444045 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4143  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.12 
 
 
702 aa  379  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2860  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39 
 
 
684 aa  382  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2390  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.44 
 
 
1229 aa  382  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1935  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40 
 
 
690 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7016  hydantoin utilization protein  37.43 
 
 
673 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.626492  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4697  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.01 
 
 
692 aa  373  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599265  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1518  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.02 
 
 
1222 aa  372  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307655  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0378  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.09 
 
 
1226 aa  375  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3625  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.07 
 
 
1229 aa  373  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218534  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3731  hydantoinase/oxoprolinase  37.16 
 
 
692 aa  375  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863672  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3649  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.73 
 
 
721 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.495656  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2907  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.15 
 
 
1242 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0182829 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1263  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.57 
 
 
698 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.438874  hitchhiker  0.00293366 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5342  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40 
 
 
699 aa  372  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4343  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.32 
 
 
1206 aa  369  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.808871  normal  0.0662323 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3115  Hydantoinase/oxoprolinase  40.3 
 
 
686 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0691  hydantoin utilization protein A  39.74 
 
 
689 aa  368  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.167885  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10270  5-oxoprolinase oplA  39.82 
 
 
1209 aa  369  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0830899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1233  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.43 
 
 
698 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2632  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.96 
 
 
701 aa  367  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.502801 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5799  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.24 
 
 
1203 aa  365  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0523355 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0004  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.55 
 
 
1218 aa  364  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.521135 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1519  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.81 
 
 
690 aa  363  5.0000000000000005e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4925  Hydantoin utilization protein A  35.08 
 
 
694 aa  362  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.153977 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2209  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.46 
 
 
690 aa  361  3e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.454656  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2362  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.74 
 
 
1211 aa  360  5e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.811931 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4408  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.76 
 
 
711 aa  360  6e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0790  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.65 
 
 
679 aa  359  8e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.745628 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3345  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.1 
 
 
1258 aa  356  8.999999999999999e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0277673 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4428  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.14 
 
 
690 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1559  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.92 
 
 
680 aa  355  2e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.63787  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2177  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.09 
 
 
1206 aa  355  2e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>