More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4296 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4296  cobalamin synthesis protein, P47K  100 
 
 		 366 aa  714    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5665  cobalamin synthesis protein P47K  49.3 
 
 		 320 aa  288  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0326957 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4765  cobalamin synthesis protein P47K  53.11 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0107  cobalamin synthesis protein P47K  35.9 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0640379  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0133  cobalamin synthesis protein, P47K  37.89 
 
 		 318 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.722195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1986  cobalamin synthesis protein P47K  37.5 
 
 		 336 aa  171  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4358  cobalamin synthesis protein P47K  45.96 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5758  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  44.55 
 
 		 318 aa  159  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  31.81 
 
 		 364 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3108  cobalamin synthesis protein, P47K  29.71 
 
 		 362 aa  144  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190819  normal  0.352092 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  37.74 
 
 		 341 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  37.74 
 
 		 353 aa  142  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7626  cobalamin synthesis protein/P47K  35.91 
 
 		 345 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.347938 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3717  cobalamin synthesis protein/P47K  37.02 
 
 		 379 aa  139  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  38.03 
 
 		 349 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0123  cobalamin synthesis protein, P47K  39.58 
 
 		 287 aa  138  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  37.32 
 
 		 384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  30.41 
 
 		 349 aa  137  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2949  cobalamin synthesis protein P47K  38.28 
 
 		 369 aa  136  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.645626  hitchhiker  0.00151664 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2644  cobalamin synthesis protein P47K  35.1 
 
 		 373 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0441  cobalamin synthesis protein, P47K  36.45 
 
 		 382 aa  135  9e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.319844  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  33.65 
 
 		 362 aa  135  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  30.68 
 
 		 336 aa  133  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6051  cobalamin synthesis protein P47K  37.38 
 
 		 330 aa  133  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  36.45 
 
 		 379 aa  133  6e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  27.56 
 
 		 327 aa  133  6e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4773  cobalamin synthesis protein P47K  32.68 
 
 		 377 aa  132  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0898546  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3251  cobalamin synthesis protein, P47K  46.58 
 
 		 290 aa  132  9e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.784399  normal  0.367551 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  36.45 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  36.19 
 
 		 360 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2408  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.86 
 
 		 386 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0519284  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  35.41 
 
 		 452 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  32.44 
 
 		 344 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0846  cobalamin synthesis protein P47K  30.84 
 
 		 449 aa  130  5.0000000000000004e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.256536  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2392  cobalamin synthesis protein P47K  33.65 
 
 		 378 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2341  cobalamin synthesis protein P47K  33.65 
 
 		 378 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  34.76 
 
 		 449 aa  129  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  37 
 
 		 355 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2218  cobalamin biosynthesis protein CobW  37.61 
 
 		 350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  34.45 
 
 		 380 aa  129  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  33.5 
 
 		 346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  33.01 
 
 		 342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  33.5 
 
 		 346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  34.76 
 
 		 449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  35.1 
 
 		 449 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  32.16 
 
 		 346 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6702  putative cobalamin synthesis protein cobW  42.44 
 
 		 309 aa  126  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.203286  normal  0.120205 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  35.15 
 
 		 338 aa  126  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2995  cobalamin synthesis protein P47K  30.75 
 
 		 410 aa  126  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  39.77 
 
 		 460 aa  126  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  40.49 
 
 		 337 aa  126  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  35.58 
 
 		 363 aa  126  7e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3403  cobalamin synthesis protein P47K  41.28 
 
 		 341 aa  125  8.000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  38.12 
 
 		 460 aa  125  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  34.65 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  29.26 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36 
 
 		 374 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  35.64 
 
 		 366 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  38.76 
 
 		 457 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5321  cobalamin synthesis protein, P47K  37.9 
 
 		 388 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  35.82 
 
 		 347 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  37.78 
 
 		 460 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  36 
 
 		 393 aa  124  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  36.32 
 
 		 349 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2976  cobalamin synthesis protein P47K  33.44 
 
 		 359 aa  124  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05461  G3E family GTPase  31.68 
 
 		 383 aa  123  4e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3630  cobalamin synthesis protein P47K  33.93 
 
 		 399 aa  123  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0621429 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25960  putative cobalamin biosynthesis protein cobW  36.73 
 
 		 375 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0063336  normal  0.0651392 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06660  predicted GTPase, G3E family  34.94 
 
 		 364 aa  123  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.747392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3679  cobalamin synthesis protein, P47K  39.44 
 
 		 405 aa  123  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.191921  normal  0.393021 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  36.32 
 
 		 350 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3508  cobalamin biosynthesis protein CobW  36.28 
 
 		 355 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2730  cobalamin synthesis protein, P47K  37.44 
 
 		 420 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2268  cobalamin biosynthesis protein CobW  36.28 
 
 		 358 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4067  cobalamin synthesis protein, P47K  37.73 
 
 		 403 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2441  cobalamin synthesis protein P47K  32.09 
 
 		 416 aa  122  8e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2421  cobalamin biosynthesis protein CobW  36.28 
 
 		 355 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.877489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  34.26 
 
 		 347 aa  122  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0750  cobalamin synthesis protein P47K  44.5 
 
 		 320 aa  122  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2774  cobalamin biosynthesis protein CobW  36.73 
 
 		 355 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1231  cobalamin synthesis protein, P47K  32.52 
 
 		 406 aa  122  9e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3566  cobalamin synthesis protein, P47K  38.81 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.107446  normal  0.0714729 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7138  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 360 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775863  normal  0.480911 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  30.87 
 
 		 320 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0491  hypothetical protein  30.69 
 
 		 362 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0830931  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4587  cobalamin biosynthesis protein CobW  37.17 
 
 		 349 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00207896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  36.32 
 
 		 328 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  36.32 
 
 		 328 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1120  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.67 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.201392  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3016  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  35.4 
 
 		 354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0521997  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  35.61 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3017  cobalamin synthesis protein P47K  36.49 
 
 		 415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.358971 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  34.31 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05171  G3E family GTPase  31.68 
 
 		 362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.842312  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3502  cobalamin synthesis protein, P47K  35.75 
 
 		 410 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.461262 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3014  cobalamin synthesis protein, P47K  36.61 
 
 		 540 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  35.61 
 
 		 364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0005  CobW/P47K family protein  30.51 
 
 		 446 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938262  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0065  cobalamin synthesis protein P47K  31.21 
 
 		 433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1025  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.67 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>