266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0904 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0904  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
197 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.758946 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.13 
 
 
527 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4778  cobyric acid synthase CobQ  84.13 
 
 
628 aa  97.8  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.316992 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4830  multi-sensor signal transduction histidine kinase  81.82 
 
 
848 aa  95.5  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356174  normal  0.508218 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5001  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  80.95 
 
 
828 aa  92.8  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0516  hypothetical protein  54.72 
 
 
202 aa  87.4  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0335528  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4764  hypothetical protein  75.41 
 
 
318 aa  81.6  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.966578 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  71.43 
 
 
389 aa  79.3  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4031  hypothetical protein  80 
 
 
361 aa  73.9  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.282109  normal  0.713722 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1582  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50 
 
 
324 aa  73.6  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.45945  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1614  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.3 
 
 
260 aa  72  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4296  cobalamin synthesis protein, P47K  90.24 
 
 
366 aa  71.2  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2236  NUDIX hydrolase  84.78 
 
 
322 aa  71.2  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0553  alcohol dehydrogenase  44.59 
 
 
325 aa  68.6  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0307226  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0763  hypothetical protein  86.05 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791123  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2472  alcohol dehydrogenase  44.74 
 
 
325 aa  68.2  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2060  alcohol dehydrogenase  44 
 
 
324 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal  0.174232 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2841  alcohol dehydrogenase  45.33 
 
 
324 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397829  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1703  alcohol dehydrogenase  44.3 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163624 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4840  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.05 
 
 
326 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0102128  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  81.4 
 
 
351 aa  65.9  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.497281  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1585  alcohol dehydrogenase  48.05 
 
 
326 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1604  alcohol dehydrogenase  46.75 
 
 
326 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.300093 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1171  alcohol dehydrogenase  45.95 
 
 
325 aa  64.3  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2985  alcohol dehydrogenase  50 
 
 
323 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5617  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.27 
 
 
324 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0414164  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2313  alcohol dehydrogenase  46.27 
 
 
324 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.730105 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2632  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.33 
 
 
324 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40031  decreased coverage  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1678  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.27 
 
 
324 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.05574  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2949  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.86 
 
 
324 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2290  alcohol dehydrogenase  46.27 
 
 
324 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0988  alcohol dehydrogenase  44.78 
 
 
324 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0091  alcohol dehydrogenase  47.06 
 
 
325 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.547437  hitchhiker  0.0000221127 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1305  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.79 
 
 
324 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263394  normal  0.0862174 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4057  alcohol dehydrogenase  48.72 
 
 
332 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00526605  normal  0.609446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0088  alcohol dehydrogenase  48.53 
 
 
325 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000155478 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3468  alcohol dehydrogenase  39.56 
 
 
328 aa  62.8  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0482  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.05 
 
 
322 aa  62.4  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3255  putative NADPH-quinone reductase  39.47 
 
 
324 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2194  alcohol dehydrogenase  45.33 
 
 
329 aa  62  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1504  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44 
 
 
324 aa  62.4  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0905187 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.89 
 
 
324 aa  61.6  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3635  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  47.22 
 
 
328 aa  61.6  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0787  quinone oxidoreductase  44.78 
 
 
324 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399125  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3497  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  45.83 
 
 
327 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2206  alcohol dehydrogenase  44.78 
 
 
324 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889298  normal  0.771237 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1879  quinone oxidoreductase  44.78 
 
 
324 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0458768  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1238  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  44.78 
 
 
324 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1516  quinone oxidoreductase  44 
 
 
324 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000615527  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1429  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.36 
 
 
331 aa  60.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1508  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.94 
 
 
325 aa  60.5  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4513  alcohol dehydrogenase  50 
 
 
332 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0363  quinone oxidoreductase  44.78 
 
 
324 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2328  alcohol dehydrogenase  44.78 
 
 
324 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1245  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  44.78 
 
 
324 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1080  quinone oxidoreductase  44.78 
 
 
324 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169344  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1391  quinone oxidoreductase  44.78 
 
 
324 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2619  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44 
 
 
324 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869285  normal  0.466568 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3872  alcohol dehydrogenase  42.7 
 
 
324 aa  59.7  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0674  alcohol dehydrogenase  48.61 
 
 
322 aa  60.5  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.31757 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1347  alcohol dehydrogenase  50 
 
 
324 aa  60.1  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.640537  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16020  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  37.14 
 
 
323 aa  60.1  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5553  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  47.69 
 
 
327 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.04 
 
 
324 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0255  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  43.24 
 
 
327 aa  59.7  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.263787  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1019  quinone oxidoreductase  33.33 
 
 
324 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.527544  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4512  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  47.69 
 
 
327 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4291  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  47.69 
 
 
327 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4603  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  47.69 
 
 
327 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1264  alcohol dehydrogenase  37.35 
 
 
327 aa  59.7  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4587  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  43.06 
 
 
327 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4450  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  46.38 
 
 
329 aa  59.7  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.553295 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03923  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  47.69 
 
 
327 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3942  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.69 
 
 
327 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1258  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.84 
 
 
328 aa  58.9  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.292182  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03883  hypothetical protein  47.69 
 
 
327 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.82301  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2044  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.54 
 
 
324 aa  59.3  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3977  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  47.69 
 
 
327 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.250547 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5388  alcohol dehydrogenase  45.71 
 
 
326 aa  59.3  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2235  alcohol dehydrogenase  37.93 
 
 
330 aa  58.9  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1156  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.32 
 
 
332 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00489379  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.21 
 
 
326 aa  58.9  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.46 
 
 
328 aa  58.9  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2944  hypothetical protein  49.4 
 
 
227 aa  58.5  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.234718  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0072  quinone oxidoreductase  40.26 
 
 
325 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.899686  hitchhiker  0.0000690857 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4502  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  43.24 
 
 
327 aa  58.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0088  alcohol dehydrogenase  40.26 
 
 
325 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4639  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  41.67 
 
 
327 aa  58.2  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0687735 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3853  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.26 
 
 
344 aa  58.2  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4588  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  41.67 
 
 
327 aa  58.2  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4493  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  41.67 
 
 
327 aa  58.2  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966191  normal  0.0601641 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3840  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.84 
 
 
323 aa  58.2  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00789848 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1942  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.96 
 
 
323 aa  57.8  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.21 
 
 
326 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3049  quinone oxidoreductase, putative  40.82 
 
 
331 aa  57.8  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.658374  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1228  alcohol dehydrogenase  37.36 
 
 
327 aa  57.4  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3232  alcohol dehydrogenase  37.18 
 
 
331 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.26 
 
 
326 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722017  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0024  quinone oxidoreductase  50.91 
 
 
325 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.523604  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.96 
 
 
326 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.642936 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>