More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1171 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1171  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
325 aa  646    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0281  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.25 
 
 
320 aa  390  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  61.18 
 
 
322 aa  382  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1821  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  64.29 
 
 
322 aa  383  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00168562  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0419  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  59.94 
 
 
320 aa  379  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0538396  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2075  alcohol dehydrogenase  62.42 
 
 
322 aa  372  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7384  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.85 
 
 
325 aa  349  3e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0942  zinc-binding alcohol dehydrogenase  56.48 
 
 
324 aa  340  2e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0332655  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16020  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  56.56 
 
 
323 aa  338  5e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.39 
 
 
323 aa  337  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7387  putative quinone oxidoreductase  55.9 
 
 
319 aa  337  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2374  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.75 
 
 
327 aa  335  5.999999999999999e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.220346  normal  0.0293571 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1039  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.14 
 
 
321 aa  332  5e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.73 
 
 
322 aa  328  9e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3438  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.69 
 
 
321 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2572  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  54.97 
 
 
319 aa  322  4e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2985  alcohol dehydrogenase  54.21 
 
 
323 aa  319  5e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.01 
 
 
323 aa  318  7e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5040  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.49 
 
 
323 aa  318  1e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13939  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3308  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.48 
 
 
321 aa  317  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000692795  normal  0.0484159 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2969  alcohol dehydrogenase  51.55 
 
 
324 aa  315  7e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22350  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  52.91 
 
 
327 aa  315  9e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2472  alcohol dehydrogenase  52.96 
 
 
325 aa  313  1.9999999999999998e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.7 
 
 
323 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  51.39 
 
 
323 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3255  putative NADPH-quinone reductase  50.15 
 
 
324 aa  311  9e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2228  putative quinone oxidoreductase  51.88 
 
 
322 aa  311  1e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.806393  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3210  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.04 
 
 
322 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5020  alcohol dehydrogenase  53.42 
 
 
321 aa  309  5e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00109136  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1305  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50 
 
 
324 aa  309  5e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263394  normal  0.0862174 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3109  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.73 
 
 
322 aa  308  9e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1325  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.05 
 
 
327 aa  306  3e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2184  NADPH:quinone reductase, zeta-crystallin homolog oxidoreductase protein  50.93 
 
 
324 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200214  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0988  alcohol dehydrogenase  49.69 
 
 
324 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5617  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50 
 
 
324 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0414164  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.66 
 
 
323 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1694  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.08 
 
 
325 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0377622  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1678  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.31 
 
 
324 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.05574  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2290  alcohol dehydrogenase  50.31 
 
 
324 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2313  alcohol dehydrogenase  50.31 
 
 
324 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.730105 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  49.23 
 
 
324 aa  300  2e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.07 
 
 
326 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2619  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.76 
 
 
324 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869285  normal  0.466568 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2517  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.93 
 
 
321 aa  300  3e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0419474  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1640  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.86 
 
 
324 aa  299  4e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.140848  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.07 
 
 
326 aa  299  5e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722017  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4840  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.07 
 
 
326 aa  298  6e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0102128  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.09 
 
 
321 aa  296  4e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3049  quinone oxidoreductase, putative  49.08 
 
 
331 aa  296  4e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.658374  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  48.3 
 
 
325 aa  295  5e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1019  quinone oxidoreductase  48.76 
 
 
324 aa  295  5e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.527544  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.83 
 
 
324 aa  295  5e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1238  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  48.14 
 
 
324 aa  295  8e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2206  alcohol dehydrogenase  49.38 
 
 
324 aa  295  8e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889298  normal  0.771237 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2328  alcohol dehydrogenase  49.38 
 
 
324 aa  295  8e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1879  quinone oxidoreductase  48.14 
 
 
324 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0458768  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1391  quinone oxidoreductase  48.14 
 
 
324 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0363  quinone oxidoreductase  48.14 
 
 
324 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1080  quinone oxidoreductase  48.14 
 
 
324 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169344  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1245  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  48.14 
 
 
324 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11482  quinone reductase qor (NADPH:quinone reductase) (zeta-crystallin protein)  50.91 
 
 
328 aa  294  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000201943  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0787  quinone oxidoreductase  48.14 
 
 
324 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399125  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2194  alcohol dehydrogenase  49.38 
 
 
329 aa  294  1e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3232  alcohol dehydrogenase  47.68 
 
 
331 aa  293  3e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1582  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.16 
 
 
324 aa  293  3e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.45945  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0197  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.85 
 
 
327 aa  293  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3840  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.07 
 
 
323 aa  292  4e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00789848 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2060  alcohol dehydrogenase  47.52 
 
 
324 aa  293  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal  0.174232 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1585  alcohol dehydrogenase  48.76 
 
 
326 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  48.45 
 
 
324 aa  293  4e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2044  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.52 
 
 
324 aa  291  1e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2949  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.2 
 
 
324 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0482  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.36 
 
 
322 aa  290  2e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3620  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.07 
 
 
324 aa  290  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2632  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.2 
 
 
324 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40031  decreased coverage  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1494  alcohol dehydrogenase  49.38 
 
 
321 aa  289  4e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.275992  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2841  alcohol dehydrogenase  46.89 
 
 
324 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397829  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1604  alcohol dehydrogenase  48.14 
 
 
326 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.300093 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.89 
 
 
327 aa  288  6e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1644  alcohol dehydrogenase  48.3 
 
 
325 aa  288  7e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01030  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  48.62 
 
 
325 aa  288  8e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.38 
 
 
324 aa  288  9e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1596  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.58 
 
 
326 aa  288  9e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3853  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.27 
 
 
344 aa  288  9e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0197  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.3 
 
 
318 aa  288  1e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0245  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50 
 
 
326 aa  286  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2724  alcohol dehydrogenase  50 
 
 
324 aa  286  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0988305  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5659  alcohol dehydrogenase  46.18 
 
 
329 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.591767 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3723  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.18 
 
 
329 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4645  alcohol dehydrogenase  46.18 
 
 
329 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3686  alcohol dehydrogenase  50 
 
 
331 aa  286  4e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343623  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2820  alcohol dehydrogenase  45.65 
 
 
326 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.516166 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3468  alcohol dehydrogenase  46.27 
 
 
328 aa  285  5e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1170  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.22 
 
 
331 aa  285  7e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.636549 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0233  quinone oxidoreductase  50.15 
 
 
323 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2677  alcohol dehydrogenase  45.34 
 
 
326 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1504  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.52 
 
 
324 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0905187 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1258  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.13 
 
 
328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.292182  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1419  alcohol dehydrogenase  48.61 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173478  normal  0.0573079 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1191  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.04 
 
 
323 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>