More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0197 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0197  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
318 aa  622  1e-177  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7387  putative quinone oxidoreductase  57.81 
 
 
319 aa  353  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2572  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  53.75 
 
 
319 aa  326  3e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0281  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.09 
 
 
320 aa  318  1e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0419  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  49.53 
 
 
320 aa  306  3e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0538396  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  51.39 
 
 
322 aa  305  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2228  putative quinone oxidoreductase  54.35 
 
 
322 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.806393  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16020  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  52.94 
 
 
323 aa  303  2.0000000000000002e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0942  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.82 
 
 
324 aa  302  5.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0332655  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2374  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.84 
 
 
327 aa  300  3e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.220346  normal  0.0293571 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2724  alcohol dehydrogenase  49.54 
 
 
324 aa  298  9e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0988305  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2075  alcohol dehydrogenase  51.08 
 
 
322 aa  296  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2465  alcohol dehydrogenase  49.7 
 
 
324 aa  296  4e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.955919  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5020  alcohol dehydrogenase  51.23 
 
 
321 aa  296  4e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00109136  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.72 
 
 
321 aa  294  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3308  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.55 
 
 
321 aa  294  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000692795  normal  0.0484159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2427  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.46 
 
 
327 aa  292  6e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2472  alcohol dehydrogenase  50.46 
 
 
324 aa  292  6e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.832355  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3686  alcohol dehydrogenase  48.63 
 
 
331 aa  291  7e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343623  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3438  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.73 
 
 
321 aa  291  8e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.11 
 
 
323 aa  289  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11482  quinone reductase qor (NADPH:quinone reductase) (zeta-crystallin protein)  49.85 
 
 
328 aa  288  8e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000201943  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1171  alcohol dehydrogenase  48.3 
 
 
325 aa  288  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1821  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.08 
 
 
322 aa  287  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00168562  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1494  alcohol dehydrogenase  49.53 
 
 
321 aa  288  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.275992  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2517  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.31 
 
 
321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0419474  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7384  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.16 
 
 
325 aa  278  6e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1191  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.96 
 
 
323 aa  276  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22350  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  50 
 
 
327 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1325  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.3 
 
 
327 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2376  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.83 
 
 
322 aa  275  1.0000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487886  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1221  putative quinone oxidoreductase  50 
 
 
331 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.908544  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0935  putative quinone oxidoreductase  50 
 
 
331 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0233  quinone oxidoreductase  50.31 
 
 
323 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1920  putative quinone oxidoreductase  50 
 
 
323 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2197  putative quinone oxidoreductase  50 
 
 
323 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.51788  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1683  quinone oxidoreductase, putative  50 
 
 
323 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0232  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  50 
 
 
323 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0322  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  49.69 
 
 
331 aa  272  7e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5040  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.46 
 
 
323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13939  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01030  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  47.85 
 
 
325 aa  268  8e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1039  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.93 
 
 
321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2985  alcohol dehydrogenase  48.14 
 
 
323 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1640  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.16 
 
 
324 aa  263  3e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.140848  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.75 
 
 
326 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2969  alcohol dehydrogenase  45.51 
 
 
324 aa  260  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00210  NADH-quinone oxidoreductase  46.6 
 
 
325 aa  259  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336084  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1508  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.37 
 
 
325 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.44 
 
 
326 aa  258  6e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722017  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.82 
 
 
322 aa  258  7e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1170  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.68 
 
 
331 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.636549 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0553  alcohol dehydrogenase  47.83 
 
 
325 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0307226  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3723  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.57 
 
 
329 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4645  alcohol dehydrogenase  45.57 
 
 
329 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5659  alcohol dehydrogenase  45.57 
 
 
329 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.591767 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1582  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.34 
 
 
324 aa  256  4e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.45945  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1942  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.65 
 
 
323 aa  256  5e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3620  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.2 
 
 
324 aa  255  7e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2184  NADPH:quinone reductase, zeta-crystallin homolog oxidoreductase protein  45.82 
 
 
324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200214  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1264  alcohol dehydrogenase  45.71 
 
 
327 aa  253  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1019  quinone oxidoreductase  43.65 
 
 
324 aa  252  6e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.527544  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5019  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.15 
 
 
317 aa  251  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0480145  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1238  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  42.72 
 
 
324 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  41.98 
 
 
325 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0787  quinone oxidoreductase  42.72 
 
 
324 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399125  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2841  alcohol dehydrogenase  47.8 
 
 
325 aa  250  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0506355 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1879  quinone oxidoreductase  42.72 
 
 
324 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0458768  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1080  quinone oxidoreductase  42.72 
 
 
324 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169344  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1245  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  42.72 
 
 
324 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0197  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.14 
 
 
327 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0363  quinone oxidoreductase  42.72 
 
 
324 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  42.59 
 
 
324 aa  250  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1391  quinone oxidoreductase  42.72 
 
 
324 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0088  alcohol dehydrogenase  44 
 
 
325 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000155478 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.68 
 
 
323 aa  249  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5617  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.34 
 
 
324 aa  248  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0414164  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3455  alcohol dehydrogenase  47.65 
 
 
325 aa  247  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.72 
 
 
324 aa  246  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0091  alcohol dehydrogenase  43.08 
 
 
325 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.547437  hitchhiker  0.0000221127 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.65 
 
 
327 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0988  alcohol dehydrogenase  43.34 
 
 
324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1694  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.52 
 
 
325 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0377622  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0088  alcohol dehydrogenase  43.38 
 
 
325 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2114  alcohol dehydrogenase  46.75 
 
 
322 aa  242  7e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.76358  decreased coverage  0.00286846 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0072  quinone oxidoreductase  43.08 
 
 
325 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.899686  hitchhiker  0.0000690857 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.67 
 
 
323 aa  241  9e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  41.67 
 
 
323 aa  241  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1526  alcohol dehydrogenase  42.11 
 
 
326 aa  241  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.28 
 
 
323 aa  240  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1833  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.48 
 
 
328 aa  240  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.053429  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2472  alcohol dehydrogenase  44.24 
 
 
325 aa  240  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0245  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.11 
 
 
326 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1678  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.34 
 
 
324 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.05574  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2290  alcohol dehydrogenase  43.34 
 
 
324 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2313  alcohol dehydrogenase  43.34 
 
 
324 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.730105 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0289  putative NADPH-quinone oxidoreductase, Zn containing  42.81 
 
 
349 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4840  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.59 
 
 
326 aa  236  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0102128  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2328  alcohol dehydrogenase  42.41 
 
 
324 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2206  alcohol dehydrogenase  42.41 
 
 
324 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889298  normal  0.771237 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3027  alcohol dehydrogenase  45.65 
 
 
324 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>