More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3027 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3381  NAD(P)H -dependent quinone oxidoreductase  98.77 
 
 		 324 aa  643    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.41624  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3027  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 324 aa  650    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3861  hypothetical protein  86.73 
 
 		 324 aa  580  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  53.23 
 
 		 325 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  52.8 
 
 		 324 aa  331  8e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.92 
 
 		 327 aa  325  7e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1694  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.8 
 
 		 325 aa  324  1e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0377622  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1238  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  53.07 
 
 		 324 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0363  quinone oxidoreductase  53.07 
 
 		 324 aa  322  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1879  quinone oxidoreductase  53.07 
 
 		 324 aa  322  5e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0458768  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1245  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  53.07 
 
 		 324 aa  322  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1080  quinone oxidoreductase  53.07 
 
 		 324 aa  322  5e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169344  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0787  quinone oxidoreductase  53.07 
 
 		 324 aa  322  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399125  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1391  quinone oxidoreductase  52.76 
 
 		 324 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2184  NADPH:quinone reductase, zeta-crystallin homolog oxidoreductase protein  54.4 
 
 		 324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.52 
 
 		 326 aa  318  6e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1019  quinone oxidoreductase  52.31 
 
 		 324 aa  317  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.527544  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2619  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.02 
 
 		 324 aa  316  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869285  normal  0.466568 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3255  putative NADPH-quinone reductase  52.45 
 
 		 324 aa  315  6e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.2 
 
 		 326 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5020  alcohol dehydrogenase  53.75 
 
 		 321 aa  314  9.999999999999999e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00109136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5617  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.68 
 
 		 324 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0414164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1305  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.15 
 
 		 324 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263394  normal  0.0862174 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.62 
 
 		 323 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1504  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.96 
 
 		 324 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0905187 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1170  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.01 
 
 		 331 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.636549 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2985  alcohol dehydrogenase  54.21 
 
 		 323 aa  311  6.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2044  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.02 
 
 		 324 aa  311  1e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1419  alcohol dehydrogenase  49.54 
 
 		 325 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173478  normal  0.0573079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.47 
 
 		 324 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.38 
 
 		 326 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.317199  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2472  alcohol dehydrogenase  52.65 
 
 		 325 aa  307  1.0000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0988  alcohol dehydrogenase  50.15 
 
 		 324 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2328  alcohol dehydrogenase  50.92 
 
 		 324 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2206  alcohol dehydrogenase  50.92 
 
 		 324 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889298  normal  0.771237 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2841  alcohol dehydrogenase  50.78 
 
 		 324 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1715  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.45 
 
 		 326 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2632  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.47 
 
 		 324 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40031  decreased coverage  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2949  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.16 
 
 		 324 aa  298  7e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.64 
 
 		 323 aa  298  8e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4146  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  50.96 
 
 		 315 aa  298  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.768272  normal  0.178855 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  50.32 
 
 		 323 aa  296  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5834  quinone oxidoreductase (NADPH  52.34 
 
 		 324 aa  296  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487323  normal  0.847734 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2313  alcohol dehydrogenase  50.15 
 
 		 324 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.730105 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1678  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.15 
 
 		 324 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.05574  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2290  alcohol dehydrogenase  50.15 
 
 		 324 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50 
 
 		 323 aa  295  5e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3872  alcohol dehydrogenase  48.45 
 
 		 324 aa  295  7e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1508  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.47 
 
 		 325 aa  295  7e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1582  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.76 
 
 		 324 aa  293  3e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.45945  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.46 
 
 		 324 aa  292  5e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  49.68 
 
 		 324 aa  292  5e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2060  alcohol dehydrogenase  48.77 
 
 		 324 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal  0.174232 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.98 
 
 		 322 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4840  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.38 
 
 		 326 aa  289  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0102128  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1264  alcohol dehydrogenase  49.69 
 
 		 327 aa  286  2.9999999999999996e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1585  alcohol dehydrogenase  51.54 
 
 		 326 aa  285  9e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1258  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.01 
 
 		 328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.292182  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0419  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  47.83 
 
 		 320 aa  284  1.0000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0538396  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0281  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.6 
 
 		 320 aa  284  1.0000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3620  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.57 
 
 		 324 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0553  alcohol dehydrogenase  51.25 
 
 		 325 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0307226  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2572  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  49.69 
 
 		 319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3468  alcohol dehydrogenase  48.61 
 
 		 328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3210  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.37 
 
 		 322 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3109  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.37 
 
 		 322 aa  281  7.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1228  alcohol dehydrogenase  48.61 
 
 		 327 aa  281  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2235  alcohol dehydrogenase  48.42 
 
 		 330 aa  280  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2194  alcohol dehydrogenase  51.25 
 
 		 329 aa  279  4e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5388  alcohol dehydrogenase  49.84 
 
 		 326 aa  279  5e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3232  alcohol dehydrogenase  48.18 
 
 		 331 aa  279  5e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  50.96 
 
 		 322 aa  279  6e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3028  alcohol dehydrogenase  48.6 
 
 		 324 aa  278  7e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.915706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1191  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.53 
 
 		 323 aa  278  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00210  NADH-quinone oxidoreductase  51.42 
 
 		 325 aa  278  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336084  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1604  alcohol dehydrogenase  50.31 
 
 		 326 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.300093 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0024  quinone oxidoreductase  49.84 
 
 		 325 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.523604  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.3 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0942  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.15 
 
 		 324 aa  275  6e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0332655  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2820  alcohol dehydrogenase  48.11 
 
 		 326 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.516166 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.34 
 
 		 326 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1494  alcohol dehydrogenase  48.92 
 
 		 321 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.275992  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3853  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.68 
 
 		 344 aa  273  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2677  alcohol dehydrogenase  48.11 
 
 		 326 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3438  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.85 
 
 		 321 aa  273  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0088  alcohol dehydrogenase  48.74 
 
 		 325 aa  272  6e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0072  quinone oxidoreductase  48.74 
 
 		 325 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.899686  hitchhiker  0.0000690857 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.47 
 
 		 321 aa  271  8.000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1429  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.99 
 
 		 331 aa  271  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7384  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.47 
 
 		 325 aa  271  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2841  alcohol dehydrogenase  50.3 
 
 		 325 aa  271  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0506355 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2173  alcohol dehydrogenase  46.95 
 
 		 330 aa  270  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.133443 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1171  alcohol dehydrogenase  49.22 
 
 		 325 aa  270  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00250  quinone oxidoreductase  48.89 
 
 		 325 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.798779 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0482  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.69 
 
 		 322 aa  270  2.9999999999999997e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.34 
 
 		 326 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1644  alcohol dehydrogenase  45.71 
 
 		 325 aa  270  4e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7387  putative quinone oxidoreductase  47.35 
 
 		 319 aa  269  5e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0091  alcohol dehydrogenase  48.11 
 
 		 325 aa  268  7e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.547437  hitchhiker  0.0000221127 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0021  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.98 
 
 		 325 aa  268  8e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00189953  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>