More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2949 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_2949  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
324 aa  659    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2841  alcohol dehydrogenase  93.21 
 
 
324 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397829  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2632  zinc-binding alcohol dehydrogenase  93.21 
 
 
324 aa  623  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40031  decreased coverage  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2619  zinc-binding alcohol dehydrogenase  86.73 
 
 
324 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869285  normal  0.466568 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2044  zinc-binding alcohol dehydrogenase  86.42 
 
 
324 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4146  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  86.67 
 
 
315 aa  565  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.768272  normal  0.178855 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1504  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  84.26 
 
 
324 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0905187 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3872  alcohol dehydrogenase  61.42 
 
 
324 aa  414  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3028  alcohol dehydrogenase  59.57 
 
 
324 aa  385  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.915706  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.48 
 
 
324 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3840  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.33 
 
 
323 aa  372  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00789848 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1715  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.52 
 
 
326 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  56.79 
 
 
324 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.52 
 
 
326 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.317199  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.28 
 
 
323 aa  363  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  55.86 
 
 
325 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  54.97 
 
 
323 aa  361  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1419  alcohol dehydrogenase  55.69 
 
 
325 aa  360  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173478  normal  0.0573079 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  56.48 
 
 
324 aa  357  9.999999999999999e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.35 
 
 
323 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1238  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  56.31 
 
 
324 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1391  quinone oxidoreductase  56.31 
 
 
324 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0363  quinone oxidoreductase  56.31 
 
 
324 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1879  quinone oxidoreductase  56.31 
 
 
324 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0458768  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1245  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  56.31 
 
 
324 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0787  quinone oxidoreductase  56.31 
 
 
324 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399125  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1305  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.46 
 
 
324 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263394  normal  0.0862174 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1080  quinone oxidoreductase  56.31 
 
 
324 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169344  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2060  alcohol dehydrogenase  55.38 
 
 
324 aa  354  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal  0.174232 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1019  quinone oxidoreductase  56.62 
 
 
324 aa  354  1e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.527544  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3255  putative NADPH-quinone reductase  54.15 
 
 
324 aa  353  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2184  NADPH:quinone reductase, zeta-crystallin homolog oxidoreductase protein  55.69 
 
 
324 aa  350  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200214  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.63 
 
 
326 aa  350  3e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722017  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.94 
 
 
326 aa  349  4e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  57.85 
 
 
324 aa  348  5e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0988  alcohol dehydrogenase  55.69 
 
 
324 aa  348  5e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1694  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.77 
 
 
325 aa  347  2e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0377622  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5617  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  55.69 
 
 
324 aa  342  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0414164  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1191  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.4 
 
 
323 aa  341  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  53.85 
 
 
327 aa  338  8e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1678  zinc-binding alcohol dehydrogenase  55.38 
 
 
324 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.05574  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1582  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.85 
 
 
324 aa  337  9.999999999999999e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.45945  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2313  alcohol dehydrogenase  55.38 
 
 
324 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.730105 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2290  alcohol dehydrogenase  55.38 
 
 
324 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1508  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.15 
 
 
325 aa  336  1.9999999999999998e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.23 
 
 
323 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2206  alcohol dehydrogenase  55.38 
 
 
324 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889298  normal  0.771237 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2985  alcohol dehydrogenase  54.01 
 
 
323 aa  335  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2328  alcohol dehydrogenase  55.38 
 
 
324 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2472  alcohol dehydrogenase  54.18 
 
 
325 aa  334  1e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1644  alcohol dehydrogenase  51.69 
 
 
325 aa  330  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3620  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.62 
 
 
324 aa  324  1e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1942  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.31 
 
 
323 aa  319  3.9999999999999996e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4840  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.31 
 
 
326 aa  317  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0102128  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1264  alcohol dehydrogenase  52.47 
 
 
327 aa  315  5e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0023  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.92 
 
 
325 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0024  quinone oxidoreductase  50.77 
 
 
325 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.523604  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1228  alcohol dehydrogenase  52.15 
 
 
327 aa  314  9.999999999999999e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4639  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  52.28 
 
 
327 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0687735 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4587  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  52.58 
 
 
327 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00250  quinone oxidoreductase  50.46 
 
 
325 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.798779 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4502  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  52.58 
 
 
327 aa  312  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4493  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  52.58 
 
 
327 aa  312  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966191  normal  0.0601641 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4588  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  52.58 
 
 
327 aa  312  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0091  alcohol dehydrogenase  51.08 
 
 
325 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.547437  hitchhiker  0.0000221127 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2969  alcohol dehydrogenase  50.77 
 
 
324 aa  311  6.999999999999999e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3468  alcohol dehydrogenase  52.45 
 
 
328 aa  310  2e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1585  alcohol dehydrogenase  51.38 
 
 
326 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5020  alcohol dehydrogenase  51.4 
 
 
321 aa  310  2.9999999999999997e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00109136  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2820  alcohol dehydrogenase  51.08 
 
 
326 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.516166 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1170  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.86 
 
 
331 aa  309  4e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.636549 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.85 
 
 
326 aa  309  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.54 
 
 
326 aa  309  5e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2677  alcohol dehydrogenase  50.77 
 
 
326 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1258  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.92 
 
 
328 aa  308  6.999999999999999e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.292182  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0088  alcohol dehydrogenase  51.08 
 
 
325 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000155478 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1604  alcohol dehydrogenase  51.08 
 
 
326 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.300093 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0173  quinone oxidoreductase  52.62 
 
 
325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0088  alcohol dehydrogenase  50.77 
 
 
325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3049  quinone oxidoreductase, putative  51.23 
 
 
331 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.658374  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0072  quinone oxidoreductase  50.77 
 
 
325 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.899686  hitchhiker  0.0000690857 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.62 
 
 
322 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0710  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  49.85 
 
 
331 aa  305  5.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.384403  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0021  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.08 
 
 
325 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00189953  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5834  quinone oxidoreductase (NADPH  52.32 
 
 
324 aa  305  7e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487323  normal  0.847734 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4544  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  49.85 
 
 
327 aa  305  8.000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16020  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  50.93 
 
 
323 aa  305  1.0000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.15 
 
 
328 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3942  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.15 
 
 
327 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4512  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  49.85 
 
 
327 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4603  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  49.85 
 
 
327 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4291  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  49.85 
 
 
327 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5553  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  49.85 
 
 
327 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2235  alcohol dehydrogenase  50.61 
 
 
330 aa  302  7.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1596  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.54 
 
 
326 aa  301  9e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03923  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  49.85 
 
 
327 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3977  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  49.85 
 
 
327 aa  301  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.250547 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03883  hypothetical protein  49.85 
 
 
327 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.82301  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7175  alcohol dehydrogenase  49.85 
 
 
327 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3232  alcohol dehydrogenase  51.08 
 
 
331 aa  300  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>