More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3049 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3049  quinone oxidoreductase, putative  100 
 
 		 331 aa  665    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.658374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1228  alcohol dehydrogenase  78.4 
 
 		 327 aa  523  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3853  zinc-binding alcohol dehydrogenase  75.47 
 
 		 344 aa  513  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1258  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  75.23 
 
 		 328 aa  508  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.292182  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3468  alcohol dehydrogenase  75.78 
 
 		 328 aa  502  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1429  zinc-binding alcohol dehydrogenase  72.95 
 
 		 331 aa  500  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  74.22 
 
 		 328 aa  491  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3232  alcohol dehydrogenase  71.12 
 
 		 331 aa  491  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2235  alcohol dehydrogenase  72.14 
 
 		 330 aa  485  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5388  alcohol dehydrogenase  72.53 
 
 		 326 aa  473  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0482  zinc-binding alcohol dehydrogenase  65.51 
 
 		 322 aa  411  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2184  NADPH:quinone reductase, zeta-crystallin homolog oxidoreductase protein  63.19 
 
 		 324 aa  410  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  62.46 
 
 		 327 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.62 
 
 		 326 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.62 
 
 		 326 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1191  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  59.08 
 
 		 323 aa  385  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  58.72 
 
 		 324 aa  382  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  58.41 
 
 		 325 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.24 
 
 		 323 aa  379  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.24 
 
 		 323 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  59.94 
 
 		 323 aa  375  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3255  putative NADPH-quinone reductase  55.52 
 
 		 324 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2060  alcohol dehydrogenase  55.38 
 
 		 324 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal  0.174232 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1080  quinone oxidoreductase  55.38 
 
 		 324 aa  368  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169344  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1879  quinone oxidoreductase  55.38 
 
 		 324 aa  368  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0458768  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  59.2 
 
 		 324 aa  371  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1391  quinone oxidoreductase  55.38 
 
 		 324 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0787  quinone oxidoreductase  55.38 
 
 		 324 aa  368  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399125  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5617  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  56.31 
 
 		 324 aa  371  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0414164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0363  quinone oxidoreductase  55.38 
 
 		 324 aa  368  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1019  quinone oxidoreductase  55.69 
 
 		 324 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.527544  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1245  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  55.38 
 
 		 324 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1238  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  55.38 
 
 		 324 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1305  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.08 
 
 		 324 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263394  normal  0.0862174 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  58.59 
 
 		 324 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1264  alcohol dehydrogenase  57.62 
 
 		 327 aa  365  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0988  alcohol dehydrogenase  54.77 
 
 		 324 aa  364  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0091  alcohol dehydrogenase  57.98 
 
 		 325 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.547437  hitchhiker  0.0000221127 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1508  zinc-binding alcohol dehydrogenase  58.28 
 
 		 325 aa  363  3e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  57.41 
 
 		 324 aa  361  1e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2472  alcohol dehydrogenase  57.59 
 
 		 325 aa  360  1e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1678  zinc-binding alcohol dehydrogenase  55.38 
 
 		 324 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.05574  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2290  alcohol dehydrogenase  55.38 
 
 		 324 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2313  alcohol dehydrogenase  55.38 
 
 		 324 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.730105 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1419  alcohol dehydrogenase  57.19 
 
 		 325 aa  358  6e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173478  normal  0.0573079 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0024  quinone oxidoreductase  57.36 
 
 		 325 aa  358  8e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.523604  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2969  alcohol dehydrogenase  54.91 
 
 		 324 aa  357  9.999999999999999e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5834  quinone oxidoreductase (NADPH  58.82 
 
 		 324 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487323  normal  0.847734 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00250  quinone oxidoreductase  57.06 
 
 		 325 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.798779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0088  alcohol dehydrogenase  56.44 
 
 		 325 aa  355  5e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000155478 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2985  alcohol dehydrogenase  55.69 
 
 		 323 aa  355  5.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2206  alcohol dehydrogenase  54.77 
 
 		 324 aa  354  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889298  normal  0.771237 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2328  alcohol dehydrogenase  54.77 
 
 		 324 aa  354  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0072  quinone oxidoreductase  56.13 
 
 		 325 aa  352  5e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.899686  hitchhiker  0.0000690857 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  56.13 
 
 		 322 aa  352  5e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0021  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  55.52 
 
 		 325 aa  351  8.999999999999999e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00189953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0088  alcohol dehydrogenase  55.83 
 
 		 325 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00210  NADH-quinone oxidoreductase  57.06 
 
 		 325 aa  346  3e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336084  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1644  alcohol dehydrogenase  55.21 
 
 		 325 aa  346  3e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3109  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.75 
 
 		 322 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3210  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.75 
 
 		 322 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3620  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  54.43 
 
 		 324 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1715  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.21 
 
 		 326 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1694  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.76 
 
 		 325 aa  334  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0377622  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1582  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.63 
 
 		 324 aa  329  4e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.45945  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0023  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  53.07 
 
 		 325 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.07 
 
 		 326 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.317199  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4840  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.62 
 
 		 326 aa  327  3e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0102128  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0059  alcohol dehydrogenase  55.52 
 
 		 325 aa  325  5e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4587  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  51.84 
 
 		 327 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4588  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  51.84 
 
 		 327 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4493  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  51.84 
 
 		 327 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966191  normal  0.0601641 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5285  NADPH-dependent quinone oxidoreductase  50.77 
 
 		 326 aa  323  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3497  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  51.52 
 
 		 327 aa  323  3e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1585  alcohol dehydrogenase  52.31 
 
 		 326 aa  322  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4502  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  51.84 
 
 		 327 aa  322  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1170  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.5 
 
 		 331 aa  322  6e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.636549 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3635  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  52.44 
 
 		 328 aa  322  7e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0710  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  52.13 
 
 		 331 aa  321  9.999999999999999e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.384403  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3942  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.69 
 
 		 327 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0173  quinone oxidoreductase  51.84 
 
 		 325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3872  alcohol dehydrogenase  53.21 
 
 		 324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4291  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  49.39 
 
 		 327 aa  320  3e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4639  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  51.23 
 
 		 327 aa  319  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0687735 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5553  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  49.39 
 
 		 327 aa  320  3e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4603  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  49.39 
 
 		 327 aa  320  3e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7175  alcohol dehydrogenase  50.31 
 
 		 327 aa  319  5e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03923  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  49.39 
 
 		 327 aa  318  6e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03883  hypothetical protein  49.39 
 
 		 327 aa  318  6e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.82301  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4450  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  51.83 
 
 		 329 aa  318  6e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.553295 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3977  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  49.39 
 
 		 327 aa  318  6e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.250547 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3099  putative quinone oxidoreductase  51.08 
 
 		 327 aa  318  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2042  quinone oxidoreductase  51.08 
 
 		 327 aa  318  7e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282793  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1065  quinone oxidoreductase  51.08 
 
 		 327 aa  318  7e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1439  quinone oxidoreductase  51.08 
 
 		 327 aa  318  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1350  quinone oxidoreductase  51.08 
 
 		 327 aa  318  7e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2332  quinone oxidoreductase  51.08 
 
 		 327 aa  318  7e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4544  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  49.08 
 
 		 327 aa  317  1e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4512  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  49.08 
 
 		 327 aa  317  1e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2820  alcohol dehydrogenase  50.61 
 
 		 326 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.516166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>