More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3232 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3232  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 331 aa  677    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3853  zinc-binding alcohol dehydrogenase  86.11 
 
 		 344 aa  578  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1429  zinc-binding alcohol dehydrogenase  79.76 
 
 		 331 aa  559  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  79.94 
 
 		 328 aa  549  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1258  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  79.27 
 
 		 328 aa  548  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.292182  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3468  alcohol dehydrogenase  79.14 
 
 		 328 aa  534  1e-151  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2235  alcohol dehydrogenase  75.83 
 
 		 330 aa  521  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1228  alcohol dehydrogenase  76.38 
 
 		 327 aa  518  1e-146  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5388  alcohol dehydrogenase  75.78 
 
 		 326 aa  494  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3049  quinone oxidoreductase, putative  71.12 
 
 		 331 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.658374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0482  zinc-binding alcohol dehydrogenase  69.16 
 
 		 322 aa  441  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2184  NADPH:quinone reductase, zeta-crystallin homolog oxidoreductase protein  64.53 
 
 		 324 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  62.69 
 
 		 327 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  61.47 
 
 		 326 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.86 
 
 		 326 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5617  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  58.82 
 
 		 324 aa  381  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0414164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1019  quinone oxidoreductase  58.2 
 
 		 324 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.527544  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0363  quinone oxidoreductase  57.28 
 
 		 324 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1879  quinone oxidoreductase  57.28 
 
 		 324 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0458768  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1245  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  57.28 
 
 		 324 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1391  quinone oxidoreductase  57.28 
 
 		 324 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0787  quinone oxidoreductase  57.28 
 
 		 324 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399125  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  59.75 
 
 		 322 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1191  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.41 
 
 		 323 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1238  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  57.28 
 
 		 324 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1080  quinone oxidoreductase  57.28 
 
 		 324 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169344  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2060  alcohol dehydrogenase  56.48 
 
 		 324 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal  0.174232 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0988  alcohol dehydrogenase  57.28 
 
 		 324 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1264  alcohol dehydrogenase  58.46 
 
 		 327 aa  373  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3255  putative NADPH-quinone reductase  56.04 
 
 		 324 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2472  alcohol dehydrogenase  58.28 
 
 		 325 aa  372  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2313  alcohol dehydrogenase  57.28 
 
 		 324 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.730105 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1678  zinc-binding alcohol dehydrogenase  57.28 
 
 		 324 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.05574  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2290  alcohol dehydrogenase  57.28 
 
 		 324 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1305  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.86 
 
 		 324 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263394  normal  0.0862174 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  58.28 
 
 		 324 aa  365  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2206  alcohol dehydrogenase  56.97 
 
 		 324 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889298  normal  0.771237 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2328  alcohol dehydrogenase  56.97 
 
 		 324 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2985  alcohol dehydrogenase  56.97 
 
 		 323 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3210  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  59.75 
 
 		 322 aa  362  6e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3109  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  59.44 
 
 		 322 aa  361  8e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2969  alcohol dehydrogenase  55.56 
 
 		 324 aa  360  2e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0088  alcohol dehydrogenase  56.62 
 
 		 325 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0088  alcohol dehydrogenase  56.62 
 
 		 325 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000155478 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0021  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  56.62 
 
 		 325 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00189953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  54.74 
 
 		 325 aa  355  3.9999999999999996e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0072  quinone oxidoreductase  56.31 
 
 		 325 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.899686  hitchhiker  0.0000690857 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0091  alcohol dehydrogenase  56.31 
 
 		 325 aa  354  8.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.547437  hitchhiker  0.0000221127 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1508  zinc-binding alcohol dehydrogenase  55.69 
 
 		 325 aa  354  1e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.79 
 
 		 324 aa  354  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1694  zinc-binding alcohol dehydrogenase  56.04 
 
 		 325 aa  354  1e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0377622  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  54.63 
 
 		 324 aa  353  2e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0024  quinone oxidoreductase  56.62 
 
 		 325 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.523604  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.23 
 
 		 323 aa  352  4e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.23 
 
 		 323 aa  351  8.999999999999999e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  56.92 
 
 		 323 aa  350  1e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4840  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  53.66 
 
 		 326 aa  348  9e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0102128  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00250  quinone oxidoreductase  55.69 
 
 		 325 aa  346  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.798779 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2009  alcohol dehydrogenase  55.56 
 
 		 323 aa  346  3e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.792874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3620  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  53.54 
 
 		 324 aa  345  6e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1585  alcohol dehydrogenase  52.74 
 
 		 326 aa  344  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5834  quinone oxidoreductase (NADPH  55.52 
 
 		 324 aa  343  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487323  normal  0.847734 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1419  alcohol dehydrogenase  55.83 
 
 		 325 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173478  normal  0.0573079 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00210  NADH-quinone oxidoreductase  54.46 
 
 		 325 aa  341  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336084  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1604  alcohol dehydrogenase  52.13 
 
 		 326 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.300093 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  55.35 
 
 		 324 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2677  alcohol dehydrogenase  51.83 
 
 		 326 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2820  alcohol dehydrogenase  51.83 
 
 		 326 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.516166 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1170  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.07 
 
 		 331 aa  335  3.9999999999999995e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.636549 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.94 
 
 		 323 aa  335  7e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4587  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  55.35 
 
 		 327 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4493  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  55.35 
 
 		 327 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966191  normal  0.0601641 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.3 
 
 		 326 aa  333  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4588  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  55.35 
 
 		 327 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5020  alcohol dehydrogenase  54.66 
 
 		 321 aa  332  6e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00109136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0023  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  53.85 
 
 		 325 aa  331  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4502  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  55.05 
 
 		 327 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2173  alcohol dehydrogenase  52.27 
 
 		 330 aa  330  2e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.133443 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7175  alcohol dehydrogenase  50.77 
 
 		 327 aa  330  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4639  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  55.05 
 
 		 327 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0687735 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1582  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.09 
 
 		 324 aa  329  4e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.45945  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2042  quinone oxidoreductase  51.23 
 
 		 327 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282793  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1439  quinone oxidoreductase  51.23 
 
 		 327 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2332  quinone oxidoreductase  51.23 
 
 		 327 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1350  quinone oxidoreductase  51.23 
 
 		 327 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3099  putative quinone oxidoreductase  51.23 
 
 		 327 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1065  quinone oxidoreductase  51.23 
 
 		 327 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3497  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  52.29 
 
 		 327 aa  328  9e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3840  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.23 
 
 		 323 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.38359  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5285  NADPH-dependent quinone oxidoreductase  50.61 
 
 		 326 aa  326  3e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3635  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  52.6 
 
 		 328 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3942  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.5 
 
 		 327 aa  325  5e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1596  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.61 
 
 		 326 aa  325  8.000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0710  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  52.29 
 
 		 331 aa  325  8.000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.384403  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5553  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  53.19 
 
 		 327 aa  325  9e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4291  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  53.19 
 
 		 327 aa  325  9e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4603  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  53.19 
 
 		 327 aa  325  9e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4544  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  52.45 
 
 		 327 aa  324  1e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03923  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  53.19 
 
 		 327 aa  324  2e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3977  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  53.19 
 
 		 327 aa  324  2e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.250547 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>