More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2173 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2173  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 330 aa  664    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.133443 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2009  alcohol dehydrogenase  80.61 
 
 		 323 aa  529  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.792874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3840  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  76.36 
 
 		 323 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.38359  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4628  NADPH-dependent quinone oxidoreductase  75.76 
 
 		 412 aa  514  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2184  NADPH:quinone reductase, zeta-crystallin homolog oxidoreductase protein  55.29 
 
 		 324 aa  365  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  54.68 
 
 		 327 aa  363  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  57.1 
 
 		 323 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.55 
 
 		 326 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.64 
 
 		 326 aa  355  5e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2472  alcohol dehydrogenase  56.19 
 
 		 325 aa  354  1e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4840  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  56.63 
 
 		 326 aa  353  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0102128  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7175  alcohol dehydrogenase  55.76 
 
 		 327 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5834  quinone oxidoreductase (NADPH  56.67 
 
 		 324 aa  350  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487323  normal  0.847734 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1596  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  53.92 
 
 		 326 aa  347  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  53.31 
 
 		 326 aa  347  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1264  alcohol dehydrogenase  54.24 
 
 		 327 aa  344  1e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5617  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.96 
 
 		 324 aa  343  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0414164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2985  alcohol dehydrogenase  54.98 
 
 		 323 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2820  alcohol dehydrogenase  53.61 
 
 		 326 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.516166 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.61 
 
 		 326 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1585  alcohol dehydrogenase  54.82 
 
 		 326 aa  342  7e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  53.78 
 
 		 324 aa  341  1e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3255  putative NADPH-quinone reductase  51.66 
 
 		 324 aa  341  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.41 
 
 		 322 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1065  quinone oxidoreductase  53.94 
 
 		 327 aa  338  5e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3099  putative quinone oxidoreductase  53.94 
 
 		 327 aa  338  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2042  quinone oxidoreductase  53.94 
 
 		 327 aa  338  5e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282793  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2677  alcohol dehydrogenase  53.31 
 
 		 326 aa  338  5e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5285  NADPH-dependent quinone oxidoreductase  52.87 
 
 		 326 aa  338  5e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1350  quinone oxidoreductase  53.94 
 
 		 327 aa  338  5e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2332  quinone oxidoreductase  53.94 
 
 		 327 aa  338  5e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1439  quinone oxidoreductase  53.94 
 
 		 327 aa  338  7e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2969  alcohol dehydrogenase  52.57 
 
 		 324 aa  338  7e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2206  alcohol dehydrogenase  52.57 
 
 		 324 aa  338  9e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889298  normal  0.771237 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2060  alcohol dehydrogenase  52.27 
 
 		 324 aa  338  9e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal  0.174232 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2328  alcohol dehydrogenase  52.57 
 
 		 324 aa  338  9e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1604  alcohol dehydrogenase  54.22 
 
 		 326 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.300093 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1305  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.36 
 
 		 324 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263394  normal  0.0862174 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00250  quinone oxidoreductase  52.71 
 
 		 325 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.798779 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0021  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.71 
 
 		 325 aa  332  4e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00189953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3620  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.27 
 
 		 324 aa  332  5e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0024  quinone oxidoreductase  52.41 
 
 		 325 aa  332  6e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.523604  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3232  alcohol dehydrogenase  52.27 
 
 		 331 aa  330  2e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3210  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.1 
 
 		 322 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1391  quinone oxidoreductase  50.15 
 
 		 324 aa  329  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1238  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  50.15 
 
 		 324 aa  329  3e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0988  alcohol dehydrogenase  49.85 
 
 		 324 aa  329  4e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3109  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.8 
 
 		 322 aa  328  9e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1019  quinone oxidoreductase  49.85 
 
 		 324 aa  328  9e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.527544  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1080  quinone oxidoreductase  49.85 
 
 		 324 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169344  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0363  quinone oxidoreductase  49.85 
 
 		 324 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1879  quinone oxidoreductase  49.85 
 
 		 324 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0458768  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0787  quinone oxidoreductase  49.85 
 
 		 324 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399125  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1245  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  49.85 
 
 		 324 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1508  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.81 
 
 		 325 aa  325  5e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2313  alcohol dehydrogenase  50.76 
 
 		 324 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.730105 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1678  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.76 
 
 		 324 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.05574  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2290  alcohol dehydrogenase  50.76 
 
 		 324 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1170  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.64 
 
 		 331 aa  322  4e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.636549 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3853  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50 
 
 		 344 aa  322  6e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1191  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.76 
 
 		 323 aa  319  5e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1582  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.2 
 
 		 324 aa  318  6e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.45945  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0088  alcohol dehydrogenase  51.51 
 
 		 325 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000155478 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  49.4 
 
 		 324 aa  317  2e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1228  alcohol dehydrogenase  49.1 
 
 		 327 aa  317  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0088  alcohol dehydrogenase  51.2 
 
 		 325 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0072  quinone oxidoreductase  51.2 
 
 		 325 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.899686  hitchhiker  0.0000690857 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  49.7 
 
 		 325 aa  316  3e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1258  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.2 
 
 		 328 aa  316  4e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.292182  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0091  alcohol dehydrogenase  51.2 
 
 		 325 aa  315  6e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.547437  hitchhiker  0.0000221127 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1644  alcohol dehydrogenase  49.1 
 
 		 325 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1429  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.55 
 
 		 331 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0173  quinone oxidoreductase  50.9 
 
 		 325 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00210  NADH-quinone oxidoreductase  51.81 
 
 		 325 aa  311  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336084  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0023  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.6 
 
 		 325 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.89 
 
 		 328 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1942  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.9 
 
 		 323 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2235  alcohol dehydrogenase  47.59 
 
 		 330 aa  306  3e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.61 
 
 		 323 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.3 
 
 		 324 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3049  quinone oxidoreductase, putative  46.99 
 
 		 331 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.658374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3468  alcohol dehydrogenase  47.89 
 
 		 328 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  50.3 
 
 		 323 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.7 
 
 		 323 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5388  alcohol dehydrogenase  48.8 
 
 		 326 aa  302  6.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0059  alcohol dehydrogenase  51.2 
 
 		 325 aa  299  5e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3872  alcohol dehydrogenase  48.49 
 
 		 324 aa  299  5e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2478  alcohol dehydrogenase  56.19 
 
 		 325 aa  296  3e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00177585  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1694  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.55 
 
 		 325 aa  296  3e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0377622  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2194  alcohol dehydrogenase  48.48 
 
 		 329 aa  295  5e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3635  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  48.8 
 
 		 328 aa  294  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0553  alcohol dehydrogenase  50.61 
 
 		 325 aa  294  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0307226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  49.7 
 
 		 324 aa  293  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1614  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  59.27 
 
 		 260 aa  293  4e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3497  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  48.8 
 
 		 327 aa  292  7e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1419  alcohol dehydrogenase  47.15 
 
 		 325 aa  288  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173478  normal  0.0573079 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0197  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.81 
 
 		 327 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0482  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.06 
 
 		 322 aa  284  1.0000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3840  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.04 
 
 		 323 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00789848 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2619  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.48 
 
 		 324 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869285  normal  0.466568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>