More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1170 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1170  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
331 aa  668    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.636549 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0553  alcohol dehydrogenase  74.38 
 
 
325 aa  485  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0307226  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2472  alcohol dehydrogenase  65.53 
 
 
325 aa  412  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5834  quinone oxidoreductase (NADPH  61.11 
 
 
324 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487323  normal  0.847734 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  62.93 
 
 
324 aa  385  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2985  alcohol dehydrogenase  62.11 
 
 
323 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  59.63 
 
 
325 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  59.32 
 
 
324 aa  376  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  61.06 
 
 
322 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2184  NADPH:quinone reductase, zeta-crystallin homolog oxidoreductase protein  59.44 
 
 
324 aa  368  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200214  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  59.13 
 
 
326 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1694  zinc-binding alcohol dehydrogenase  59.94 
 
 
325 aa  365  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0377622  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.2 
 
 
326 aa  364  1e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722017  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1582  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.51 
 
 
324 aa  361  8e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.45945  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2478  alcohol dehydrogenase  66.98 
 
 
325 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00177585  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1191  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.04 
 
 
323 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2194  alcohol dehydrogenase  56.21 
 
 
329 aa  354  8.999999999999999e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  56.97 
 
 
327 aa  354  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3109  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.12 
 
 
322 aa  354  1e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.83 
 
 
324 aa  353  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1019  quinone oxidoreductase  54.66 
 
 
324 aa  351  8e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.527544  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2060  alcohol dehydrogenase  55.42 
 
 
324 aa  351  8e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal  0.174232 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1644  alcohol dehydrogenase  55.59 
 
 
325 aa  350  1e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0988  alcohol dehydrogenase  54.04 
 
 
324 aa  350  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1238  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  54.04 
 
 
324 aa  349  3e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1391  quinone oxidoreductase  54.04 
 
 
324 aa  349  4e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1508  zinc-binding alcohol dehydrogenase  56.66 
 
 
325 aa  349  4e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0363  quinone oxidoreductase  54.04 
 
 
324 aa  349  5e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1879  quinone oxidoreductase  54.04 
 
 
324 aa  349  5e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0458768  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1080  quinone oxidoreductase  54.04 
 
 
324 aa  349  5e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169344  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0787  quinone oxidoreductase  54.04 
 
 
324 aa  349  5e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399125  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1245  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  54.04 
 
 
324 aa  349  5e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3872  alcohol dehydrogenase  56.7 
 
 
324 aa  348  8e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  57.14 
 
 
324 aa  348  8e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1305  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.42 
 
 
324 aa  347  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263394  normal  0.0862174 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3210  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  59.19 
 
 
322 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5617  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  54.35 
 
 
324 aa  348  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0414164  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3255  putative NADPH-quinone reductase  55.28 
 
 
324 aa  346  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2206  alcohol dehydrogenase  55.59 
 
 
324 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889298  normal  0.771237 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  55.76 
 
 
323 aa  343  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2328  alcohol dehydrogenase  55.59 
 
 
324 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1419  alcohol dehydrogenase  56.17 
 
 
325 aa  342  2.9999999999999997e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173478  normal  0.0573079 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3620  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  55.73 
 
 
324 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.07 
 
 
323 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2820  alcohol dehydrogenase  54.91 
 
 
326 aa  342  5e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.516166 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3468  alcohol dehydrogenase  55.38 
 
 
328 aa  342  5e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7175  alcohol dehydrogenase  55.42 
 
 
327 aa  342  7e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2313  alcohol dehydrogenase  54.97 
 
 
324 aa  341  8e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.730105 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  55.76 
 
 
323 aa  341  9e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1678  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.97 
 
 
324 aa  341  9e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.05574  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2290  alcohol dehydrogenase  54.97 
 
 
324 aa  341  9e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.14 
 
 
323 aa  341  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2677  alcohol dehydrogenase  54.6 
 
 
326 aa  340  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2009  alcohol dehydrogenase  56.97 
 
 
323 aa  339  2.9999999999999998e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.792874  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  54.29 
 
 
326 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.11 
 
 
328 aa  339  4e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3853  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.32 
 
 
344 aa  337  9.999999999999999e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2969  alcohol dehydrogenase  52.63 
 
 
324 aa  337  9.999999999999999e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1264  alcohol dehydrogenase  54.18 
 
 
327 aa  337  1.9999999999999998e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4840  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  56.84 
 
 
326 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0102128  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3028  alcohol dehydrogenase  55.11 
 
 
324 aa  336  2.9999999999999997e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.915706  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  57.45 
 
 
322 aa  336  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2235  alcohol dehydrogenase  53.85 
 
 
330 aa  336  3.9999999999999995e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3232  alcohol dehydrogenase  53.07 
 
 
331 aa  335  3.9999999999999995e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0091  alcohol dehydrogenase  53.56 
 
 
325 aa  335  5e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.547437  hitchhiker  0.0000221127 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1715  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.56 
 
 
326 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.37 
 
 
326 aa  334  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0072  quinone oxidoreductase  52.94 
 
 
325 aa  331  8e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.899686  hitchhiker  0.0000690857 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1228  alcohol dehydrogenase  53.23 
 
 
327 aa  331  1e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0088  alcohol dehydrogenase  52.94 
 
 
325 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0088  alcohol dehydrogenase  52.63 
 
 
325 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000155478 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5020  alcohol dehydrogenase  55.14 
 
 
321 aa  328  9e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00109136  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1942  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.97 
 
 
323 aa  327  1.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00210  NADH-quinone oxidoreductase  55.11 
 
 
325 aa  328  1.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336084  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2075  alcohol dehydrogenase  57.45 
 
 
322 aa  327  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4628  NADPH-dependent quinone oxidoreductase  52.94 
 
 
412 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5388  alcohol dehydrogenase  54.32 
 
 
326 aa  326  3e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1585  alcohol dehydrogenase  55.32 
 
 
326 aa  326  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1439  quinone oxidoreductase  53.7 
 
 
327 aa  325  7e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3099  putative quinone oxidoreductase  53.7 
 
 
327 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2042  quinone oxidoreductase  53.7 
 
 
327 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282793  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1065  quinone oxidoreductase  53.7 
 
 
327 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1350  quinone oxidoreductase  53.7 
 
 
327 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2332  quinone oxidoreductase  53.7 
 
 
327 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0021  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.01 
 
 
325 aa  323  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00189953  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.39 
 
 
326 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.317199  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2173  alcohol dehydrogenase  53.64 
 
 
330 aa  322  4e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.133443 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00250  quinone oxidoreductase  52.01 
 
 
325 aa  322  5e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.798779 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3840  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.39 
 
 
323 aa  322  6e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.38359  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3049  quinone oxidoreductase, putative  53.5 
 
 
331 aa  322  6e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.658374  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1258  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.08 
 
 
328 aa  322  8e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.292182  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0024  quinone oxidoreductase  51.7 
 
 
325 aa  322  8e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.523604  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1596  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.45 
 
 
326 aa  321  9.000000000000001e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1604  alcohol dehydrogenase  54.71 
 
 
326 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.300093 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3840  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.97 
 
 
323 aa  319  3e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00789848 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1429  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.06 
 
 
331 aa  319  3e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0023  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.08 
 
 
325 aa  316  3e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2619  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.55 
 
 
324 aa  316  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869285  normal  0.466568 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3381  NAD(P)H -dependent quinone oxidoreductase  54.01 
 
 
324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.41624  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2228  putative quinone oxidoreductase  53.42 
 
 
322 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.806393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>