More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3872 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3872  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 324 aa  660    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  64.81 
 
 		 324 aa  431  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  63.89 
 
 		 324 aa  424  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  62.85 
 
 		 323 aa  419  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  63.16 
 
 		 323 aa  421  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  62.85 
 
 		 323 aa  419  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  63.27 
 
 		 325 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2949  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  61.42 
 
 		 324 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2619  zinc-binding alcohol dehydrogenase  60.8 
 
 		 324 aa  411  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869285  normal  0.466568 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  62.35 
 
 		 324 aa  409  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2841  alcohol dehydrogenase  60.8 
 
 		 324 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2632  zinc-binding alcohol dehydrogenase  60.8 
 
 		 324 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40031  decreased coverage  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2044  zinc-binding alcohol dehydrogenase  60.8 
 
 		 324 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1715  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  61.8 
 
 		 326 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  61.18 
 
 		 326 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.317199  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1419  alcohol dehydrogenase  62.77 
 
 		 325 aa  400  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173478  normal  0.0573079 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  63.69 
 
 		 324 aa  397  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1504  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  58.95 
 
 		 324 aa  394  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0905187 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3028  alcohol dehydrogenase  61.42 
 
 		 324 aa  391  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.915706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4146  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  59.55 
 
 		 315 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.768272  normal  0.178855 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1644  alcohol dehydrogenase  59.38 
 
 		 325 aa  385  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5834  quinone oxidoreductase (NADPH  61.42 
 
 		 324 aa  378  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487323  normal  0.847734 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2472  alcohol dehydrogenase  59.75 
 
 		 325 aa  379  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2184  NADPH:quinone reductase, zeta-crystallin homolog oxidoreductase protein  59.38 
 
 		 324 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  59.94 
 
 		 326 aa  374  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  59.63 
 
 		 326 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  55.56 
 
 		 323 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3255  putative NADPH-quinone reductase  56.31 
 
 		 324 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2985  alcohol dehydrogenase  57.72 
 
 		 323 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2060  alcohol dehydrogenase  58.15 
 
 		 324 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal  0.174232 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1694  zinc-binding alcohol dehydrogenase  58.46 
 
 		 325 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0377622  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1191  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.17 
 
 		 323 aa  364  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1305  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56 
 
 		 324 aa  364  1e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263394  normal  0.0862174 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  58.46 
 
 		 327 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3840  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.02 
 
 		 323 aa  358  6e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00789848 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1019  quinone oxidoreductase  56.31 
 
 		 324 aa  352  4e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.527544  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1080  quinone oxidoreductase  55.69 
 
 		 324 aa  352  5e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169344  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1879  quinone oxidoreductase  55.69 
 
 		 324 aa  352  5e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0458768  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1245  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  55.69 
 
 		 324 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0363  quinone oxidoreductase  55.69 
 
 		 324 aa  352  5e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0787  quinone oxidoreductase  55.69 
 
 		 324 aa  352  5e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399125  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1238  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  55.69 
 
 		 324 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1391  quinone oxidoreductase  55.69 
 
 		 324 aa  352  7e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5617  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  56.92 
 
 		 324 aa  350  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0414164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2206  alcohol dehydrogenase  58.15 
 
 		 324 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889298  normal  0.771237 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2328  alcohol dehydrogenase  58.15 
 
 		 324 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3620  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  56.31 
 
 		 324 aa  348  7e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1170  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.7 
 
 		 331 aa  348  8e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.636549 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0988  alcohol dehydrogenase  56.31 
 
 		 324 aa  346  3e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1582  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.38 
 
 		 324 aa  344  1e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.45945  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  55.42 
 
 		 322 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1264  alcohol dehydrogenase  55.38 
 
 		 327 aa  340  2.9999999999999998e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1678  zinc-binding alcohol dehydrogenase  56.62 
 
 		 324 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.05574  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2290  alcohol dehydrogenase  56.62 
 
 		 324 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1942  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.62 
 
 		 323 aa  337  9.999999999999999e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2313  alcohol dehydrogenase  56.62 
 
 		 324 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.730105 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3109  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.73 
 
 		 322 aa  335  9e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3210  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.73 
 
 		 322 aa  334  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1228  alcohol dehydrogenase  54.6 
 
 		 327 aa  332  4e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7175  alcohol dehydrogenase  54.32 
 
 		 327 aa  332  5e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1508  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.54 
 
 		 325 aa  332  6e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1258  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.91 
 
 		 328 aa  331  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.292182  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0091  alcohol dehydrogenase  52.92 
 
 		 325 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.547437  hitchhiker  0.0000221127 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3468  alcohol dehydrogenase  55.52 
 
 		 328 aa  330  3e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4840  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  53.37 
 
 		 326 aa  328  8e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0102128  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.91 
 
 		 328 aa  328  8e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2194  alcohol dehydrogenase  52.63 
 
 		 329 aa  327  1.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0088  alcohol dehydrogenase  52.92 
 
 		 325 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000155478 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1585  alcohol dehydrogenase  53.07 
 
 		 326 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0072  quinone oxidoreductase  52.62 
 
 		 325 aa  326  3e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.899686  hitchhiker  0.0000690857 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0021  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.31 
 
 		 325 aa  326  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00189953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0088  alcohol dehydrogenase  52.62 
 
 		 325 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1604  alcohol dehydrogenase  53.07 
 
 		 326 aa  325  7e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.300093 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2478  alcohol dehydrogenase  59.32 
 
 		 325 aa  325  7e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00177585  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0024  quinone oxidoreductase  52.62 
 
 		 325 aa  325  9e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.523604  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4544  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  51.67 
 
 		 327 aa  324  1e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4512  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  51.98 
 
 		 327 aa  323  2e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0023  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.31 
 
 		 325 aa  323  3e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3942  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.98 
 
 		 327 aa  322  4e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00250  quinone oxidoreductase  51.38 
 
 		 325 aa  322  4e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.798779 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2969  alcohol dehydrogenase  51.08 
 
 		 324 aa  322  7e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4603  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  51.67 
 
 		 327 aa  321  9.000000000000001e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4291  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  51.67 
 
 		 327 aa  321  9.000000000000001e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5553  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  51.67 
 
 		 327 aa  321  9.000000000000001e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03923  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  51.67 
 
 		 327 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03883  hypothetical protein  51.67 
 
 		 327 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.82301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3977  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  51.67 
 
 		 327 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.250547 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3049  quinone oxidoreductase, putative  53.21 
 
 		 331 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.658374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4588  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  52.58 
 
 		 327 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4493  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  52.58 
 
 		 327 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966191  normal  0.0601641 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4587  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  52.58 
 
 		 327 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4502  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  52.58 
 
 		 327 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1429  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.7 
 
 		 331 aa  319  5e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2332  quinone oxidoreductase  51.54 
 
 		 327 aa  318  9e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2042  quinone oxidoreductase  51.54 
 
 		 327 aa  318  9e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282793  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3099  putative quinone oxidoreductase  51.54 
 
 		 327 aa  318  9e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1439  quinone oxidoreductase  51.54 
 
 		 327 aa  318  9e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1350  quinone oxidoreductase  51.54 
 
 		 327 aa  318  9e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1065  quinone oxidoreductase  51.54 
 
 		 327 aa  318  9e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3853  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.45 
 
 		 344 aa  317  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>