More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1526 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1526  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
326 aa  654    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0197  zinc-binding alcohol dehydrogenase  66.46 
 
 
327 aa  443  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0245  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  64.11 
 
 
326 aa  430  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.77 
 
 
326 aa  324  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.77 
 
 
326 aa  322  7e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722017  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2184  NADPH:quinone reductase, zeta-crystallin homolog oxidoreductase protein  50 
 
 
324 aa  318  7.999999999999999e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200214  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.62 
 
 
322 aa  311  9e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1019  quinone oxidoreductase  49.07 
 
 
324 aa  311  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.527544  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2328  alcohol dehydrogenase  49.38 
 
 
324 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2206  alcohol dehydrogenase  49.38 
 
 
324 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889298  normal  0.771237 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0363  quinone oxidoreductase  48.45 
 
 
324 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1245  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  48.45 
 
 
324 aa  309  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1879  quinone oxidoreductase  48.45 
 
 
324 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0458768  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5617  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.45 
 
 
324 aa  309  5e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0414164  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1080  quinone oxidoreductase  48.45 
 
 
324 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169344  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0787  quinone oxidoreductase  48.45 
 
 
324 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399125  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1238  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  48.45 
 
 
324 aa  309  5e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1582  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.08 
 
 
324 aa  308  5.9999999999999995e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.45945  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1305  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.47 
 
 
324 aa  308  8e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263394  normal  0.0862174 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2985  alcohol dehydrogenase  50 
 
 
323 aa  308  8e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.5 
 
 
324 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1391  quinone oxidoreductase  48.14 
 
 
324 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0988  alcohol dehydrogenase  47.83 
 
 
324 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3255  putative NADPH-quinone reductase  47.52 
 
 
324 aa  306  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5834  quinone oxidoreductase (NADPH  48.31 
 
 
324 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487323  normal  0.847734 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2313  alcohol dehydrogenase  48.14 
 
 
324 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.730105 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1678  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.14 
 
 
324 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.05574  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2290  alcohol dehydrogenase  48.14 
 
 
324 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1264  alcohol dehydrogenase  48.32 
 
 
327 aa  303  3.0000000000000004e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.67 
 
 
323 aa  302  6.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3109  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.24 
 
 
322 aa  301  7.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2472  alcohol dehydrogenase  47.65 
 
 
325 aa  300  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1694  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.38 
 
 
325 aa  300  3e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0377622  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2194  alcohol dehydrogenase  48.14 
 
 
329 aa  298  8e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3210  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.31 
 
 
322 aa  296  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.01 
 
 
327 aa  295  5e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5020  alcohol dehydrogenase  49.68 
 
 
321 aa  294  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00109136  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1419  alcohol dehydrogenase  49.7 
 
 
325 aa  288  8e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173478  normal  0.0573079 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00210  NADH-quinone oxidoreductase  46.91 
 
 
325 aa  288  8e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336084  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2060  alcohol dehydrogenase  46.32 
 
 
324 aa  288  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal  0.174232 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0482  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.34 
 
 
322 aa  287  2e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.48 
 
 
326 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.317199  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3620  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.2 
 
 
324 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1228  alcohol dehydrogenase  44.89 
 
 
327 aa  282  4.0000000000000003e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1191  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.79 
 
 
323 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1508  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.06 
 
 
325 aa  282  6.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3497  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  46.93 
 
 
327 aa  281  8.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3232  alcohol dehydrogenase  44.75 
 
 
331 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1170  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.89 
 
 
331 aa  280  3e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.636549 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1258  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.95 
 
 
328 aa  279  5e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.292182  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1429  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.06 
 
 
331 aa  279  6e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3853  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.79 
 
 
344 aa  278  6e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3840  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.2 
 
 
323 aa  278  9e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.38359  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1715  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.95 
 
 
326 aa  277  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1171  alcohol dehydrogenase  48.14 
 
 
325 aa  278  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3635  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  47.24 
 
 
328 aa  277  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0553  alcohol dehydrogenase  45.23 
 
 
325 aa  276  3e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0307226  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.13 
 
 
323 aa  276  3e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0281  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.72 
 
 
320 aa  276  4e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  45.82 
 
 
323 aa  275  6e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0710  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  46.32 
 
 
331 aa  275  6e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.384403  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0088  alcohol dehydrogenase  46.3 
 
 
325 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0072  quinone oxidoreductase  45.99 
 
 
325 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.899686  hitchhiker  0.0000690857 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.13 
 
 
323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2969  alcohol dehydrogenase  44.17 
 
 
324 aa  273  2.0000000000000002e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0088  alcohol dehydrogenase  45.68 
 
 
325 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000155478 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  44.55 
 
 
325 aa  273  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16020  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  45.94 
 
 
323 aa  273  4.0000000000000004e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.24 
 
 
328 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4493  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  46.44 
 
 
327 aa  271  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966191  normal  0.0601641 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4588  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  46.44 
 
 
327 aa  271  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3381  NAD(P)H -dependent quinone oxidoreductase  46.48 
 
 
324 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.41624  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4502  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  46.44 
 
 
327 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4587  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  46.44 
 
 
327 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  43.61 
 
 
324 aa  270  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2374  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.46 
 
 
327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.220346  normal  0.0293571 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0091  alcohol dehydrogenase  45.37 
 
 
325 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.547437  hitchhiker  0.0000221127 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2619  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.48 
 
 
324 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869285  normal  0.466568 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3766  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  44.48 
 
 
327 aa  268  7e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252302  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.59 
 
 
326 aa  268  8e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3856  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  44.48 
 
 
327 aa  268  8e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.323591  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.96 
 
 
324 aa  268  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4639  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  46.13 
 
 
327 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0687735 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0023  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.75 
 
 
325 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3027  alcohol dehydrogenase  45.87 
 
 
324 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00250  quinone oxidoreductase  43.52 
 
 
325 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.798779 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3049  quinone oxidoreductase, putative  44.92 
 
 
331 aa  267  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.658374  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0742  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  43.87 
 
 
329 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2235  alcohol dehydrogenase  43.83 
 
 
330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0024  quinone oxidoreductase  42.9 
 
 
325 aa  266  4e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.523604  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2009  alcohol dehydrogenase  43.65 
 
 
323 aa  265  5.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.792874  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03923  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  44.27 
 
 
327 aa  265  7e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3977  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  44.27 
 
 
327 aa  265  7e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.250547 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4291  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  44.27 
 
 
327 aa  265  7e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4603  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  44.27 
 
 
327 aa  265  7e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03883  hypothetical protein  44.27 
 
 
327 aa  265  7e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.82301  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5553  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  44.27 
 
 
327 aa  265  7e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0173  quinone oxidoreductase  45.06 
 
 
325 aa  264  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3468  alcohol dehydrogenase  43.61 
 
 
328 aa  265  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  44.27 
 
 
324 aa  264  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.603844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>