91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4475 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4475  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  176  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0614  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  56.67 
 
 		 1192 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23102  normal  0.0754144 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3058  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  71.43 
 
 		 1186 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3404  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  71.43 
 
 		 1186 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.206318 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3122  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  71.43 
 
 		 1187 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0361  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  64.44 
 
 		 1199 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3233  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  64.44 
 
 		 1197 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.610198  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5840  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  48.39 
 
 		 1186 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3396  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  65.85 
 
 		 1197 aa  61.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0285  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  50 
 
 		 1199 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.360471 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4646  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  52.54 
 
 		 1191 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2868  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  50 
 
 		 1200 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387665 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3673  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  50 
 
 		 1199 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000976123 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0319  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  52.73 
 
 		 1196 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3122  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  52.73 
 
 		 1193 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2787  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  52.73 
 
 		 1196 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0001  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  52.73 
 
 		 1193 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.572311  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0238  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  52.73 
 
 		 1196 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3502  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  52.54 
 
 		 1186 aa  59.7  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1972  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  52.73 
 
 		 1193 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3786  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  52.73 
 
 		 1193 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.509571  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3108  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  52.73 
 
 		 1193 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3847  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  52.73 
 
 		 1193 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3525  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  52.73 
 
 		 1193 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.651962  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3418  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  52.73 
 
 		 1196 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0018  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  52.73 
 
 		 1193 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5543  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  63.41 
 
 		 1195 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00134881  normal  0.730812 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0246  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  52.73 
 
 		 1196 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237135 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0221  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  52.73 
 
 		 1196 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.530099  hitchhiker  0.000000183549 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2584  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  52.73 
 
 		 1193 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0299  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  52.73 
 
 		 1196 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000479441 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0390  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.54 
 
 		 1159 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0840  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  50.85 
 
 		 1193 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5121  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.46 
 
 		 1202 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.825958  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3905  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  51.72 
 
 		 1185 aa  57.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4090  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  60 
 
 		 1204 aa  57.4  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3358  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.15 
 
 		 1227 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1036  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  61.9 
 
 		 1198 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.37446  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4008  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.15 
 
 		 1206 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7701 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5013  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.46 
 
 		 1163 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353185 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0267  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  63.16 
 
 		 1150 aa  55.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3801  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  46.88 
 
 		 1192 aa  55.1  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737264  normal  0.93636 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4647  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.46 
 
 		 1187 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3887  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.46 
 
 		 1206 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.398161  normal  0.512264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3354  Indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  42.62 
 
 		 1155 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0073722 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2178  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.46 
 
 		 1164 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3868  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  51.11 
 
 		 1218 aa  53.9  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6355  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  54.76 
 
 		 1214 aa  52.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3155  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase family protein  52.17 
 
 		 1160 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000412297  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3116  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  50 
 
 		 1161 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0262432  normal  0.624015 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2876  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  52.17 
 
 		 1155 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.66593 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3021  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  52.17 
 
 		 1160 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3608  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  48.15 
 
 		 1161 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408451  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2349  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  50 
 
 		 1161 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5301  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  46.15 
 
 		 1186 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1745  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  44.07 
 
 		 1165 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.348949  normal  0.255396 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2324  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  38.46 
 
 		 1161 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.600214  normal  0.14397 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3387  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  44.07 
 
 		 1163 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2811  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  42.59 
 
 		 1157 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0820  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  40.98 
 
 		 1143 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1152  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  43.86 
 
 		 1171 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00216287 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1834  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  43.64 
 
 		 1171 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0287  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  42.59 
 
 		 1161 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0826216  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2185  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  44.44 
 
 		 1168 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6233  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  42.59 
 
 		 1167 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0095  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  45.1 
 
 		 1228 aa  47.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.602888  normal  0.037997 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1914  isochorismatase hydrolase  78.57 
 
 		 222 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.652638  normal  0.010767 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3680  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  38.71 
 
 		 1139 aa  46.2  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1835  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  40 
 
 		 1179 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1784  Pyruvate/ketoisovalerate oxidoreductase  35.9 
 
 		 1194 aa  45.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03584  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  45.1 
 
 		 1235 aa  45.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2079  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  45.95 
 
 		 1157 aa  44.7  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1279  major facilitator superfamily transporter  55.1 
 
 		 493 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1174  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  50 
 
 		 1157 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1120  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  43.48 
 
 		 1139 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.429591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6435  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  52.63 
 
 		 1168 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.681075  normal  0.154536 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0143  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  54.05 
 
 		 1196 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4830  multi-sensor signal transduction histidine kinase  59.46 
 
 		 848 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356174  normal  0.508218 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3030  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  48.78 
 
 		 1169 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2236  NUDIX hydrolase  62.16 
 
 		 322 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3533  ABC transporter related  45.9 
 
 		 522 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.909049 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6218  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  41.18 
 
 		 1176 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5611  Indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  39.62 
 
 		 1174 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103361  normal  0.293019 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1663  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  61.29 
 
 		 1170 aa  41.6  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3630  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  54.05 
 
 		 1119 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.783823 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0083  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  42 
 
 		 1187 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4764  hypothetical protein  59.46 
 
 		 318 aa  40.8  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.966578 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1031  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  39.22 
 
 		 1149 aa  40.4  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0621498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3426  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  53.66 
 
 		 375 aa  40.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.604906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4031  hypothetical protein  59.46 
 
 		 361 aa  40.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.282109  normal  0.713722 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2176  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  43.9 
 
 		 1132 aa  40.4  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0667179  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>