278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0083 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0390  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  57.76 
 
 
1159 aa  1292    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0001  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.92 
 
 
1193 aa  1075    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.572311  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2876  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.83 
 
 
1155 aa  1078    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.66593 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3630  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  44.38 
 
 
1119 aa  833    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.783823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4090  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.88 
 
 
1204 aa  962    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2851  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  45.16 
 
 
1190 aa  902    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0601996  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1031  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  40.74 
 
 
1149 aa  729    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0621498  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2324  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  57.75 
 
 
1161 aa  1255    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.600214  normal  0.14397 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0398  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  45 
 
 
1191 aa  885    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3122  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  48.43 
 
 
1187 aa  1045    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2079  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  43.35 
 
 
1157 aa  968    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3155  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase family protein  49.14 
 
 
1160 aa  1057    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000412297  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2584  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.83 
 
 
1193 aa  1073    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3021  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.4 
 
 
1160 aa  1056    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0267  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.48 
 
 
1150 aa  1071    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3673  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  48.37 
 
 
1199 aa  1073    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000976123 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0246  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.41 
 
 
1196 aa  1055    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000237135 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2777  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  41.48 
 
 
1186 aa  831    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.917164  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6218  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  43.57 
 
 
1176 aa  878    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6355  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.28 
 
 
1214 aa  962    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3233  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.55 
 
 
1197 aa  1052    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.610198  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5301  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  45.62 
 
 
1186 aa  946    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5840  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  48.08 
 
 
1186 aa  1030    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0299  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.7 
 
 
1196 aa  1077    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000479441 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4646  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.26 
 
 
1191 aa  961    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2962  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  44.25 
 
 
1190 aa  893    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1745  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.23 
 
 
1165 aa  984    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.348949  normal  0.255396 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0018  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.92 
 
 
1193 aa  1074    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0563  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  45 
 
 
1191 aa  885    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.453364  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2948  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.83 
 
 
1128 aa  1016    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.722165  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1036  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.28 
 
 
1198 aa  1031    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.37446  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3525  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.92 
 
 
1193 aa  1075    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.651962  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1834  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  46.39 
 
 
1171 aa  957    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3418  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.4 
 
 
1196 aa  1077    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6292  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  44.59 
 
 
1190 aa  877    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3502  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.93 
 
 
1186 aa  1009    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3404  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  48.18 
 
 
1186 aa  1027    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.206318 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0357  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  44.63 
 
 
1190 aa  899    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3887  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.35 
 
 
1206 aa  971    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.398161  normal  0.512264 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3786  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.92 
 
 
1193 aa  1073    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.509571  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5688  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.57 
 
 
1182 aa  987    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0608745 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4008  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  45.2 
 
 
1206 aa  937    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.7701 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03584  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.76 
 
 
1235 aa  1001    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2185  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  50.81 
 
 
1168 aa  1077    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5543  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  48.82 
 
 
1195 aa  1061    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00134881  normal  0.730812 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1784  Pyruvate/ketoisovalerate oxidoreductase  39.56 
 
 
1194 aa  756    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2868  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.67 
 
 
1200 aa  1060    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000387665 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1663  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  44.42 
 
 
1170 aa  758    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0328  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  45.29 
 
 
1191 aa  904    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3108  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.28 
 
 
1193 aa  1079    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0417  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  43.71 
 
 
1195 aa  887    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.114181 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1554  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  45.46 
 
 
1155 aa  906    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0378  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  45 
 
 
1191 aa  887    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179398  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2349  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.3 
 
 
1161 aa  976    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4433  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  40.55 
 
 
1148 aa  735    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3801  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  46.19 
 
 
1192 aa  960    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737264  normal  0.93636 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0221  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.53 
 
 
1196 aa  1082    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.530099  hitchhiker  0.000000183549 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2176  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  48.26 
 
 
1132 aa  983    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0667179  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3868  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  45.58 
 
 
1218 aa  996    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0095  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.98 
 
 
1228 aa  1035    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.602888  normal  0.037997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5013  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.46 
 
 
1163 aa  1011    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353185 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3387  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.08 
 
 
1163 aa  967    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4647  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.77 
 
 
1187 aa  976    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1174  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  46.19 
 
 
1157 aa  890    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0285  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  48.7 
 
 
1199 aa  1077    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.360471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4290  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  43.89 
 
 
1195 aa  884    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0361  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  47.5 
 
 
1199 aa  1039    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0614  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  48.52 
 
 
1192 aa  1035    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23102  normal  0.0754144 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3847  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.92 
 
 
1193 aa  1075    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2438  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  48.3 
 
 
1139 aa  922    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.218684  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0143  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  44.32 
 
 
1196 aa  897    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3116  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  45.9 
 
 
1161 aa  969    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0262432  normal  0.624015 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2022  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  42.57 
 
 
1144 aa  823    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3608  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  45.81 
 
 
1161 aa  967    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408451  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2178  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.35 
 
 
1164 aa  980    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3396  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.96 
 
 
1197 aa  1063    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3680  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  44.11 
 
 
1139 aa  854    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1120  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.09 
 
 
1139 aa  995    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.429591  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2326  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  44.43 
 
 
1190 aa  889    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2787  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.7 
 
 
1196 aa  1077    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3095  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  42.02 
 
 
1180 aa  837    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2811  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  55.09 
 
 
1157 aa  1204    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1762  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  48.31 
 
 
1135 aa  963    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.614187  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0238  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.49 
 
 
1196 aa  1079    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2988  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  44.73 
 
 
1190 aa  894    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6233  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  54.91 
 
 
1167 aa  1170    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6435  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  44.68 
 
 
1168 aa  920    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.681075  normal  0.154536 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0319  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.7 
 
 
1196 aa  1077    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2940  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  44.43 
 
 
1190 aa  889    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3030  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.23 
 
 
1169 aa  923    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1594  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.83 
 
 
1128 aa  1015    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0266252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6838  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  37.08 
 
 
1239 aa  664    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0840  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.4 
 
 
1193 aa  996    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0820  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.36 
 
 
1143 aa  937    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1972  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.92 
 
 
1193 aa  1075    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3905  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.97 
 
 
1185 aa  990    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3122  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.92 
 
 
1193 aa  1075    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0083  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  100 
 
 
1187 aa  2407    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0896  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  50.47 
 
 
1128 aa  1029    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0193529 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1835  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  40.62 
 
 
1179 aa  726    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>