271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0840 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1036  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  55.76 
 
 
1198 aa  1253    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.37446  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1594  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.73 
 
 
1128 aa  967    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0266252 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0083  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.59 
 
 
1187 aa  1030    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2962  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  46.62 
 
 
1190 aa  964    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0378  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  46.34 
 
 
1191 aa  973    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179398  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3525  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  62.85 
 
 
1193 aa  1462    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.651962  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0221  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  64.17 
 
 
1196 aa  1526    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.530099  hitchhiker  0.000000183549 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1174  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  47.14 
 
 
1157 aa  962    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2876  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  55.12 
 
 
1155 aa  1238    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.66593 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3122  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  62.25 
 
 
1187 aa  1479    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2079  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  44.32 
 
 
1157 aa  1033    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3155  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase family protein  54.3 
 
 
1160 aa  1201    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000412297  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2584  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  62.77 
 
 
1193 aa  1461    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3021  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  53.79 
 
 
1160 aa  1204    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0267  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  53.36 
 
 
1150 aa  1209    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2438  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.57 
 
 
1139 aa  987    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.218684  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2777  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  43.83 
 
 
1186 aa  917    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.917164  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6218  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  44.04 
 
 
1176 aa  944    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6355  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  68.27 
 
 
1214 aa  1645    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3233  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  61.78 
 
 
1197 aa  1484    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.610198  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5301  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  67.51 
 
 
1186 aa  1625    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5840  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  59.39 
 
 
1186 aa  1373    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4008  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  82.38 
 
 
1206 aa  1977    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.7701 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2324  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  51.41 
 
 
1161 aa  1081    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.600214  normal  0.14397 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1972  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  62.85 
 
 
1193 aa  1462    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1762  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  44.38 
 
 
1135 aa  897    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.614187  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1745  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  50.09 
 
 
1165 aa  1119    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.348949  normal  0.255396 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0018  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  62.85 
 
 
1193 aa  1462    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0563  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  46.43 
 
 
1191 aa  972    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.453364  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2948  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.47 
 
 
1128 aa  958    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.722165  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1554  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  48.89 
 
 
1155 aa  1008    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1784  Pyruvate/ketoisovalerate oxidoreductase  40.77 
 
 
1194 aa  796    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1031  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  39.48 
 
 
1149 aa  740    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0621498  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3418  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  63.42 
 
 
1196 aa  1513    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6292  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  46.89 
 
 
1190 aa  950    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3786  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  62.85 
 
 
1193 aa  1460    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.509571  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5688  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  48.76 
 
 
1182 aa  1059    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0608745 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6838  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  36.96 
 
 
1239 aa  662    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0896  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.9 
 
 
1128 aa  957    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0193529 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0357  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  46.86 
 
 
1190 aa  973    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3801  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  65.51 
 
 
1192 aa  1560    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737264  normal  0.93636 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0840  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  100 
 
 
1193 aa  2475    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2185  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  52.01 
 
 
1168 aa  1167    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0299  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  63.5 
 
 
1196 aa  1516    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000479441 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2868  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  62.9 
 
 
1200 aa  1524    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000387665 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1663  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  42.76 
 
 
1170 aa  793    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0328  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  47.27 
 
 
1191 aa  985    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3108  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  63.19 
 
 
1193 aa  1493    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3122  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  62.85 
 
 
1193 aa  1462    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3905  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  73.19 
 
 
1185 aa  1767    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0001  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  62.85 
 
 
1193 aa  1462    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.572311  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2349  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  50 
 
 
1161 aa  1119    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1834  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  48.19 
 
 
1171 aa  1040    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2022  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  44.43 
 
 
1144 aa  886    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4090  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  77.66 
 
 
1204 aa  1894    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0246  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  63.26 
 
 
1196 aa  1484    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000237135 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2176  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.22 
 
 
1132 aa  928    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0667179  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3868  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  66.94 
 
 
1218 aa  1638    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0417  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  47.43 
 
 
1195 aa  1027    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.114181 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0390  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  51.28 
 
 
1159 aa  1095    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3387  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  51.64 
 
 
1163 aa  1146    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4647  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  81.38 
 
 
1187 aa  1940    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03584  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  51.55 
 
 
1235 aa  1151    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0285  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  61.72 
 
 
1199 aa  1493    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.360471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4290  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  47.26 
 
 
1195 aa  1022    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0361  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  58.1 
 
 
1199 aa  1371    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0614  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  57.92 
 
 
1192 aa  1329    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23102  normal  0.0754144 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3847  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  62.85 
 
 
1193 aa  1463    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3404  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  63.06 
 
 
1186 aa  1469    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.206318 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3887  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  78.5 
 
 
1206 aa  1902    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.398161  normal  0.512264 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4433  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  39.12 
 
 
1148 aa  753    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3116  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.61 
 
 
1161 aa  1115    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0262432  normal  0.624015 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4646  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  84.49 
 
 
1191 aa  1997    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0143  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  47.85 
 
 
1196 aa  1018    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2178  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.7 
 
 
1164 aa  1110    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3396  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  61.11 
 
 
1197 aa  1466    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3680  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  44.17 
 
 
1139 aa  915    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1120  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  44.36 
 
 
1139 aa  942    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.429591  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2326  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  46.94 
 
 
1190 aa  960    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2787  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  63.33 
 
 
1196 aa  1511    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3095  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  43.38 
 
 
1180 aa  914    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2811  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  50.6 
 
 
1157 aa  1085    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2851  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  46.61 
 
 
1190 aa  961    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0601996  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0238  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  63.18 
 
 
1196 aa  1509    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2988  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  46.61 
 
 
1190 aa  955    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6233  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  48.85 
 
 
1167 aa  1042    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6435  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.37 
 
 
1168 aa  1003    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.681075  normal  0.154536 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0319  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  63.33 
 
 
1196 aa  1511    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2940  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  46.94 
 
 
1190 aa  960    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0820  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.45 
 
 
1143 aa  1013    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3030  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  43.9 
 
 
1169 aa  893    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0095  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  48.41 
 
 
1228 aa  1010    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.602888  normal  0.037997 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3608  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.36 
 
 
1161 aa  1109    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408451  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3673  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  62.15 
 
 
1199 aa  1508    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000976123 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4222  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  39.59 
 
 
1168 aa  774    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28845  normal  0.848789 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3502  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  74.66 
 
 
1186 aa  1805    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0398  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  46.43 
 
 
1191 aa  972    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5543  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  58.9 
 
 
1195 aa  1362    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00134881  normal  0.730812 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3630  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  45.03 
 
 
1119 aa  904    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.783823 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1835  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  41.96 
 
 
1179 aa  807    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>