270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1554 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0896  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  45.44 
 
 		 1128 aa  849    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0193529 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4646  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.19 
 
 		 1191 aa  990    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0246  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  51.11 
 
 		 1196 aa  1071    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237135 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4090  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  48.74 
 
 		 1204 aa  993    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0398  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  46.09 
 
 		 1191 aa  895    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0095  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.38 
 
 		 1228 aa  978    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.602888  normal  0.037997 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2876  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  50.04 
 
 		 1155 aa  1061    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.66593 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3525  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  50.68 
 
 		 1193 aa  1048    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.651962  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1784  Pyruvate/ketoisovalerate oxidoreductase  39.71 
 
 		 1194 aa  751    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2438  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  48.64 
 
 		 1139 aa  904    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.218684  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3122  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  50.83 
 
 		 1187 aa  1037    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2079  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  41.81 
 
 		 1157 aa  947    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3155  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase family protein  49.13 
 
 		 1160 aa  1053    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000412297  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2584  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  50.6 
 
 		 1193 aa  1046    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3021  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.3 
 
 		 1160 aa  1042    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0267  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  52.02 
 
 		 1150 aa  1093    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0357  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  45.94 
 
 		 1190 aa  908    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2777  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  42.2 
 
 		 1186 aa  853    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.917164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6218  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  43.47 
 
 		 1176 aa  894    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6355  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.66 
 
 		 1214 aa  1017    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3233  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.28 
 
 		 1197 aa  1042    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.610198  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5301  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  47.3 
 
 		 1186 aa  1000    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5840  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  51.25 
 
 		 1186 aa  1031    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3887  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.57 
 
 		 1206 aa  965    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.398161  normal  0.512264 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5688  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.01 
 
 		 1182 aa  956    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0608745 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0378  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  46.09 
 
 		 1191 aa  897    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179398  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2851  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  45.46 
 
 		 1190 aa  900    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0601996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1745  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.69 
 
 		 1165 aa  994    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.348949  normal  0.255396 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0018  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  50.77 
 
 		 1193 aa  1050    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0563  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  46.09 
 
 		 1191 aa  895    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.453364  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2948  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  45.27 
 
 		 1128 aa  866    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.722165  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3404  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.53 
 
 		 1186 aa  1021    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.206318 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0001  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  50.68 
 
 		 1193 aa  1048    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.572311  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3786  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  50.77 
 
 		 1193 aa  1048    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.509571  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3418  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  50.77 
 
 		 1196 aa  1082    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6292  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  45.86 
 
 		 1190 aa  883    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4222  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  40.82 
 
 		 1168 aa  784    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28845  normal  0.848789 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0417  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  44.98 
 
 		 1195 aa  912    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.114181 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3030  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  45.93 
 
 		 1169 aa  938    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0820  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.68 
 
 		 1143 aa  918    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3847  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  50.68 
 
 		 1193 aa  1048    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0299  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  50.85 
 
 		 1196 aa  1086    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000479441 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2185  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  48.47 
 
 		 1168 aa  995    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2022  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  44.85 
 
 		 1144 aa  856    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1174  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  46.37 
 
 		 1157 aa  879    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3122  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  50.68 
 
 		 1193 aa  1048    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2324  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.24 
 
 		 1161 aa  880    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.600214  normal  0.14397 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1663  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  43.32 
 
 		 1170 aa  740    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0328  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  45.79 
 
 		 1191 aa  896    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3108  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  50.68 
 
 		 1193 aa  1075    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0083  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  45.06 
 
 		 1187 aa  924    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0143  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  44.8 
 
 		 1196 aa  902    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1972  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  50.68 
 
 		 1193 aa  1048    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2349  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.14 
 
 		 1161 aa  975    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4433  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  41.94 
 
 		 1148 aa  755    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3630  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  45.28 
 
 		 1119 aa  868    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.783823 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3673  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.29 
 
 		 1199 aa  1055    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000976123 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2176  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  44.32 
 
 		 1132 aa  841    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0667179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3868  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.6 
 
 		 1218 aa  985    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3608  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.17 
 
 		 1161 aa  988    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408451  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3502  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.87 
 
 		 1186 aa  1040    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3387  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  48.01 
 
 		 1163 aa  997    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4647  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.61 
 
 		 1187 aa  990    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0840  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  48.89 
 
 		 1193 aa  988    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0285  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.41 
 
 		 1199 aa  1053    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.360471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4290  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  45.29 
 
 		 1195 aa  912    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0361  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  49.87 
 
 		 1199 aa  1034    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0614  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  49.79 
 
 		 1192 aa  1017    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23102  normal  0.0754144 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1031  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  42.67 
 
 		 1149 aa  742    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0621498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2868  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.45 
 
 		 1200 aa  1063    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387665 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0390  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.24 
 
 		 1159 aa  956    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3116  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47 
 
 		 1161 aa  981    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0262432  normal  0.624015 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2962  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  45.56 
 
 		 1190 aa  892    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1554  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  100 
 
 		 1155 aa  2335    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2178  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.37 
 
 		 1164 aa  972    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3396  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.44 
 
 		 1197 aa  1022    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3680  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  43.13 
 
 		 1139 aa  829    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1120  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  42.93 
 
 		 1139 aa  840    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.429591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2326  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  45.68 
 
 		 1190 aa  892    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2787  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  50.77 
 
 		 1196 aa  1084    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3095  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  41.81 
 
 		 1180 aa  855    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2811  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.67 
 
 		 1157 aa  939    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4008  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  48.44 
 
 		 1206 aa  970    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7701 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5543  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  50 
 
 		 1195 aa  1035    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00134881  normal  0.730812 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0238  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  51.03 
 
 		 1196 aa  1091    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2988  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  45.46 
 
 		 1190 aa  895    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6233  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  48.33 
 
 		 1167 aa  944    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6435  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.19 
 
 		 1168 aa  947    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.681075  normal  0.154536 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0319  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  50.77 
 
 		 1196 aa  1084    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2940  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  45.68 
 
 		 1190 aa  892    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03584  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.56 
 
 		 1235 aa  978    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1834  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  45.71 
 
 		 1171 aa  979    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1036  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.53 
 
 		 1198 aa  1031    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.37446  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1594  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  45.27 
 
 		 1128 aa  863    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0266252 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0221  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  50.72 
 
 		 1196 aa  1085    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.530099  hitchhiker  0.000000183549 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3905  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.02 
 
 		 1185 aa  986    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6838  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  38.73 
 
 		 1239 aa  687    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3801  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  47.44 
 
 		 1192 aa  1012    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737264  normal  0.93636 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5013  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.53 
 
 		 1163 aa  995    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353185 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1762  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  43.5 
 
 		 1135 aa  823    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.614187  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>