262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2940 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0417  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  83.19 
 
 
1195 aa  2032    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.114181 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1972  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.53 
 
 
1193 aa  1045    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1762  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  45.89 
 
 
1135 aa  899    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.614187  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3630  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  45.77 
 
 
1119 aa  904    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.783823 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4433  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  38.61 
 
 
1148 aa  702    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0083  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  44.67 
 
 
1187 aa  927    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0221  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  50.04 
 
 
1196 aa  1072    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.530099  hitchhiker  0.000000183549 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5543  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  51.28 
 
 
1195 aa  1071    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00134881  normal  0.730812 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3122  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  50.34 
 
 
1187 aa  1058    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2079  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  44.61 
 
 
1157 aa  996    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3155  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase family protein  50.79 
 
 
1160 aa  1085    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000412297  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2584  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.45 
 
 
1193 aa  1043    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3021  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  50.74 
 
 
1160 aa  1085    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0267  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  50.26 
 
 
1150 aa  1056    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1834  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  47.05 
 
 
1171 aa  986    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2777  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  39 
 
 
1186 aa  783    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.917164  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6218  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  45.62 
 
 
1176 aa  942    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6355  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.67 
 
 
1214 aa  989    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3233  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.7 
 
 
1197 aa  1047    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.610198  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5301  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  46.91 
 
 
1186 aa  988    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5840  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  50.94 
 
 
1186 aa  1051    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1554  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  45.99 
 
 
1155 aa  912    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3608  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.24 
 
 
1161 aa  962    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408451  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3502  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  48.01 
 
 
1186 aa  1026    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0840  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.94 
 
 
1193 aa  970    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1745  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.54 
 
 
1165 aa  949    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.348949  normal  0.255396 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0018  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.53 
 
 
1193 aa  1046    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0563  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  87.9 
 
 
1191 aa  2104    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.453364  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2948  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  44.97 
 
 
1128 aa  885    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.722165  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1784  Pyruvate/ketoisovalerate oxidoreductase  38.22 
 
 
1194 aa  741    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2438  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  48.04 
 
 
1139 aa  924    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.218684  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3418  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  50.21 
 
 
1196 aa  1062    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6292  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  97.65 
 
 
1190 aa  2282    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2022  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  43.42 
 
 
1144 aa  821    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03584  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  48.28 
 
 
1235 aa  1029    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4090  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.12 
 
 
1204 aa  962    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3673  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.49 
 
 
1199 aa  1071    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000976123 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1036  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.91 
 
 
1198 aa  1049    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.37446  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0143  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  83.47 
 
 
1196 aa  2021    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2185  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  48.5 
 
 
1168 aa  1014    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2324  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  48.14 
 
 
1161 aa  964    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.600214  normal  0.14397 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2876  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  51.03 
 
 
1155 aa  1115    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.66593 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1663  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  50.22 
 
 
1170 aa  967    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0328  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  87.73 
 
 
1191 aa  2106    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3108  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.11 
 
 
1193 aa  1055    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1594  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  45.05 
 
 
1128 aa  890    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0266252 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5688  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.35 
 
 
1182 aa  966    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0608745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5013  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.68 
 
 
1163 aa  966    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353185 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2349  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.36 
 
 
1161 aa  961    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0820  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.97 
 
 
1143 aa  913    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0378  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  87.9 
 
 
1191 aa  2108    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179398  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0095  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  48.43 
 
 
1228 aa  1045    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.602888  normal  0.037997 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2176  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  45.6 
 
 
1132 aa  861    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0667179  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3868  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  45.21 
 
 
1218 aa  954    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2851  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  96.39 
 
 
1190 aa  2287    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0601996  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3786  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.53 
 
 
1193 aa  1046    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.509571  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3387  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.64 
 
 
1163 aa  962    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4647  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.66 
 
 
1187 aa  993    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3030  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.49 
 
 
1169 aa  942    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0285  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.32 
 
 
1199 aa  1066    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.360471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4290  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  83.11 
 
 
1195 aa  2003    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0361  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  49.45 
 
 
1199 aa  1041    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0614  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  49.32 
 
 
1192 aa  1016    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23102  normal  0.0754144 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0896  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  44.87 
 
 
1128 aa  874    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0193529 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3122  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.53 
 
 
1193 aa  1045    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0299  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.96 
 
 
1196 aa  1062    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000479441 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3116  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.15 
 
 
1161 aa  951    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0262432  normal  0.624015 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2868  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.45 
 
 
1200 aa  1064    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000387665 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2962  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  99.24 
 
 
1190 aa  2420    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2178  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.63 
 
 
1164 aa  939    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3396  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.7 
 
 
1197 aa  1044    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3680  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  52.12 
 
 
1139 aa  1070    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1120  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  45.06 
 
 
1139 aa  902    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.429591  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2326  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  100 
 
 
1190 aa  2442    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2787  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.96 
 
 
1196 aa  1064    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3095  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  39.36 
 
 
1180 aa  791    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2811  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.01 
 
 
1157 aa  946    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0390  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.05 
 
 
1159 aa  1036    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0238  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.7 
 
 
1196 aa  1063    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2988  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  96.64 
 
 
1190 aa  2276    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6233  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  48.27 
 
 
1167 aa  979    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6435  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.09 
 
 
1168 aa  963    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.681075  normal  0.154536 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0319  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.96 
 
 
1196 aa  1064    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2940  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  100 
 
 
1190 aa  2442    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1174  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  47.26 
 
 
1157 aa  905    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3905  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.02 
 
 
1185 aa  1004    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0246  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.11 
 
 
1196 aa  1047    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000237135 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3847  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.53 
 
 
1193 aa  1045    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1031  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  39.66 
 
 
1149 aa  686    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0621498  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0357  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  95.21 
 
 
1190 aa  2243    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3404  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  50.3 
 
 
1186 aa  1036    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.206318 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1835  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  40.12 
 
 
1179 aa  728    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3525  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  49.53 
 
 
1193 aa  1045    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.651962  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1152  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.74 
 
 
1171 aa  974    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00216287 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0398  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  87.9 
 
 
1191 aa  2104    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3801  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  46.06 
 
 
1192 aa  978    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737264  normal  0.93636 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4222  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  40.95 
 
 
1168 aa  759    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28845  normal  0.848789 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4646  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.86 
 
 
1191 aa  993    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3887  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.77 
 
 
1206 aa  985    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.398161  normal  0.512264 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4008  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.66 
 
 
1206 aa  967    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.7701 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>