228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3680 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2876  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.23 
 
 		 1155 aa  1009    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.66593 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3030  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  44.5 
 
 		 1169 aa  865    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0378  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  51.87 
 
 		 1191 aa  1077    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179398  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4433  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  37.34 
 
 		 1148 aa  676    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5688  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  45.12 
 
 		 1182 aa  913    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0608745 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1784  Pyruvate/ketoisovalerate oxidoreductase  37.41 
 
 		 1194 aa  694    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1554  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  43.13 
 
 		 1155 aa  844    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3122  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.56 
 
 		 1187 aa  971    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2079  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  41.9 
 
 		 1157 aa  918    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3155  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase family protein  47.14 
 
 		 1160 aa  990    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000412297  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2584  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.95 
 
 		 1193 aa  991    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3021  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.25 
 
 		 1160 aa  986    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0267  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.76 
 
 		 1150 aa  1015    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2022  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  42.45 
 
 		 1144 aa  807    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2777  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  38.96 
 
 		 1186 aa  728    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.917164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6218  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  44.71 
 
 		 1176 aa  904    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6355  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  44.97 
 
 		 1214 aa  927    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3233  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.4 
 
 		 1197 aa  993    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.610198  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5301  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  44.83 
 
 		 1186 aa  930    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5840  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  47.02 
 
 		 1186 aa  956    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3673  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.59 
 
 		 1199 aa  985    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000976123 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2324  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.9 
 
 		 1161 aa  885    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.600214  normal  0.14397 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1745  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.67 
 
 		 1165 aa  946    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.348949  normal  0.255396 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0018  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  48.03 
 
 		 1193 aa  993    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0563  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  51.87 
 
 		 1191 aa  1075    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.453364  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2948  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  43.32 
 
 		 1128 aa  837    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.722165  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0221  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.36 
 
 		 1196 aa  1014    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.530099  hitchhiker  0.000000183549 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0390  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  44.67 
 
 		 1159 aa  874    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3418  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.07 
 
 		 1196 aa  994    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6292  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  53.62 
 
 		 1190 aa  1065    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4222  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  36.82 
 
 		 1168 aa  681    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28845  normal  0.848789 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0417  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  51.22 
 
 		 1195 aa  1078    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.114181 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3404  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.34 
 
 		 1186 aa  961    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.206318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1174  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  44.82 
 
 		 1157 aa  827    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0820  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  44.09 
 
 		 1143 aa  847    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2185  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.64 
 
 		 1168 aa  951    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2962  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  52.03 
 
 		 1190 aa  1071    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0246  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.15 
 
 		 1196 aa  985    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237135 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1663  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  45.25 
 
 		 1170 aa  865    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0328  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  51.96 
 
 		 1191 aa  1080    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3108  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.86 
 
 		 1193 aa  999    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0083  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  44.11 
 
 		 1187 aa  884    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0287  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.85 
 
 		 1161 aa  941    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0826216  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2349  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.23 
 
 		 1161 aa  932    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1762  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  44.45 
 
 		 1135 aa  853    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.614187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0357  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  52.59 
 
 		 1190 aa  1075    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2176  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  44.69 
 
 		 1132 aa  833    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0667179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3868  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  43.45 
 
 		 1218 aa  884    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03584  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.7 
 
 		 1235 aa  988    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1594  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  43.08 
 
 		 1128 aa  833    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0266252 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3387  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  45.56 
 
 		 1163 aa  914    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4647  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  44.42 
 
 		 1187 aa  915    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3608  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  45.88 
 
 		 1161 aa  928    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408451  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0285  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.56 
 
 		 1199 aa  988    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.360471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4290  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  51.87 
 
 		 1195 aa  1074    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0361  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  46.22 
 
 		 1199 aa  942    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0614  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  46.5 
 
 		 1192 aa  946    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23102  normal  0.0754144 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1036  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.31 
 
 		 1198 aa  940    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.37446  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5543  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  47.89 
 
 		 1195 aa  951    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00134881  normal  0.730812 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3116  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.35 
 
 		 1161 aa  941    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0262432  normal  0.624015 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2868  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.71 
 
 		 1200 aa  979    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387665 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2178  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.24 
 
 		 1164 aa  946    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3396  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.38 
 
 		 1197 aa  985    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3680  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  100 
 
 		 1139 aa  2344    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1120  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  43.26 
 
 		 1139 aa  864    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.429591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2326  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  52.03 
 
 		 1190 aa  1065    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2787  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.37 
 
 		 1196 aa  1007    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3095  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  37.56 
 
 		 1180 aa  709    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2811  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  45.63 
 
 		 1157 aa  884    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0095  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.84 
 
 		 1228 aa  1019    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.602888  normal  0.037997 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0238  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.4 
 
 		 1196 aa  1005    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2988  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  52.38 
 
 		 1190 aa  1075    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6233  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  44.83 
 
 		 1167 aa  890    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6435  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  45.49 
 
 		 1168 aa  924    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.681075  normal  0.154536 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0319  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.37 
 
 		 1196 aa  1007    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2940  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  52.03 
 
 		 1190 aa  1065    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0840  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  44.17 
 
 		 1193 aa  919    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2851  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  52.55 
 
 		 1190 aa  1089    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0601996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0299  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.15 
 
 		 1196 aa  1005    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000479441 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1834  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  45.42 
 
 		 1171 aa  931    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3847  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  48.12 
 
 		 1193 aa  995    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3786  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  47.95 
 
 		 1193 aa  989    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.509571  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3905  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  46.07 
 
 		 1185 aa  962    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1835  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  37.68 
 
 		 1179 aa  678    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0896  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  44.03 
 
 		 1128 aa  830    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0193529 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1152  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  44.14 
 
 		 1171 aa  871    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00216287 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0398  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  51.87 
 
 		 1191 aa  1075    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2438  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  44.76 
 
 		 1139 aa  825    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.218684  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4646  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  44.6 
 
 		 1191 aa  916    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3887  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  44.83 
 
 		 1206 aa  914    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.398161  normal  0.512264 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4008  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  44.25 
 
 		 1206 aa  896    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7701 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0001  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  48.03 
 
 		 1193 aa  993    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.572311  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3122  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  48.03 
 
 		 1193 aa  993    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3525  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  48.03 
 
 		 1193 aa  993    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.651962  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3801  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  44.71 
 
 		 1192 aa  920    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737264  normal  0.93636 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4090  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  45.04 
 
 		 1204 aa  910    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3630  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  45.13 
 
 		 1119 aa  847    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.783823 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3502  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  45.13 
 
 		 1186 aa  918    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1972  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  48.03 
 
 		 1193 aa  993    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5013  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  45.63 
 
 		 1163 aa  948    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353185 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>