44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_1831 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_1831  NUDIX hydrolase  100 
 
 
202 aa  420  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000890359  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1968  mutT/nudix family protein  88.61 
 
 
202 aa  373  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0475736  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2000  mutT/nudix family protein  88.61 
 
 
202 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.7905499999999994e-43 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1798  MutT/Nudix family protein  88.61 
 
 
202 aa  373  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840162  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1823  mutT/nudix family protein  87.13 
 
 
202 aa  368  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00460593  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3359  mutT/nudix family protein  88.12 
 
 
202 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.039473  hitchhiker  0.00000000000000713164 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2070  mutT/nudix family protein  87.13 
 
 
202 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000173279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1964  mutT/nudix family protein  87.13 
 
 
202 aa  368  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000761489  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1781  MutT/Nudix family protein  86.14 
 
 
202 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.893185  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2049  mutT/nudix family protein  84.65 
 
 
202 aa  363  1e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00026256  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2877  NUDIX hydrolase  30.54 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1593  NUDIX hydrolase  35.64 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2765  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 
209 aa  64.3  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26905  predicted protein  38.3 
 
 
216 aa  61.2  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0375733  normal  0.0729725 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2376  NUDIX hydrolase  30.4 
 
 
197 aa  60.1  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  0.316272 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2201  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  25.97 
 
 
179 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43573  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1536  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 
331 aa  53.9  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1553  NUDIX hydrolase  38.16 
 
 
182 aa  50.8  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5294  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.37 
 
 
190 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  29.79 
 
 
459 aa  49.7  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1205  hypothetical protein  27.49 
 
 
182 aa  49.7  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418064 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  25.36 
 
 
184 aa  48.9  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0346  NUDIX hydrolase  31.19 
 
 
182 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0239643 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0674  NUDIX family hydrolase  31.76 
 
 
177 aa  48.1  0.00008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1742  NUDIX hydrolase  30.61 
 
 
166 aa  47.8  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.445003  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0720  diphosphomevalonate decarboxylase/isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.74 
 
 
503 aa  47  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0013091  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0619  diphosphomevalonate decarboxylase  28.74 
 
 
503 aa  47  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2237  NUDIX hydrolase  27.21 
 
 
169 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0632516  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3117  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 
178 aa  45.8  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.129541  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13638  putative isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.04 
 
 
174 aa  45.4  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.279506  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4564  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.23 
 
 
196 aa  45.1  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.669276  hitchhiker  0.00145949 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1499  Mut/nudix family protein, putative isopentenyl-diphosphate isomerase  33.33 
 
 
170 aa  45.1  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.38166e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2666  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 
182 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4870  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  23.2 
 
 
185 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0257995  normal  0.425035 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2032  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  23.58 
 
 
171 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24100  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  25.42 
 
 
197 aa  43.5  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3251  NUDIX hydrolase  28.87 
 
 
178 aa  43.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000109349  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12740  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  24.46 
 
 
196 aa  43.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251434  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3569  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  23.81 
 
 
197 aa  43.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.863637 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1623  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  26.05 
 
 
175 aa  42.7  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0990  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
173 aa  42.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000363849  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2043  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  23.97 
 
 
172 aa  42.4  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.82849  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4731  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  23.49 
 
 
171 aa  42  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.291133  decreased coverage  0.0000344266 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1754  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  27.52 
 
 
191 aa  42  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.202271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>