More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_0646 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0646  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
473 aa  978    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0551  GntR family transcriptional regulator  90.34 
 
 
466 aa  877    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0493  GntR family transcriptional regulator  90.13 
 
 
466 aa  875    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.393759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0495  GntR family transcriptional regulator  90.34 
 
 
466 aa  878    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0582  GntR family transcriptional regulator  90.34 
 
 
466 aa  877    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.915495  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4719  transcriptional regulator, GntR family  93.78 
 
 
466 aa  909    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0638  transcriptional regulator, GntR family  89.48 
 
 
466 aa  871    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0620  transcriptional regulator, GntR family  93.78 
 
 
466 aa  914    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0496  transcriptional regulator  82.62 
 
 
466 aa  798    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0708  transcriptional regulator, GntR family  91.63 
 
 
466 aa  889    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2769  transcriptional regulator  45.14 
 
 
463 aa  420  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2170  GntR family transcriptional regulator  46.81 
 
 
466 aa  411  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662886  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1567  GntR family transcriptional regulator  46.81 
 
 
473 aa  409  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1937  GntR family transcriptional regulator  46.62 
 
 
466 aa  409  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1900  GntR family transcriptional regulator  46.38 
 
 
466 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000823779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2116  transcriptional regulator, GntR family  46.38 
 
 
466 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2184  transcriptional regulator, GntR family  46.6 
 
 
466 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1938  GntR family transcriptional regulator  45.96 
 
 
466 aa  403  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1890  GntR family transcriptional regulator  46.38 
 
 
466 aa  403  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0766739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2085  GntR family transcriptional regulator  45.96 
 
 
466 aa  403  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249037  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2075  transcriptional regulator, GntR family  45.71 
 
 
471 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3230  transcriptional regulator, GntR family  45.49 
 
 
471 aa  397  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.42 
 
 
465 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0090  aminotransferase, MocR-like  40.9 
 
 
463 aa  343  5e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2363  GntR family transcriptional regulator  41.15 
 
 
459 aa  341  1e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0077  GntR family transcriptional regulator  37.45 
 
 
484 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.994833  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0222  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.29 
 
 
464 aa  336  5e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3005  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.98 
 
 
486 aa  336  5e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1162  transcriptional regulator, GntR family  37.71 
 
 
479 aa  335  7e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200277  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1297  GntR family transcriptional regulator  38.84 
 
 
480 aa  335  1e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0205  transcriptional regulator, GntR family  38.44 
 
 
463 aa  333  3e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146418 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3060  putative transcriptional regulator, GntR family  39.22 
 
 
464 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0157  GntR family transcriptional regulator  37.39 
 
 
454 aa  326  6e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.790011  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.34 
 
 
472 aa  311  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000690216  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0540  GntR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
460 aa  297  3e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2327  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.5 
 
 
474 aa  297  3e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0554  regulatory protein GntR HTH  36.46 
 
 
460 aa  297  3e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  33.74 
 
 
490 aa  292  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07570  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  35.61 
 
 
491 aa  289  1e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.716498  normal  0.392489 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  33.26 
 
 
496 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18480  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  34.36 
 
 
488 aa  283  4.0000000000000003e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.423474  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  33.47 
 
 
509 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  33.74 
 
 
508 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
517 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  31.5 
 
 
520 aa  280  5e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  33.13 
 
 
509 aa  279  9e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
509 aa  277  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0989  transcriptional regulator  34.84 
 
 
473 aa  275  9e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0129526  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 
509 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
506 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
506 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 
506 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 
506 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
506 aa  267  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 
506 aa  266  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 
503 aa  266  8e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  31.03 
 
 
520 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  32.37 
 
 
502 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
502 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
502 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.02 
 
 
501 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
490 aa  263  6e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
477 aa  263  6.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
507 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  32.78 
 
 
502 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  31.2 
 
 
501 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
507 aa  261  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  30.58 
 
 
507 aa  260  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  31.98 
 
 
523 aa  260  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  32.57 
 
 
502 aa  260  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  32.16 
 
 
503 aa  259  6e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  29.94 
 
 
511 aa  259  9e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
470 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
507 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  30.39 
 
 
507 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
507 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2224  transcriptional regulator  33.4 
 
 
510 aa  256  7e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0182275 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  33.4 
 
 
569 aa  256  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2022  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.28 
 
 
593 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3456  transcriptional regulator  34.21 
 
 
501 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  34.53 
 
 
499 aa  254  3e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  32.84 
 
 
488 aa  254  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3858  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.46 
 
 
491 aa  253  6e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5015  transcriptional regulator  33.48 
 
 
502 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.301985  normal  0.695664 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3003  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 
487 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0989  GntR family transcriptional regulator  30.45 
 
 
485 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  29.56 
 
 
520 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4617  GntR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
516 aa  251  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3352  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 
485 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0801  regulatory protein GntR, HTH  31.68 
 
 
508 aa  249  6e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0129569  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5145  transcriptional regulator  33.2 
 
 
516 aa  249  8e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0937  GntR family transcriptional regulator  31.24 
 
 
486 aa  249  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0395  GntR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
497 aa  249  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  31.57 
 
 
562 aa  248  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3109  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 
502 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5258  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 
502 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1023  transcriptional regulator  29.81 
 
 
485 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71680  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
491 aa  247  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08090  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  30.87 
 
 
475 aa  246  6e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000657612 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  31.59 
 
 
492 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>