284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1604 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1604  NUDIX hydrolase  100 
 
 
369 aa  757    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000210752  hitchhiker  0.0000224711 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1686  NUDIX hydrolase  43.41 
 
 
360 aa  276  5e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.873349  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1507  NUDIX hydrolase  43.84 
 
 
360 aa  273  3e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  30.73 
 
 
313 aa  126  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  30.08 
 
 
314 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  30.16 
 
 
315 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  29.43 
 
 
317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  31.1 
 
 
314 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  29.7 
 
 
319 aa  120  6e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  29.46 
 
 
313 aa  119  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  30.16 
 
 
315 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  31.45 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  29.27 
 
 
321 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  29.59 
 
 
314 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  30.27 
 
 
314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  29.78 
 
 
314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  29.92 
 
 
317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  29.65 
 
 
316 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  29.17 
 
 
306 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0592  hypothetical protein  27.17 
 
 
316 aa  107  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  27.72 
 
 
322 aa  101  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  26.24 
 
 
318 aa  100  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  28.14 
 
 
314 aa  98.6  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  29.53 
 
 
329 aa  95.5  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  27.95 
 
 
310 aa  94.7  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  27.32 
 
 
320 aa  91.3  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  40.85 
 
 
130 aa  90.1  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  27.56 
 
 
312 aa  89.7  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  26.92 
 
 
314 aa  89  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  26.05 
 
 
315 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  25.76 
 
 
320 aa  87.4  4e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  25 
 
 
329 aa  86.7  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  25 
 
 
329 aa  86.7  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  40.14 
 
 
130 aa  86.7  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  39.44 
 
 
130 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  39.44 
 
 
130 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0407  mutator MutT protein  40.28 
 
 
129 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  36.55 
 
 
129 aa  84  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  39.01 
 
 
130 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  36.99 
 
 
129 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  38.3 
 
 
132 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  38.3 
 
 
132 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  37.32 
 
 
131 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03249  mutator mutT protein  38.62 
 
 
127 aa  80.9  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  35.76 
 
 
134 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  38.19 
 
 
132 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  37.14 
 
 
131 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.03 
 
 
131 aa  79.7  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  24.58 
 
 
302 aa  79.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.72 
 
 
131 aa  79  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1996  NUDIX hydrolase  24.38 
 
 
352 aa  78.6  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.42027  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1156  mutator MutT protein  33.79 
 
 
126 aa  78.2  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000464506  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  37.41 
 
 
134 aa  77  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0659  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.14 
 
 
134 aa  75.9  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  36.11 
 
 
133 aa  72.4  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.1 
 
 
134 aa  72.4  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  26.94 
 
 
325 aa  72  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  34.75 
 
 
128 aa  70.9  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 
133 aa  70.5  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 
132 aa  70.1  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3395  mutator mutT protein  39.16 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3510  mutator MutT protein  35.86 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.39786  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0154  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.01 
 
 
131 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000120622  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 
133 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.51 
 
 
131 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97066  hitchhiker  0.00538151 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4453  mutator mutT protein  34.9 
 
 
144 aa  68.6  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0347377  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0146  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.51 
 
 
131 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  33.09 
 
 
128 aa  68.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0153  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.01 
 
 
131 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471922  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.01 
 
 
131 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0349436  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  34.72 
 
 
132 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  33.33 
 
 
132 aa  68.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  35.14 
 
 
132 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 
151 aa  67.4  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  35.14 
 
 
132 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.72 
 
 
128 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.72 
 
 
128 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  33.09 
 
 
136 aa  67.4  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.72 
 
 
128 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  30.94 
 
 
144 aa  67  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  28.97 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  31.65 
 
 
138 aa  65.9  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  30.14 
 
 
132 aa  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 
129 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  31.65 
 
 
138 aa  65.9  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  30.22 
 
 
137 aa  65.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3747  thiamine monophosphate synthase  53.33 
 
 
194 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.907624  normal  0.127935 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  30.22 
 
 
137 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  29.86 
 
 
132 aa  65.5  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1957  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  34 
 
 
137 aa  65.1  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.892636  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 
150 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0240  mutator mutT protein  34 
 
 
137 aa  65.1  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.611039  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.39 
 
 
138 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.57 
 
 
135 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 
133 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  30 
 
 
347 aa  64.3  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  30.22 
 
 
138 aa  64.7  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.39 
 
 
138 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.39 
 
 
138 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>