67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2966 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2966  gdp-mannose mannosyl hydrolase  100 
 
 		 169 aa  353  6.999999999999999e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000202187 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2665  NUDIX hydrolase  68.24 
 
 		 159 aa  219  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.523325 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2333  GDP-mannose mannosyl hydrolase  62.66 
 
 		 157 aa  214  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.32489 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2232  GDP-mannose mannosyl hydrolase  62.03 
 
 		 157 aa  214  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2340  GDP-mannose mannosyl hydrolase  64.19 
 
 		 157 aa  214  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2447  GDP-mannose mannosyl hydrolase  64.19 
 
 		 157 aa  213  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00981768 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2289  GDP-mannose mannosyl hydrolase  64.19 
 
 		 157 aa  213  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337453 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1606  NUDIX hydrolase  62.84 
 
 		 160 aa  210  9e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1559  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1590  NUDIX hydrolase  62.84 
 
 		 159 aa  209  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2986  GDP-mannose mannosyl hydrolase  62.84 
 
 		 159 aa  209  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000781604 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1011  GDP-mannose mannosyl hydrolase  62.84 
 
 		 159 aa  209  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01946  hypothetical protein  62.84 
 
 		 159 aa  209  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.666581  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2344  GDP-mannose mannosyl hydrolase  62.84 
 
 		 159 aa  208  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01957  GDP-mannose mannosyl hydrolase  62.84 
 
 		 159 aa  209  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.677204  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1181  GDP-mannose mannosyl hydrolase  62.84 
 
 		 159 aa  208  3e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1314  NUDIX hydrolase  49.66 
 
 		 152 aa  159  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0765  GDP-mannose mannosyl hydrolase  49.65 
 
 		 156 aa  149  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.449279  normal  0.229947 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0813  NUDIX hydrolase  48 
 
 		 151 aa  143  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3872  putative GDP-mannose mannosyl hydrolase  48.61 
 
 		 150 aa  141  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1071  putative NUDIX hydrolase  45.21 
 
 		 156 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.770563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2478  NUDIX hydrolase  48.53 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.78679  normal  0.863391 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1795  GDP-mannose mannosyl hydrolase  45.37 
 
 		 116 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3174  NUDIX hydrolase  38.15 
 
 		 187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.79931  normal  0.153515 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07251  hypothetical protein  38.85 
 
 		 161 aa  107  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1218  NUDIX hydrolase  38.02 
 
 		 142 aa  93.6  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5226  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35623  predicted protein  27.81 
 
 		 233 aa  52.4  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.659171  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 		 154 aa  52  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 162 aa  51.2  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  30.69 
 
 		 345 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_003296  RS05360  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  30.69 
 
 		 345 aa  48.1  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27190  predicted protein  23.28 
 
 		 214 aa  47  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0120784 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_94153  predicted protein  23.28 
 
 		 214 aa  47  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0183016 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  38.71 
 
 		 346 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  38.71 
 
 		 346 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  38.71 
 
 		 346 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  38.71 
 
 		 346 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  38.71 
 
 		 346 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  24.59 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  38.71 
 
 		 346 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  26.92 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  30.49 
 
 		 141 aa  44.3  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  36.23 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  23.2 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  35.44 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  30.61 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  29.47 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  43.14 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0205  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  24.84 
 
 		 338 aa  42.4  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.445871 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  27.87 
 
 		 158 aa  42  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1851  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  30.77 
 
 		 362 aa  42  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  29 
 
 		 159 aa  42  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  29.7 
 
 		 139 aa  42  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  30 
 
 		 148 aa  42  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  25.37 
 
 		 163 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  25.19 
 
 		 240 aa  41.6  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20801  adenine glycosylase  28.89 
 
 		 384 aa  41.6  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  32.47 
 
 		 163 aa  41.6  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  25 
 
 		 147 aa  41.6  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  29.57 
 
 		 134 aa  41.2  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  43.66 
 
 		 143 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  26.19 
 
 		 152 aa  40.8  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 151 aa  40.8  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2204  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  32.32 
 
 		 349 aa  40.8  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.5504  decreased coverage  0.00753224 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1913  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  32.32 
 
 		 355 aa  40.4  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.680637  decreased coverage  0.0000316043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>