153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1590 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_1590  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 159 aa  327  4e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1011  GDP-mannose mannosyl hydrolase  98.11 
 
 		 159 aa  323  9e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01957  GDP-mannose mannosyl hydrolase  97.48 
 
 		 159 aa  320  3e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.677204  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01946  hypothetical protein  97.48 
 
 		 159 aa  320  3e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.666581  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2986  GDP-mannose mannosyl hydrolase  96.86 
 
 		 159 aa  319  9.999999999999999e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000781604 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1606  NUDIX hydrolase  96.23 
 
 		 160 aa  318  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1559  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2344  GDP-mannose mannosyl hydrolase  95.6 
 
 		 159 aa  317  5e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1181  GDP-mannose mannosyl hydrolase  95.6 
 
 		 159 aa  315  1e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2665  NUDIX hydrolase  79.49 
 
 		 159 aa  266  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.523325 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2447  GDP-mannose mannosyl hydrolase  77.27 
 
 		 157 aa  255  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00981768 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2340  GDP-mannose mannosyl hydrolase  77.27 
 
 		 157 aa  255  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2289  GDP-mannose mannosyl hydrolase  77.27 
 
 		 157 aa  255  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337453 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2333  GDP-mannose mannosyl hydrolase  77.27 
 
 		 157 aa  255  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.32489 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2232  GDP-mannose mannosyl hydrolase  76.62 
 
 		 157 aa  253  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2966  gdp-mannose mannosyl hydrolase  62.84 
 
 		 169 aa  209  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000202187 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1314  NUDIX hydrolase  52.03 
 
 		 152 aa  173  7e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0765  GDP-mannose mannosyl hydrolase  53.69 
 
 		 156 aa  163  6.9999999999999995e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.449279  normal  0.229947 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0813  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 151 aa  155  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3872  putative GDP-mannose mannosyl hydrolase  49.66 
 
 		 150 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1071  putative NUDIX hydrolase  50.35 
 
 		 156 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.770563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2478  NUDIX hydrolase  49.26 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.78679  normal  0.863391 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1795  GDP-mannose mannosyl hydrolase  44.95 
 
 		 116 aa  106  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07251  hypothetical protein  36.08 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3174  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 		 187 aa  95.1  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.79931  normal  0.153515 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1218  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 		 142 aa  87  9e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5226  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35623  predicted protein  33.78 
 
 		 233 aa  64.3  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.659171  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  38.68 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  37.38 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 		 138 aa  52.4  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27190  predicted protein  24.7 
 
 		 214 aa  52  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0120784 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_94153  predicted protein  24.7 
 
 		 214 aa  52  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0183016 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 		 141 aa  52  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1319  NUDIX hydrolase  28.99 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  27.5 
 
 		 138 aa  50.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0631  NUDIX hydrolase  31.09 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  41.94 
 
 		 346 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3231  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  30.77 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05360  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  31.03 
 
 		 345 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  41.94 
 
 		 346 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  31.03 
 
 		 345 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  41.94 
 
 		 346 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  41.94 
 
 		 346 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  25.95 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  42.62 
 
 		 346 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  41.94 
 
 		 346 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  31.73 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  31.25 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  29.46 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  28.72 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  29.9 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 		 133 aa  47.4  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 		 162 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  29.67 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  32.26 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  29.31 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  28.33 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  29.06 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  30 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  30.84 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  24.63 
 
 		 363 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  34.29 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03438  MutT-nudix family protein  30.58 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2881  NUDIX hydrolase  26.21 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.603249  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1648  NUDIX hydrolase  37.33 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000051086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  43.4 
 
 		 325 aa  45.1  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  32.29 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 143 aa  45.1  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 252 aa  44.7  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 		 153 aa  44.7  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1522  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  31.19 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.596031  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2765  NUDIX hydrolase  31.19 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000522672  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1206  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 		 154 aa  43.9  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.483034 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  30.41 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  30.56 
 
 		 142 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1851  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  29.63 
 
 		 362 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289338 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2686  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  31.19 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310131  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 172 aa  43.9  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1913  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  30.39 
 
 		 355 aa  42.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.680637  decreased coverage  0.0000316043 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0490  NUDIX/MutT family protein  34.69 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000225283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  31.25 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  25 
 
 		 352 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  26.45 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>