200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1218 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1218  NUDIX hydrolase  100 
 
 
142 aa  294  3e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2966  gdp-mannose mannosyl hydrolase  38.02 
 
 
169 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000202187 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0765  GDP-mannose mannosyl hydrolase  38.02 
 
 
156 aa  90.9  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.449279  normal  0.229947 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1314  NUDIX hydrolase  40 
 
 
152 aa  90.1  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2289  GDP-mannose mannosyl hydrolase  36.22 
 
 
157 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00337453 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2344  GDP-mannose mannosyl hydrolase  38.58 
 
 
159 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2447  GDP-mannose mannosyl hydrolase  36.22 
 
 
157 aa  88.2  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00981768 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2232  GDP-mannose mannosyl hydrolase  36.22 
 
 
157 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1606  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 
160 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1559  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2333  GDP-mannose mannosyl hydrolase  36.22 
 
 
157 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.32489 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2986  GDP-mannose mannosyl hydrolase  37.8 
 
 
159 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000781604 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1011  GDP-mannose mannosyl hydrolase  37.8 
 
 
159 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01957  GDP-mannose mannosyl hydrolase  37.8 
 
 
159 aa  87  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.677204  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01946  hypothetical protein  37.8 
 
 
159 aa  87  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.666581  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1590  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 
159 aa  87  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1181  GDP-mannose mannosyl hydrolase  37.01 
 
 
159 aa  86.3  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2340  GDP-mannose mannosyl hydrolase  35.43 
 
 
157 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2665  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
159 aa  85.1  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.523325 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1071  putative NUDIX hydrolase  41.32 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.770563  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2478  NUDIX hydrolase  41.32 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.78679  normal  0.863391 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0813  NUDIX hydrolase  36.29 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3872  putative GDP-mannose mannosyl hydrolase  36.29 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3174  NUDIX hydrolase  36.55 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.79931  normal  0.153515 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07251  hypothetical protein  30.67 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5226  NUDIX hydrolase  28.89 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1795  GDP-mannose mannosyl hydrolase  40 
 
 
116 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 
154 aa  63.5  0.0000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  34.62 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  33.98 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
142 aa  56.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3735  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225323  normal  0.0224859 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  30.68 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  30.17 
 
 
179 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35623  predicted protein  37.23 
 
 
233 aa  52.4  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.659171  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  30.7 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  31.25 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  30 
 
 
171 aa  52  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  31.25 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  31.25 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  33.02 
 
 
171 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05360  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  40.91 
 
 
345 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  40.91 
 
 
346 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  40.91 
 
 
345 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  27.59 
 
 
135 aa  52  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  30 
 
 
171 aa  51.6  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 
178 aa  51.6  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 
136 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 
143 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1410  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 
212 aa  50.8  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  25.76 
 
 
153 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  29.36 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1648  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
172 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000051086  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  42.37 
 
 
346 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  42.37 
 
 
346 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  42.37 
 
 
346 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 
165 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2121  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575199  decreased coverage  0.00514227 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  42.37 
 
 
346 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  43.28 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0988  NUDIX hydrolase  43.28 
 
 
150 aa  48.9  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000252657  hitchhiker  0.00430366 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 
161 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  40.68 
 
 
346 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  31.63 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  27.97 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 
167 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 
167 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04292  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35.44 
 
 
351 aa  47.4  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
149 aa  47.4  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 
153 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  37.68 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  28.95 
 
 
138 aa  47  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  35.64 
 
 
163 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  40.3 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  32.29 
 
 
135 aa  45.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  30.7 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 
236 aa  46.2  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  39.44 
 
 
347 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1829  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000906254  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  27.72 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1205  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  30.49 
 
 
384 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3657  NUDIX hydrolase  28.83 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  39.44 
 
 
229 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  35.53 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1851  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35.82 
 
 
362 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289338 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1282  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.838379  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  27.97 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  28.83 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  40.85 
 
 
229 aa  44.3  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  28.83 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>