187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3872 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3872  putative GDP-mannose mannosyl hydrolase  100 
 
 		 150 aa  302  8.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0813  NUDIX hydrolase  90 
 
 		 151 aa  279  8.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2478  NUDIX hydrolase  71.74 
 
 		 138 aa  202  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.78679  normal  0.863391 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2289  GDP-mannose mannosyl hydrolase  52.35 
 
 		 157 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337453 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2333  GDP-mannose mannosyl hydrolase  52.35 
 
 		 157 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.32489 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2340  GDP-mannose mannosyl hydrolase  52.35 
 
 		 157 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2232  GDP-mannose mannosyl hydrolase  52.35 
 
 		 157 aa  154  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2447  GDP-mannose mannosyl hydrolase  51.68 
 
 		 157 aa  154  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00981768 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2986  GDP-mannose mannosyl hydrolase  51.68 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000781604 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2344  GDP-mannose mannosyl hydrolase  51.68 
 
 		 159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1011  GDP-mannose mannosyl hydrolase  51.01 
 
 		 159 aa  150  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01957  GDP-mannose mannosyl hydrolase  51.01 
 
 		 159 aa  150  8e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.677204  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01946  hypothetical protein  51.01 
 
 		 159 aa  150  8e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.666581  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1181  GDP-mannose mannosyl hydrolase  51.01 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1590  NUDIX hydrolase  49.66 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2665  NUDIX hydrolase  48.99 
 
 		 159 aa  147  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.523325 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1606  NUDIX hydrolase  49.66 
 
 		 160 aa  146  8e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1559  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1071  putative NUDIX hydrolase  52.45 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.770563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0765  GDP-mannose mannosyl hydrolase  45.33 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.449279  normal  0.229947 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2966  gdp-mannose mannosyl hydrolase  48.61 
 
 		 169 aa  141  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000202187 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1314  NUDIX hydrolase  47.55 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07251  hypothetical protein  35.44 
 
 		 161 aa  102  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1795  GDP-mannose mannosyl hydrolase  43.64 
 
 		 116 aa  90.9  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3174  NUDIX hydrolase  38.06 
 
 		 187 aa  87.8  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.79931  normal  0.153515 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1218  NUDIX hydrolase  36.29 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5226  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2881  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.603249  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27190  predicted protein  38.89 
 
 		 214 aa  51.6  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0120784 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_94153  predicted protein  38.89 
 
 		 214 aa  51.6  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0183016 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 142 aa  50.8  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  30.17 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  33.71 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  39.77 
 
 		 313 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  40.91 
 
 		 347 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00160  ADP-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119195 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  49.02 
 
 		 318 aa  47.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  36.36 
 
 		 314 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  26.23 
 
 		 231 aa  47  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  36.36 
 
 		 314 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  38.57 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36 
 
 		 346 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36 
 
 		 346 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  28.79 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36 
 
 		 346 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  27.45 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36 
 
 		 346 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36 
 
 		 346 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  32.99 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  38.1 
 
 		 346 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  40.91 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  39.73 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2686  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 		 182 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  35.23 
 
 		 314 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1689  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  31.73 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  28.23 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  28.95 
 
 		 179 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  38.57 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  35.23 
 
 		 314 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1319  NUDIX hydrolase  28.33 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  37.68 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  40.28 
 
 		 316 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  29.07 
 
 		 360 aa  43.9  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  36.36 
 
 		 316 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  46 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 		 147 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1522  NUDIX hydrolase  34.26 
 
 		 137 aa  43.5  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.241436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  28.57 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  36.49 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  30.36 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  28.57 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  31.78 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  44.23 
 
 		 320 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  27.68 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.271048 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>