30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2881 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2881  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 179 aa  363  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.603249  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3872  putative GDP-mannose mannosyl hydrolase  35.14 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0813  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1314  NUDIX hydrolase  28.81 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1071  putative NUDIX hydrolase  37.68 
 
 		 156 aa  48.5  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.770563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2232  GDP-mannose mannosyl hydrolase  27.94 
 
 		 157 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2340  GDP-mannose mannosyl hydrolase  27.21 
 
 		 157 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2289  GDP-mannose mannosyl hydrolase  27.21 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337453 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2047  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 156 aa  45.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2447  GDP-mannose mannosyl hydrolase  27.21 
 
 		 157 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00981768 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2333  GDP-mannose mannosyl hydrolase  27.21 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.32489 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1590  NUDIX hydrolase  26.21 
 
 		 159 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 		 150 aa  45.1  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 150 aa  43.9  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2665  NUDIX hydrolase  26.21 
 
 		 159 aa  44.3  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.523325 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3735  NUDIX hydrolase  28.43 
 
 		 145 aa  44.3  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225323  normal  0.0224859 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1011  GDP-mannose mannosyl hydrolase  25.24 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01957  GDP-mannose mannosyl hydrolase  25.24 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.677204  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1606  NUDIX hydrolase  25.24 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1559  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01946  hypothetical protein  25.24 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.666581  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0883  NUDIX hydrolase  30.85 
 
 		 151 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 		 149 aa  43.5  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2986  GDP-mannose mannosyl hydrolase  25.24 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000781604 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0765  GDP-mannose mannosyl hydrolase  28.04 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.449279  normal  0.229947 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2344  GDP-mannose mannosyl hydrolase  25.24 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2478  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 138 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.78679  normal  0.863391 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  28.41 
 
 		 135 aa  42  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1181  GDP-mannose mannosyl hydrolase  25.24 
 
 		 159 aa  42  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 171 aa  42  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0189  NUDIX hydrolase  32.97 
 
 		 223 aa  42  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>