37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3735 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3735  NUDIX hydrolase  100 
 
 
145 aa  295  2e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225323  normal  0.0224859 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  29.84 
 
 
171 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 
171 aa  63.9  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 
171 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  29.08 
 
 
150 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1218  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  27.13 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  27.13 
 
 
135 aa  51.2  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0988  NUDIX hydrolase  27.86 
 
 
150 aa  48.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000252657  hitchhiker  0.00430366 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  24.22 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5152  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000414992 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 
150 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1829  NUDIX hydrolase  26.98 
 
 
150 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000906254  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  26.15 
 
 
149 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1823  NUDIX hydrolase  25.98 
 
 
143 aa  47  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.24885  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  29.46 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  29.13 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2639  NUDIX hydrolase  27.87 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3464  NUDIX hydrolase  27.87 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
179 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  22.97 
 
 
153 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  26.77 
 
 
139 aa  44.3  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2881  NUDIX hydrolase  28.43 
 
 
179 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.603249  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1187  NUDIX hydrolase  25.6 
 
 
143 aa  43.5  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  31.37 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  27.34 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 
154 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2195  NUDIX hydrolase  28.44 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  34.78 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  27.2 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  27.42 
 
 
157 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 
190 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0765  GDP-mannose mannosyl hydrolase  29.66 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.449279  normal  0.229947 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  33.33 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 
156 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1061  NUDIX hydrolase  25 
 
 
179 aa  40.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>