73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1071 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1071  putative NUDIX hydrolase  100 
 
 		 156 aa  323  7e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.770563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2340  GDP-mannose mannosyl hydrolase  51.75 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2333  GDP-mannose mannosyl hydrolase  51.75 
 
 		 157 aa  150  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.32489 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2289  GDP-mannose mannosyl hydrolase  51.05 
 
 		 157 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337453 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2232  GDP-mannose mannosyl hydrolase  51.05 
 
 		 157 aa  148  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1314  NUDIX hydrolase  49.31 
 
 		 152 aa  148  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2447  GDP-mannose mannosyl hydrolase  50.35 
 
 		 157 aa  147  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00981768 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2665  NUDIX hydrolase  51.05 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.523325 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3872  putative GDP-mannose mannosyl hydrolase  52.45 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2986  GDP-mannose mannosyl hydrolase  49.65 
 
 		 159 aa  144  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000781604 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1590  NUDIX hydrolase  50.35 
 
 		 159 aa  143  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2344  GDP-mannose mannosyl hydrolase  49.65 
 
 		 159 aa  143  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1181  GDP-mannose mannosyl hydrolase  49.65 
 
 		 159 aa  143  8.000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1606  NUDIX hydrolase  48.95 
 
 		 160 aa  142  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1559  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1011  GDP-mannose mannosyl hydrolase  49.65 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0813  NUDIX hydrolase  50.35 
 
 		 151 aa  140  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01946  hypothetical protein  48.95 
 
 		 159 aa  140  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.666581  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01957  GDP-mannose mannosyl hydrolase  48.95 
 
 		 159 aa  140  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.677204  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2966  gdp-mannose mannosyl hydrolase  45.21 
 
 		 169 aa  137  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000202187 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2478  NUDIX hydrolase  54.74 
 
 		 138 aa  137  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.78679  normal  0.863391 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0765  GDP-mannose mannosyl hydrolase  44.16 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.449279  normal  0.229947 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1795  GDP-mannose mannosyl hydrolase  48.18 
 
 		 116 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3174  NUDIX hydrolase  40.37 
 
 		 187 aa  97.4  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.79931  normal  0.153515 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07251  hypothetical protein  37.11 
 
 		 161 aa  94.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1218  NUDIX hydrolase  41.32 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5226  NUDIX hydrolase  29.85 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2881  NUDIX hydrolase  37.68 
 
 		 179 aa  48.5  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.603249  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  32.98 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27190  predicted protein  32.86 
 
 		 214 aa  45.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0120784 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_94153  predicted protein  32.86 
 
 		 214 aa  45.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0183016 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3657  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 		 161 aa  43.9  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  31.63 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2824  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  38.75 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35623  predicted protein  28.72 
 
 		 233 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.659171  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  30.59 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  30.39 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  30.08 
 
 		 139 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0500  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 		 152 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0475  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 		 152 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  46 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  38.18 
 
 		 346 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  38.18 
 
 		 346 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  38.18 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  38.18 
 
 		 346 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  38.18 
 
 		 346 aa  41.6  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 		 171 aa  41.6  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  38.18 
 
 		 346 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  27.66 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  34.09 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  34.09 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  34.09 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  34.09 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  34.09 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  32.58 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  34.44 
 
 		 171 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  38.18 
 
 		 346 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 		 180 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  30.49 
 
 		 167 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  30.49 
 
 		 167 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>