61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_07251 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_07251  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  330  4e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1314  NUDIX hydrolase  39.51 
 
 
152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0813  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 
151 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2966  gdp-mannose mannosyl hydrolase  38.85 
 
 
169 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000202187 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2665  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 
159 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.523325 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3872  putative GDP-mannose mannosyl hydrolase  35.44 
 
 
150 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1590  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 
159 aa  102  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1606  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 
160 aa  101  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1559  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2478  NUDIX hydrolase  39.31 
 
 
138 aa  101  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.78679  normal  0.863391 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1011  GDP-mannose mannosyl hydrolase  34.81 
 
 
159 aa  100  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2986  GDP-mannose mannosyl hydrolase  34.81 
 
 
159 aa  100  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000781604 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2232  GDP-mannose mannosyl hydrolase  35.22 
 
 
157 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2340  GDP-mannose mannosyl hydrolase  35.44 
 
 
157 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2344  GDP-mannose mannosyl hydrolase  34.81 
 
 
159 aa  100  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01946  hypothetical protein  36.25 
 
 
159 aa  100  9e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.666581  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2447  GDP-mannose mannosyl hydrolase  35.44 
 
 
157 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00981768 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01957  GDP-mannose mannosyl hydrolase  36.25 
 
 
159 aa  100  9e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.677204  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2333  GDP-mannose mannosyl hydrolase  35.44 
 
 
157 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.32489 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2289  GDP-mannose mannosyl hydrolase  35.44 
 
 
157 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00337453 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0765  GDP-mannose mannosyl hydrolase  39.24 
 
 
156 aa  99.4  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.449279  normal  0.229947 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1181  GDP-mannose mannosyl hydrolase  34.18 
 
 
159 aa  98.6  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1071  putative NUDIX hydrolase  37.11 
 
 
156 aa  94.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.770563  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3174  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 
187 aa  90.5  9e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.79931  normal  0.153515 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1218  NUDIX hydrolase  30.67 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1795  GDP-mannose mannosyl hydrolase  33.91 
 
 
116 aa  63.9  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5226  NUDIX hydrolase  27.45 
 
 
150 aa  58.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27190  predicted protein  25.62 
 
 
214 aa  51.6  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0120784 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_94153  predicted protein  25.62 
 
 
214 aa  51.6  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0183016 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  29.13 
 
 
179 aa  50.8  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  27.36 
 
 
149 aa  49.7  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  27.37 
 
 
144 aa  48.5  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 
141 aa  47.4  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35623  predicted protein  28.57 
 
 
233 aa  47.8  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.659171  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  30.21 
 
 
152 aa  47  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  27.35 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  25.49 
 
 
181 aa  45.8  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  26.8 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
154 aa  44.7  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 
171 aa  43.9  0.0009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 
180 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1089  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  27.08 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  25.89 
 
 
147 aa  43.9  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 
138 aa  43.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  23.76 
 
 
163 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  25.89 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 
147 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
171 aa  42.4  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  25.77 
 
 
167 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  25.77 
 
 
167 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 
145 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  24.74 
 
 
162 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  28.87 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  27.38 
 
 
161 aa  41.6  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  26.8 
 
 
142 aa  41.6  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3208  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 
168 aa  41.2  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135414  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  26.8 
 
 
142 aa  41.2  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6285  cytidyltransferase-related domain protein  27.27 
 
 
358 aa  40.4  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000881728  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 
143 aa  40.4  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  35 
 
 
139 aa  40.4  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>