29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1795 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1795  GDP-mannose mannosyl hydrolase  100 
 
 		 116 aa  245  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1314  NUDIX hydrolase  44.14 
 
 		 152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2665  NUDIX hydrolase  48.62 
 
 		 159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.523325 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2447  GDP-mannose mannosyl hydrolase  47.75 
 
 		 157 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00981768 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2333  GDP-mannose mannosyl hydrolase  46.43 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.32489 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2289  GDP-mannose mannosyl hydrolase  46.85 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337453 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2340  GDP-mannose mannosyl hydrolase  46.85 
 
 		 157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2966  gdp-mannose mannosyl hydrolase  45.37 
 
 		 169 aa  108  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000202187 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2232  GDP-mannose mannosyl hydrolase  46.85 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1606  NUDIX hydrolase  44.95 
 
 		 160 aa  107  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1559  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1590  NUDIX hydrolase  44.95 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1011  GDP-mannose mannosyl hydrolase  44.95 
 
 		 159 aa  105  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01957  GDP-mannose mannosyl hydrolase  44.95 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.677204  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01946  hypothetical protein  44.95 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.666581  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2986  GDP-mannose mannosyl hydrolase  44.04 
 
 		 159 aa  103  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000781604 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2344  GDP-mannose mannosyl hydrolase  44.04 
 
 		 159 aa  103  9e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1181  GDP-mannose mannosyl hydrolase  44.04 
 
 		 159 aa  103  9e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1071  putative NUDIX hydrolase  48.18 
 
 		 156 aa  100  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.770563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0765  GDP-mannose mannosyl hydrolase  46.3 
 
 		 156 aa  94.7  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.449279  normal  0.229947 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3872  putative GDP-mannose mannosyl hydrolase  43.64 
 
 		 150 aa  90.9  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2478  NUDIX hydrolase  44.55 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.78679  normal  0.863391 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0813  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 		 151 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3174  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.79931  normal  0.153515 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1218  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07251  hypothetical protein  33.91 
 
 		 161 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00160  ADP-ribose pyrophosphatase  26.88 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119195 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5226  NUDIX hydrolase  25.44 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>