115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0813 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0813  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 151 aa  307  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3872  putative GDP-mannose mannosyl hydrolase  90 
 
 		 150 aa  279  9e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2478  NUDIX hydrolase  71.01 
 
 		 138 aa  204  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.78679  normal  0.863391 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2447  GDP-mannose mannosyl hydrolase  53.33 
 
 		 157 aa  163  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00981768 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2340  GDP-mannose mannosyl hydrolase  54.3 
 
 		 157 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2289  GDP-mannose mannosyl hydrolase  52.67 
 
 		 157 aa  161  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337453 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2333  GDP-mannose mannosyl hydrolase  52.67 
 
 		 157 aa  161  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.32489 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2232  GDP-mannose mannosyl hydrolase  52.67 
 
 		 157 aa  160  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2986  GDP-mannose mannosyl hydrolase  51.33 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000781604 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1590  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 159 aa  155  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1011  GDP-mannose mannosyl hydrolase  50.67 
 
 		 159 aa  154  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01957  GDP-mannose mannosyl hydrolase  50.67 
 
 		 159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.677204  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2344  GDP-mannose mannosyl hydrolase  50.67 
 
 		 159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01946  hypothetical protein  50.67 
 
 		 159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.666581  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1181  GDP-mannose mannosyl hydrolase  50.67 
 
 		 159 aa  153  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1606  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1559  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2665  NUDIX hydrolase  50.33 
 
 		 159 aa  151  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.523325 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0765  GDP-mannose mannosyl hydrolase  46.67 
 
 		 156 aa  147  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.449279  normal  0.229947 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2966  gdp-mannose mannosyl hydrolase  48 
 
 		 169 aa  143  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000202187 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1071  putative NUDIX hydrolase  50.35 
 
 		 156 aa  140  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.770563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1314  NUDIX hydrolase  48.25 
 
 		 152 aa  140  9e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07251  hypothetical protein  37.11 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3174  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 		 187 aa  91.7  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.79931  normal  0.153515 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1795  GDP-mannose mannosyl hydrolase  41.82 
 
 		 116 aa  87.8  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1218  NUDIX hydrolase  36.29 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5226  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2881  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.603249  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  35.09 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  35.09 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  35.09 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  37.33 
 
 		 346 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  37.33 
 
 		 346 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00160  ADP-ribose pyrophosphatase  33.08 
 
 		 143 aa  48.5  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119195 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  37.33 
 
 		 346 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  25.87 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  37.33 
 
 		 346 aa  48.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  37.33 
 
 		 346 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27190  predicted protein  37.04 
 
 		 214 aa  47.8  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0120784 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_94153  predicted protein  37.04 
 
 		 214 aa  47.8  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0183016 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  30.17 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  39.68 
 
 		 346 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  40.91 
 
 		 347 aa  47.4  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  29.31 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  35.23 
 
 		 314 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  32.58 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  31.46 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  31.48 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  30.19 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  35.71 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  32.29 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  34.09 
 
 		 314 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  32.95 
 
 		 314 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_003296  RS05360  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  34.67 
 
 		 345 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  34.67 
 
 		 345 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  28.07 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  25.89 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  28.87 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  29.81 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  26.47 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 		 199 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  28.57 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  37.93 
 
 		 184 aa  42  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  26.52 
 
 		 148 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  33.68 
 
 		 135 aa  42  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  29.79 
 
 		 136 aa  42  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  31.33 
 
 		 139 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 		 149 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  41.18 
 
 		 316 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2251  NUDIX hydrolase  32.05 
 
 		 158 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  29.75 
 
 		 334 aa  41.2  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  41.18 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  33.71 
 
 		 313 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  30.48 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  30.34 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1319  NUDIX hydrolase  27.97 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  29.09 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  35.71 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  31.82 
 
 		 314 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1569  hypothetical protein  26.36 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  28.7 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  37.25 
 
 		 314 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  38.55 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  29.57 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 165 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  26.55 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  43.14 
 
 		 318 aa  41.2  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 229 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  30.68 
 
 		 315 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2686  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 182 aa  40.4  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>