133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1569 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1569  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  332  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218097  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  29.66 
 
 
148 aa  55.8  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2251  NUDIX hydrolase  29.84 
 
 
158 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03438  MutT-nudix family protein  32.85 
 
 
149 aa  55.8  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
162 aa  55.1  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  32.38 
 
 
136 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  32.38 
 
 
136 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  32.38 
 
 
136 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1479  NUDIX hydrolase  27.94 
 
 
135 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142432  hitchhiker  0.00620383 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  27.27 
 
 
137 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2466  hypothetical protein  35.66 
 
 
136 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2716  MutT/NUDIX family protein  31.03 
 
 
137 aa  50.8  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1805  NADH pyrophosphatase  42.25 
 
 
308 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106205  normal  0.106222 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2121  NUDIX hydrolase  29.25 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575199  decreased coverage  0.00514227 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  40.71 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  36.94 
 
 
314 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7624  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
169 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2491  NUDIX hydrolase  47.22 
 
 
138 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 
150 aa  49.7  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4662  NADH pyrophosphatase  38.71 
 
 
308 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836669  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  36.94 
 
 
314 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0673  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.612507  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2686  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  32.73 
 
 
151 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310131  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 
153 aa  48.9  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  28.7 
 
 
134 aa  48.5  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  36.04 
 
 
314 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1522  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  32.73 
 
 
151 aa  47.8  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.596031  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2765  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 
151 aa  47.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000522672  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
136 aa  47.8  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 
140 aa  47.8  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  33.91 
 
 
137 aa  47.8  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0215  ADP-ribose pyrophosphatase  28.68 
 
 
173 aa  47.4  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0696282  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4845  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 
298 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1680  hypothetical protein  31.25 
 
 
269 aa  47  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0533  NUDIX hydrolase  26.47 
 
 
140 aa  47  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0228598  normal  0.521082 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1914  NUDIX hydrolase  27.96 
 
 
149 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.977797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5152  NUDIX hydrolase  27.41 
 
 
144 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000414992 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2666  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 
182 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
261 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28290  hypothetical protein  34.96 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00379954  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13222  NADH pyrophosphatase  40.85 
 
 
313 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.861891 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  31.11 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  35.14 
 
 
314 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  33.87 
 
 
318 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  28.89 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1133  putative phosphatase  40 
 
 
180 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0118269 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 
140 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 
132 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2376  NUDIX hydrolase  29.32 
 
 
197 aa  44.7  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  0.316272 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  38.98 
 
 
459 aa  45.1  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3733  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  33.9 
 
 
150 aa  44.7  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0829824  normal  0.0242018 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  26.03 
 
 
151 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  26.03 
 
 
151 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04480  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  34.13 
 
 
200 aa  44.3  0.0009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1689  NUDIX hydrolase  27.37 
 
 
140 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1407  NADH pyrophosphatase  38.03 
 
 
311 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1425  NADH pyrophosphatase  38.03 
 
 
311 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1582  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  34.48 
 
 
181 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.196336  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3868  NADH pyrophosphatase  29.41 
 
 
257 aa  43.9  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1461  NADH pyrophosphatase  38.03 
 
 
311 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086002  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3231  NUDIX hydrolase  25.6 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  27.66 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  27.52 
 
 
164 aa  43.9  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  48.33 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2639  NUDIX hydrolase  26.06 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0697  MutT related protein  42.59 
 
 
145 aa  43.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  normal  0.361701 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  44.9 
 
 
314 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4127  NUDIX hydrolase  28.21 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317777  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4236  NAD(+) diphosphatase  29.91 
 
 
321 aa  43.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0400368  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0346  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 
182 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0239643 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2346  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1029  NUDIX hydrolase  39.25 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  29.63 
 
 
140 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  29.63 
 
 
140 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3464  NUDIX hydrolase  26.95 
 
 
148 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0622  mutT/nudix family protein  29.63 
 
 
140 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  37.5 
 
 
365 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1582  NUDIX hydrolase  31.48 
 
 
261 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  37.61 
 
 
139 aa  42.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  35.63 
 
 
130 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.77 
 
 
135 aa  42.4  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2457  NUDIX hydrolase  25.17 
 
 
147 aa  42.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0350138  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  31.82 
 
 
141 aa  42.4  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  35 
 
 
159 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  35 
 
 
159 aa  42  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  39.74 
 
 
153 aa  42  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  30.77 
 
 
132 aa  42  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  42.19 
 
 
320 aa  41.6  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3020  dinucleoside polyphosphate hydrolase  26.56 
 
 
167 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.614658  normal  0.0272519 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3745  NAD(+) diphosphatase  46.48 
 
 
303 aa  41.6  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00545287  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1821  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  41.27 
 
 
209 aa  41.6  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2595  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 
148 aa  41.6  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
155 aa  41.6  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4889  hypothetical protein  31.15 
 
 
337 aa  41.6  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
147 aa  41.6  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 
130 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>