270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2246 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2246  thiamine monophosphate synthase  100 
 
 
194 aa  378  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0548714 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5573  thiamine monophosphate synthase  84.02 
 
 
194 aa  296  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173749  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3747  thiamine monophosphate synthase  84.02 
 
 
194 aa  292  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.907624  normal  0.127935 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4514  thiamine monophosphate synthase  92.27 
 
 
194 aa  291  6e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3850  thiamine monophosphate synthase  92.27 
 
 
194 aa  291  6e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3677  thiamine monophosphate synthase  92.27 
 
 
194 aa  291  6e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.62971  normal  0.140239 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4895  thiamine monophosphate synthase  81.96 
 
 
194 aa  262  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166292 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE, putative  62.63 
 
 
196 aa  193  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0287  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  63.16 
 
 
196 aa  191  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0878  dGTP-pyrophosphohydrolase; thiamine phosphate synthase  63.16 
 
 
196 aa  191  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2440  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  63.16 
 
 
209 aa  191  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363141  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1467  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  63.16 
 
 
209 aa  191  5e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0319  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  63.16 
 
 
209 aa  191  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1664  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  63.16 
 
 
209 aa  191  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2576  thiamine monophosphate synthase  62.63 
 
 
209 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0210  dGTP-pyrophosphohydrolase; thiamine phosphate synthase  45.6 
 
 
212 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0218369  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1618  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.6 
 
 
199 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0984  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase protein  46.11 
 
 
198 aa  149  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.462651 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  46.07 
 
 
314 aa  140  9e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  43.81 
 
 
314 aa  138  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  44.33 
 
 
316 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  42.27 
 
 
315 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  41.8 
 
 
320 aa  133  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  43.3 
 
 
316 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  40.74 
 
 
320 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  46.6 
 
 
322 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  41.24 
 
 
315 aa  131  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  44.27 
 
 
317 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  47.65 
 
 
312 aa  128  6e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  43.81 
 
 
313 aa  127  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  41.75 
 
 
314 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  41.58 
 
 
321 aa  127  8.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  40.21 
 
 
314 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  39.18 
 
 
313 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  40.21 
 
 
314 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  40.74 
 
 
302 aa  125  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  40.21 
 
 
314 aa  124  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  38.95 
 
 
310 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  42.41 
 
 
315 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  38.62 
 
 
318 aa  117  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  39.27 
 
 
306 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  38.92 
 
 
314 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  37.8 
 
 
325 aa  103  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0592  hypothetical protein  34.55 
 
 
316 aa  102  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1996  NUDIX hydrolase  38 
 
 
352 aa  99.8  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.42027  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  42.22 
 
 
329 aa  97.1  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1173  Thiamine-phosphate diphosphorylase  33.33 
 
 
185 aa  93.6  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  41.36 
 
 
316 aa  90.9  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  38.17 
 
 
319 aa  89  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0633  thiamine monophosphate synthase  38.79 
 
 
206 aa  89  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1499  thiamine monophosphate synthase  33.33 
 
 
215 aa  84.7  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0370  Thiamine-phosphate diphosphorylase  28.57 
 
 
183 aa  84.3  9e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380325  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1006  Thiamine-phosphate diphosphorylase  28.95 
 
 
216 aa  78.6  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  38.12 
 
 
213 aa  77.8  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  32.46 
 
 
317 aa  75.9  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0815  thiamine-phosphate pyrophosphorylase, putative  29.41 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.339712  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1405  thiamine monophosphate synthase  29.08 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1283  Thiamine-phosphate diphosphorylase  27.14 
 
 
212 aa  68.2  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.8635  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2096  Thiamine-phosphate diphosphorylase  34.21 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.255661  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3476  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.24 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1531  thiamine monophosphate synthase  25.52 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  36.31 
 
 
329 aa  65.5  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  36.31 
 
 
329 aa  65.5  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  33.16 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0645  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.18 
 
 
216 aa  63.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.77 
 
 
344 aa  63.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2041  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.37 
 
 
208 aa  63.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0587  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.67 
 
 
213 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0370  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.84 
 
 
208 aa  63.2  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  26.7 
 
 
209 aa  62.8  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.67 
 
 
220 aa  62.4  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1604  NUDIX hydrolase  48.33 
 
 
369 aa  62  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000210752  hitchhiker  0.0000224711 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17535  predicted protein  29.17 
 
 
478 aa  62  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.274913 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0607  thiamin biosynthesis protein  34.08 
 
 
208 aa  61.6  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.380998  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0037  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.97 
 
 
206 aa  61.6  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14351  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  20.94 
 
 
353 aa  60.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4341  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.67 
 
 
205 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.61 
 
 
218 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.13 
 
 
379 aa  60.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2484  Thiamine-phosphate diphosphorylase  32.5 
 
 
230 aa  60.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.336638  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1824  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.8 
 
 
222 aa  60.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.106561 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2855  thiamine monophosphate synthase  43.56 
 
 
178 aa  59.7  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0770384  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5258  thiamine monophosphate synthase  32.29 
 
 
192 aa  58.9  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1282  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.19 
 
 
206 aa  58.9  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536618  normal  0.780941 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.27 
 
 
343 aa  58.9  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2395  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.13 
 
 
252 aa  58.5  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.61 
 
 
218 aa  58.5  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  22.65 
 
 
365 aa  58.2  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4827  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.41 
 
 
224 aa  57.8  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2460  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.18 
 
 
409 aa  57.4  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.27 
 
 
228 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4410  thiamine monophosphate synthase  31.79 
 
 
210 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1745  thiamine monophosphate synthase  36.05 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.211367  normal  0.0155398 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4799  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.99 
 
 
205 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2520  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.95 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1502  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.98 
 
 
346 aa  57  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.63479  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.43 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000752501  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1284  thiamine monophosphate synthase  39.83 
 
 
202 aa  56.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0061  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.15 
 
 
205 aa  56.2  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221396  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  24.12 
 
 
360 aa  56.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>