More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1283 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1283  Thiamine-phosphate diphosphorylase  100 
 
 
212 aa  433  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.8635  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1006  Thiamine-phosphate diphosphorylase  55.88 
 
 
216 aa  239  2.9999999999999997e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1531  thiamine monophosphate synthase  49.28 
 
 
212 aa  205  5e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1499  thiamine monophosphate synthase  45.5 
 
 
215 aa  188  5e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1405  thiamine monophosphate synthase  46.83 
 
 
213 aa  186  3e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0959  thiamine-phosphate pyrophosphorylase, putative  44.02 
 
 
214 aa  168  4e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.277889  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0815  thiamine-phosphate pyrophosphorylase, putative  40.19 
 
 
224 aa  155  3e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.339712  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1824  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.09 
 
 
222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.106561 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0037  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.68 
 
 
206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0370  Thiamine-phosphate diphosphorylase  34.41 
 
 
183 aa  128  7.000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380325  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1691  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.5 
 
 
209 aa  126  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0247781  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  39.68 
 
 
213 aa  126  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.77 
 
 
220 aa  121  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.86 
 
 
344 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2520  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.1 
 
 
207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0446  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.54 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.52 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000752501  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1463  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.67 
 
 
211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0645  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.26 
 
 
216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.86 
 
 
221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.040851  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2162  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.02 
 
 
210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00137501  hitchhiker  0.0000728866 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1529  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.14 
 
 
207 aa  115  6e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.691821  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0116  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.98 
 
 
205 aa  114  7.999999999999999e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.71 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.87 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1173  Thiamine-phosphate diphosphorylase  37.5 
 
 
185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0390  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.13 
 
 
207 aa  113  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.312895 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.61 
 
 
218 aa  112  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  38.99 
 
 
212 aa  111  8.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2395  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.15 
 
 
252 aa  111  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.68 
 
 
236 aa  111  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1532  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.89 
 
 
206 aa  109  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1811  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.4 
 
 
221 aa  108  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.645451  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1379  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.26 
 
 
215 aa  108  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000146383  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.36 
 
 
202 aa  108  7.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1712  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.38 
 
 
220 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0573115  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1348  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.71 
 
 
206 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  34.59 
 
 
217 aa  107  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0547  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.18 
 
 
178 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000291317  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3476  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.97 
 
 
223 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.41 
 
 
228 aa  106  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0730  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.24 
 
 
216 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0124065  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  35.26 
 
 
209 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3318  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.1 
 
 
220 aa  106  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.195577  normal  0.0232291 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.64 
 
 
212 aa  106  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0607  thiamin biosynthesis protein  36.81 
 
 
208 aa  105  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.380998  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1500  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.11 
 
 
207 aa  103  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.16 
 
 
206 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0601  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.43 
 
 
356 aa  102  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0461  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.16 
 
 
206 aa  102  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.037147  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0261  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.5 
 
 
211 aa  102  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.243144  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0246  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.51 
 
 
222 aa  102  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0799  transcriptional regulator TenI  35.94 
 
 
206 aa  101  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0773  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.42 
 
 
216 aa  101  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0645  transcriptional regulator TenI  37.37 
 
 
208 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1989  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.11 
 
 
210 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0695  transcriptional regulator TenI  37.17 
 
 
206 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0639  transcriptional regulator TenI  37.17 
 
 
206 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0639  transcriptional regulator TenI  37.17 
 
 
206 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0883  transcriptional regulator TenI  35.94 
 
 
206 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000389091  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0729  transcriptional regulator TenI  37.17 
 
 
206 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0610  transcriptional regulator TenI  37.33 
 
 
202 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0806  transcriptional regulator TenI  37.17 
 
 
206 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.563560000000001e-47 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1414  transcriptional regulator TenI  40.52 
 
 
201 aa  99.8  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4545  transcriptional regulator TenI  37.17 
 
 
206 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467462  normal  0.671743 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1657  hypothetical protein  33.14 
 
 
210 aa  99  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000901813 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1282  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.96 
 
 
206 aa  99.4  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536618  normal  0.780941 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0587  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.7 
 
 
213 aa  99  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0616  transcriptional regulator TenI  34.72 
 
 
206 aa  99  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0209  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.48 
 
 
211 aa  98.6  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.76 
 
 
343 aa  98.6  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.06 
 
 
346 aa  98.6  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3007  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.51 
 
 
213 aa  98.6  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0786  transcriptional regulator TenI  36.32 
 
 
206 aa  98.6  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.520662  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2205  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.09 
 
 
220 aa  97.8  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2484  Thiamine-phosphate diphosphorylase  42.04 
 
 
230 aa  97.8  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.336638  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1558  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.58 
 
 
214 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.536172  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.16 
 
 
219 aa  97.4  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3508  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.18 
 
 
223 aa  97.8  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0511603  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1683  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.16 
 
 
218 aa  96.7  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000047745  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0604  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.54 
 
 
536 aa  97.1  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1155  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.8 
 
 
197 aa  96.7  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149529  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0093  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.69 
 
 
222 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000282535  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0075  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.46 
 
 
222 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1337  Thiamine-phosphate diphosphorylase  36.08 
 
 
203 aa  95.9  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0081  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.69 
 
 
215 aa  95.9  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2471  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.58 
 
 
219 aa  95.9  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0403  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.1 
 
 
211 aa  95.1  7e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.647684  normal  0.48024 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1918  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.54 
 
 
212 aa  94  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.4 
 
 
365 aa  93.2  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0061  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.58 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221396  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0797  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.95 
 
 
217 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.961406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.21 
 
 
379 aa  92.8  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  44.26 
 
 
492 aa  92.4  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2096  Thiamine-phosphate diphosphorylase  35.75 
 
 
208 aa  92.8  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.255661  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.81 
 
 
223 aa  92.4  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.52 
 
 
206 aa  92.4  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0076  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.65 
 
 
215 aa  90.9  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0077197  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2056  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.62 
 
 
216 aa  90.9  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.343455 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3406  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.81 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>