More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0370 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0370  Thiamine-phosphate diphosphorylase  100 
 
 
183 aa  365  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380325  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.59 
 
 
220 aa  135  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  37.99 
 
 
213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3476  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.31 
 
 
223 aa  129  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1173  Thiamine-phosphate diphosphorylase  37.16 
 
 
185 aa  129  3e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1283  Thiamine-phosphate diphosphorylase  34.41 
 
 
212 aa  128  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.8635  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.7 
 
 
218 aa  123  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1006  Thiamine-phosphate diphosphorylase  34.41 
 
 
216 aa  123  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0037  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.02 
 
 
206 aa  122  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0959  thiamine-phosphate pyrophosphorylase, putative  40.67 
 
 
214 aa  122  4e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.277889  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0607  thiamin biosynthesis protein  38.41 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.380998  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.15 
 
 
218 aa  119  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.43 
 
 
228 aa  117  7.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.43 
 
 
236 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2520  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.76 
 
 
207 aa  115  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1405  thiamine monophosphate synthase  38.06 
 
 
213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1824  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.26 
 
 
222 aa  114  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.106561 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1531  thiamine monophosphate synthase  37.42 
 
 
212 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0116  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.36 
 
 
205 aa  113  1.0000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0390  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.15 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.312895 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0645  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.71 
 
 
216 aa  112  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0815  thiamine-phosphate pyrophosphorylase, putative  35.95 
 
 
224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.339712  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1499  thiamine monophosphate synthase  35.48 
 
 
215 aa  111  5e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.23 
 
 
221 aa  111  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.040851  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0604  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.29 
 
 
536 aa  110  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3318  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.27 
 
 
220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.195577  normal  0.0232291 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.18 
 
 
205 aa  108  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.40521  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0593  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.68 
 
 
206 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2395  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.76 
 
 
252 aa  108  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4410  thiamine monophosphate synthase  31.77 
 
 
210 aa  108  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0610  transcriptional regulator TenI  35.98 
 
 
202 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1989  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.81 
 
 
210 aa  107  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.64 
 
 
211 aa  106  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000752501  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2162  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.96 
 
 
210 aa  106  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00137501  hitchhiker  0.0000728866 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1691  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.01 
 
 
209 aa  105  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0247781  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.65 
 
 
344 aa  104  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.18 
 
 
343 aa  105  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1529  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.49 
 
 
207 aa  104  6e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.691821  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1348  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.46 
 
 
206 aa  104  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0446  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.39 
 
 
207 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.54 
 
 
219 aa  102  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.73 
 
 
212 aa  102  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.73 
 
 
346 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  30.11 
 
 
209 aa  102  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2484  Thiamine-phosphate diphosphorylase  34.9 
 
 
230 aa  102  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.336638  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  32.14 
 
 
310 aa  102  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0587  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.12 
 
 
213 aa  101  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1618  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 
199 aa  101  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0061  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.83 
 
 
205 aa  101  5e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221396  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3406  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.44 
 
 
203 aa  101  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405155  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1532  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.96 
 
 
206 aa  101  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000869  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  32.58 
 
 
204 aa  101  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.62 
 
 
206 aa  100  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0093  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.14 
 
 
222 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000282535  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0075  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.62 
 
 
222 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.73 
 
 
223 aa  100  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0370  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.53 
 
 
208 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0461  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.77 
 
 
206 aa  99.4  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.037147  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0547  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.13 
 
 
178 aa  99.4  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000291317  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1159  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.96 
 
 
212 aa  99.4  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3508  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.35 
 
 
223 aa  99.8  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0511603  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0081  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.14 
 
 
215 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2347  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.05 
 
 
221 aa  99.4  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.96 
 
 
211 aa  99  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1414  transcriptional regulator TenI  37.41 
 
 
201 aa  99.4  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0210  dGTP-pyrophosphohydrolase; thiamine phosphate synthase  33.13 
 
 
212 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0218369  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  30.73 
 
 
217 aa  98.6  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1282  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.73 
 
 
206 aa  98.6  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536618  normal  0.780941 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35 
 
 
202 aa  97.4  9e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1657  hypothetical protein  33.33 
 
 
210 aa  95.5  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000901813 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0364  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.15 
 
 
217 aa  95.5  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  33.54 
 
 
212 aa  95.1  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0492  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.2 
 
 
206 aa  95.1  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0276  hypothetical protein  35.4 
 
 
212 aa  95.1  5e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.714214 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.43 
 
 
219 aa  94.4  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1683  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.07 
 
 
218 aa  94.4  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000047745  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0349  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.43 
 
 
219 aa  94.4  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16941  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.72 
 
 
350 aa  94  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0695  transcriptional regulator TenI  35.06 
 
 
206 aa  94  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0639  transcriptional regulator TenI  35.06 
 
 
206 aa  94  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0639  transcriptional regulator TenI  35.06 
 
 
206 aa  94  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0797  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.51 
 
 
217 aa  93.6  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.961406 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  30.9 
 
 
321 aa  94  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1379  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.83 
 
 
215 aa  94  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000146383  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0729  transcriptional regulator TenI  35.06 
 
 
206 aa  94  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4545  transcriptional regulator TenI  35.06 
 
 
206 aa  94  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467462  normal  0.671743 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2471  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.96 
 
 
219 aa  93.6  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.89 
 
 
219 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0806  transcriptional regulator TenI  35.06 
 
 
206 aa  94  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.563560000000001e-47 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0076  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.96 
 
 
215 aa  94  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0077197  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0799  transcriptional regulator TenI  36.36 
 
 
206 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0883  transcriptional regulator TenI  36.36 
 
 
206 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000389091  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17535  predicted protein  31.33 
 
 
478 aa  92.8  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.274913 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06844  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.9 
 
 
204 aa  92.8  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.42 
 
 
379 aa  92.8  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4884  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.8 
 
 
218 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2516  thiamine-phosphate diphosphorylase  32.61 
 
 
203 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.138551  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1463  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.42 
 
 
211 aa  93.6  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0616  transcriptional regulator TenI  33.54 
 
 
206 aa  93.2  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14351  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.43 
 
 
353 aa  93.2  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>