More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3406 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3406  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  100 
 
 
203 aa  392  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405155  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3508  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.63 
 
 
223 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0511603  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.62 
 
 
211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1379  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.97 
 
 
215 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000146383  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2471  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.9 
 
 
219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.58 
 
 
220 aa  132  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0604  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45 
 
 
536 aa  131  6e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1500  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.59 
 
 
207 aa  129  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  39.13 
 
 
217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1712  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.79 
 
 
220 aa  124  9e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0573115  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1463  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40 
 
 
211 aa  123  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  40.7 
 
 
213 aa  120  9e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0446  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.07 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3007  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.56 
 
 
213 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2684  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.31 
 
 
343 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06844  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.82 
 
 
204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.61 
 
 
236 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.56 
 
 
221 aa  119  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.040851  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.2 
 
 
202 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3432  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.31 
 
 
343 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.89 
 
 
344 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1529  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.52 
 
 
207 aa  118  6e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.691821  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  41.95 
 
 
212 aa  118  7e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0911  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.56 
 
 
218 aa  117  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.302839 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0390  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.88 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.312895 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0593  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.04 
 
 
206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0853  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.78 
 
 
213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.230824  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.74 
 
 
212 aa  116  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0601  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.71 
 
 
356 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.95 
 
 
228 aa  115  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.84 
 
 
346 aa  114  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000869  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  36.5 
 
 
204 aa  114  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1918  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.83 
 
 
212 aa  114  8.999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.98 
 
 
223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2908  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.46 
 
 
368 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  38.3 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3476  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.59 
 
 
223 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.12 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0276  hypothetical protein  33.33 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.714214 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0840  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.71 
 
 
350 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4827  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.18 
 
 
224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16941  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.06 
 
 
350 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0461  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.03 
 
 
206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.037147  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3314  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.43 
 
 
347 aa  112  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.56 
 
 
218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0610  transcriptional regulator TenI  36.87 
 
 
202 aa  111  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2788  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.33 
 
 
208 aa  111  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.42 
 
 
219 aa  111  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2162  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.55 
 
 
210 aa  111  9e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00137501  hitchhiker  0.0000728866 
 
 
-
 
NC_002950  PG2109  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.77 
 
 
647 aa  109  3e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.671125 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.99 
 
 
206 aa  109  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1282  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.21 
 
 
206 aa  109  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536618  normal  0.780941 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02990  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.22 
 
 
215 aa  109  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0492  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.5 
 
 
206 aa  109  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0797  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.56 
 
 
217 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.961406 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0829  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.18 
 
 
213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.982504  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.38 
 
 
360 aa  108  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1532  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.4 
 
 
206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0093  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  49.3 
 
 
222 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000282535  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1558  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.26 
 
 
214 aa  108  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.536172  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.68 
 
 
379 aa  108  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1348  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.86 
 
 
206 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.91 
 
 
353 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.706748 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.75 
 
 
218 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1824  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.29 
 
 
222 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.106561 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2103  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.88 
 
 
219 aa  106  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1683  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.78 
 
 
218 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000047745  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1811  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.79 
 
 
221 aa  106  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.645451  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0075  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  50 
 
 
222 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5185  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.09 
 
 
228 aa  106  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6680  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.24 
 
 
211 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842807  normal  0.587855 
 
 
-
 
NC_002936  DET0782  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.61 
 
 
352 aa  105  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0116  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.55 
 
 
205 aa  106  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0081  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.59 
 
 
215 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2469  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.06 
 
 
207 aa  106  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.16 
 
 
214 aa  105  4e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.81 
 
 
343 aa  105  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  38.97 
 
 
479 aa  105  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0261  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.86 
 
 
211 aa  105  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.243144  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0209  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.86 
 
 
211 aa  105  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1955  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.36 
 
 
202 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5050  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.03 
 
 
219 aa  104  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10858  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.24 
 
 
208 aa  104  8e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.84468  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0370  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.89 
 
 
208 aa  104  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1657  hypothetical protein  36.14 
 
 
210 aa  104  8e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000901813 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4940  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.94 
 
 
233 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2041  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.89 
 
 
208 aa  103  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0624  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.68 
 
 
204 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5776  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.82 
 
 
211 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0281488  normal  0.147904 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0037  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.73 
 
 
206 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3431  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.8 
 
 
202 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0242  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.25 
 
 
203 aa  103  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.784761 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2056  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.37 
 
 
216 aa  102  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.343455 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2395  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.23 
 
 
252 aa  102  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3030  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.58 
 
 
226 aa  102  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0235882  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1691  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.94 
 
 
209 aa  102  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0247781  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0900  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.59 
 
 
219 aa  102  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3286  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.22 
 
 
211 aa  102  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450735  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.79 
 
 
365 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17535  predicted protein  39.36 
 
 
478 aa  101  7e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.274913 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>