More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2096 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2096  Thiamine-phosphate diphosphorylase  100 
 
 		 208 aa  407  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.255661  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2395  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.29 
 
 		 252 aa  123  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.65 
 
 		 211 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3476  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.41 
 
 		 223 aa  112  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1712  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.09 
 
 		 220 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0573115  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1405  thiamine monophosphate synthase  34.8 
 
 		 213 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1531  thiamine monophosphate synthase  36.46 
 
 		 212 aa  108  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  37.56 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  36.18 
 
 		 212 aa  104  8e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3508  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.2 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0511603  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.55 
 
 		 343 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0577  Thiamine-phosphate diphosphorylase  39.9 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.818359  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.54 
 
 		 236 aa  102  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.5 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1379  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.2 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000146383  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2788  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.33 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1282  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.88 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536618  normal  0.780941 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0633  thiamine monophosphate synthase  33.66 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0607  thiamin biosynthesis protein  39.51 
 
 		 208 aa  99  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.380998  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2062  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.1 
 
 		 216 aa  98.6  6e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0114882  normal  0.0947623 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1463  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.85 
 
 		 211 aa  98.6  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0786  transcriptional regulator TenI  31.61 
 
 		 206 aa  97.8  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.520662  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0883  transcriptional regulator TenI  31.03 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000389091  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0695  transcriptional regulator TenI  31.03 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0639  transcriptional regulator TenI  31.03 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0639  transcriptional regulator TenI  31.03 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.55 
 
 		 228 aa  97.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.04 
 
 		 344 aa  97.4  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0729  transcriptional regulator TenI  31.03 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0806  transcriptional regulator TenI  31.03 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.563560000000001e-47 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0799  transcriptional regulator TenI  30.46 
 
 		 206 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0376  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.17 
 
 		 214 aa  96.7  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.756236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0547  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.75 
 
 		 178 aa  95.9  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000291317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4545  transcriptional regulator TenI  31.03 
 
 		 206 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467462  normal  0.671743 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0610  transcriptional regulator TenI  37.04 
 
 		 202 aa  95.1  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2471  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.22 
 
 		 219 aa  94.7  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1006  Thiamine-phosphate diphosphorylase  31.92 
 
 		 216 aa  94.7  9e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0358  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.41 
 
 		 219 aa  94.7  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1500  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.17 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0782  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.41 
 
 		 352 aa  93.6  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0815  thiamine-phosphate pyrophosphorylase, putative  45.6 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.339712  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34670  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.31 
 
 		 225 aa  93.2  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1499  thiamine monophosphate synthase  44.19 
 
 		 215 aa  93.2  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1989  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.84 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3406  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.32 
 
 		 203 aa  93.2  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405155  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37 
 
 		 212 aa  93.2  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0616  transcriptional regulator TenI  32.35 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3432  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.38 
 
 		 343 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0645  transcriptional regulator TenI  31.46 
 
 		 208 aa  93.2  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2684  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.38 
 
 		 343 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1283  Thiamine-phosphate diphosphorylase  35.75 
 
 		 212 aa  92.8  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.8635  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4799  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.9 
 
 		 205 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17535  predicted protein  34.07 
 
 		 478 aa  92  5e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.274913 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0370  Thiamine-phosphate diphosphorylase  28.57 
 
 		 183 aa  91.7  6e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380325  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.51 
 
 		 365 aa  91.7  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0061  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.27 
 
 		 205 aa  91.7  7e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2520  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.29 
 
 		 207 aa  91.3  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  34.16 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.1 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000752501  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.05 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.40521  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4341  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.97 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.7 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4837  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1348  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.96 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5258  thiamine monophosphate synthase  37 
 
 		 192 aa  90.1  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6768  thiamine monophosphate synthase  39.29 
 
 		 214 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.16 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  34.02 
 
 		 492 aa  90.1  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4884  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.28 
 
 		 218 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0242  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.52 
 
 		 203 aa  89.7  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.784761 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1502  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.31 
 
 		 346 aa  89.4  4e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.63479  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0440  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.28 
 
 		 219 aa  88.6  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1155  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.79 
 
 		 197 aa  89  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.1 
 
 		 219 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.76 
 
 		 346 aa  88.6  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0624  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.41 
 
 		 204 aa  88.6  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4783  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33 
 
 		 207 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.655377  normal  0.0379586 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2663  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.22 
 
 		 209 aa  88.2  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.989358 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4659  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33 
 
 		 207 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448839  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.42 
 
 		 360 aa  88.2  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09270  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.8 
 
 		 209 aa  87.4  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36456  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0637  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.5 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14351  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.81 
 
 		 353 aa  87.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0828  thiamine-phosphate diphosphorylase  30.2 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3303  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.83 
 
 		 220 aa  87.4  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.535978  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  35.59 
 
 		 497 aa  87.8  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0829  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.51 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.982504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000869  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  32.16 
 
 		 204 aa  87.4  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0349  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.08 
 
 		 219 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2015  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.67 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.0030252  normal  0.0171267 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4946  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.26 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1811  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.75 
 
 		 221 aa  86.7  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.645451  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  36.56 
 
 		 490 aa  86.3  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.5 
 
 		 224 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1745  hydroxymethylpyrimidine kinase  33.52 
 
 		 479 aa  86.7  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1240  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.98 
 
 		 216 aa  86.3  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16941  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.78 
 
 		 350 aa  86.3  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1173  Thiamine-phosphate diphosphorylase  30.48 
 
 		 185 aa  86.3  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6573  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.33 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.775235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0364  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.09 
 
 		 217 aa  86.3  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>