More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6573 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6573  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  100 
 
 
212 aa  432  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.775235  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0624  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  55.61 
 
 
204 aa  221  9e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0242  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  52.28 
 
 
203 aa  203  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.784761 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1600  thiamine-phosphate diphosphorylase  48.31 
 
 
212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2460  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  53.18 
 
 
409 aa  191  6e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2469  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  51.79 
 
 
207 aa  171  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2109  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.24 
 
 
647 aa  167  1e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.671125 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1712  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.54 
 
 
220 aa  134  8e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0573115  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0119  Thiamine-phosphate diphosphorylase  39.11 
 
 
210 aa  127  9.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.88 
 
 
219 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.57 
 
 
344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  35.21 
 
 
217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1500  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.04 
 
 
207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.25 
 
 
206 aa  116  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1282  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.34 
 
 
206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536618  normal  0.780941 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.14 
 
 
202 aa  115  6.9999999999999995e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1122  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.33 
 
 
208 aa  114  7.999999999999999e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  37.63 
 
 
212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1989  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1532  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.11 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16941  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.61 
 
 
350 aa  112  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.14 
 
 
343 aa  112  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0090  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.59 
 
 
221 aa  111  8.000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0116  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.57 
 
 
205 aa  111  9e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35 
 
 
223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.79 
 
 
211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000752501  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0896  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.78 
 
 
352 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.833365  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.76 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27370  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  49.61 
 
 
218 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.2 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.71 
 
 
346 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1223  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.65 
 
 
217 aa  108  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3432  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.12 
 
 
343 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2684  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.12 
 
 
343 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1463  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.36 
 
 
211 aa  107  9.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10858  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.26 
 
 
208 aa  107  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.84468  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.78 
 
 
365 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2062  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.63 
 
 
216 aa  107  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0114882  normal  0.0947623 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0840  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.8 
 
 
350 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14351  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.88 
 
 
353 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.73 
 
 
211 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0358  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.13 
 
 
219 aa  106  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  33.67 
 
 
209 aa  106  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0911  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.23 
 
 
218 aa  106  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.302839 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1046  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.58 
 
 
218 aa  105  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0440  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 
219 aa  105  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4884  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 
218 aa  105  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.28 
 
 
219 aa  104  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17535  predicted protein  34.39 
 
 
478 aa  103  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.274913 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.1 
 
 
224 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0349  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.33 
 
 
219 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.33 
 
 
219 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2520  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.46 
 
 
207 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0604  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.21 
 
 
536 aa  104  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2471  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.5 
 
 
219 aa  103  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0061  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.5 
 
 
205 aa  103  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221396  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.5 
 
 
360 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1824  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.26 
 
 
222 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.106561 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5776  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.5 
 
 
211 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0281488  normal  0.147904 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0254  phosphomethylpyrimidine kinase/thiamin-phosphate pyrophosphorylase  35.56 
 
 
529 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0353  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.33 
 
 
219 aa  102  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.26 
 
 
220 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.41 
 
 
353 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.706748 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0593  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.84 
 
 
206 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0390  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.92 
 
 
207 aa  102  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.312895 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1811  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.27 
 
 
221 aa  102  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.645451  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0364  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 
217 aa  102  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.79 
 
 
221 aa  102  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.040851  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3508  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.43 
 
 
223 aa  102  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0511603  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0842  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.16 
 
 
223 aa  101  7e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.385725  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6680  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.98 
 
 
211 aa  101  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842807  normal  0.587855 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  32.52 
 
 
213 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.02 
 
 
234 aa  101  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0376  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.44 
 
 
214 aa  100  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.756236  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2103  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.84 
 
 
219 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  36.72 
 
 
490 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06844  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.07 
 
 
204 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0363  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.1 
 
 
219 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.45254  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2347  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.69 
 
 
221 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0607  thiamin biosynthesis protein  36.22 
 
 
208 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.380998  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0377  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.1 
 
 
219 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3406  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.46 
 
 
203 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405155  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14731  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.7 
 
 
351 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.161501  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3314  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.14 
 
 
347 aa  99.8  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1745  hydroxymethylpyrimidine kinase  35.75 
 
 
479 aa  99.4  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0441  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.75 
 
 
479 aa  99  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00801461  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2908  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.39 
 
 
368 aa  99  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1558  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.05 
 
 
214 aa  98.6  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.536172  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1155  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.54 
 
 
197 aa  99  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149529  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0601  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.25 
 
 
356 aa  99  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.15 
 
 
351 aa  99  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0645  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.41 
 
 
216 aa  98.6  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.56 
 
 
206 aa  98.2  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1502  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35 
 
 
346 aa  97.8  9e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.63479  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0829  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.56 
 
 
213 aa  97.8  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.982504  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0446  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.8 
 
 
207 aa  97.4  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2788  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.62 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2443  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.08 
 
 
206 aa  97.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0164937  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0261  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.71 
 
 
211 aa  97.4  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.243144  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3286  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.41 
 
 
214 aa  97.4  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000497087  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>