More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2469 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2469  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  100 
 
 
207 aa  415  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2460  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  50 
 
 
409 aa  222  4e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0624  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  52.82 
 
 
204 aa  208  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0242  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  51.55 
 
 
203 aa  201  9e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.784761 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1600  thiamine-phosphate diphosphorylase  45.59 
 
 
212 aa  191  5e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6573  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  51.79 
 
 
212 aa  176  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.775235  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2109  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  49.13 
 
 
647 aa  168  6e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.671125 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1712  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.54 
 
 
220 aa  126  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0573115  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0119  Thiamine-phosphate diphosphorylase  39.49 
 
 
210 aa  124  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.9 
 
 
365 aa  119  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0376  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.56 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.756236  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.68 
 
 
353 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.706748 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.5 
 
 
221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.040851  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.62 
 
 
379 aa  115  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14351  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.6 
 
 
353 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  38.89 
 
 
217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1282  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.04 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536618  normal  0.780941 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16941  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.32 
 
 
350 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14731  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.1 
 
 
351 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.161501  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2684  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.91 
 
 
343 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.76 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3432  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.36 
 
 
343 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3286  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.43 
 
 
214 aa  108  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000497087  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3406  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.06 
 
 
203 aa  108  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405155  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0896  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.84 
 
 
352 aa  107  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.833365  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1500  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.57 
 
 
207 aa  107  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.26 
 
 
351 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.66 
 
 
344 aa  105  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.32 
 
 
346 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1057  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.72 
 
 
343 aa  105  6e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.004946  normal  0.0997928 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0840  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.5 
 
 
350 aa  104  8e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2908  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.41 
 
 
368 aa  104  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3314  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.41 
 
 
347 aa  104  8e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10858  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.52 
 
 
208 aa  104  8e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.84468  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2062  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.66 
 
 
216 aa  103  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0114882  normal  0.0947623 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3287  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.44 
 
 
208 aa  104  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.633287  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1918  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.91 
 
 
212 aa  104  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0446  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.43 
 
 
207 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0116  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.82 
 
 
205 aa  103  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.46 
 
 
202 aa  103  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0093  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.44 
 
 
222 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000282535  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4280  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.48 
 
 
208 aa  102  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147204  hitchhiker  0.00418182 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0364  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.6 
 
 
217 aa  102  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0607  thiamin biosynthesis protein  38.46 
 
 
208 aa  102  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.380998  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  37.99 
 
 
212 aa  102  6e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0358  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.5 
 
 
219 aa  101  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.81 
 
 
343 aa  101  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0075  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.75 
 
 
222 aa  101  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.39 
 
 
223 aa  101  9e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0390  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.7 
 
 
207 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.312895 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3889  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.48 
 
 
208 aa  100  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0440  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.55 
 
 
219 aa  100  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.23 
 
 
219 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0353  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.23 
 
 
219 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0037  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.75 
 
 
206 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17535  predicted protein  33.69 
 
 
478 aa  100  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.274913 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  39.15 
 
 
479 aa  99.8  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1989  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.09 
 
 
210 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0081  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.75 
 
 
215 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0828  thiamine-phosphate diphosphorylase  35.88 
 
 
217 aa  99.8  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2788  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.23 
 
 
208 aa  98.6  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4884  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.03 
 
 
218 aa  99  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0342  thiamine monophosphate synthase  34.52 
 
 
206 aa  98.6  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1502  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.71 
 
 
346 aa  98.6  6e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.63479  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.52 
 
 
234 aa  98.6  6e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2162  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.5 
 
 
210 aa  98.6  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00137501  hitchhiker  0.0000728866 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_688  ThiE-associated domain protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.99 
 
 
352 aa  98.2  8e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000736904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.66 
 
 
219 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0730  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.75 
 
 
216 aa  97.8  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0124065  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0349  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.66 
 
 
219 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.91 
 
 
211 aa  97.8  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000752501  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0782  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.61 
 
 
352 aa  96.7  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1122  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.24 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0363  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.99 
 
 
219 aa  96.3  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.45254  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.26 
 
 
220 aa  96.3  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0377  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.99 
 
 
219 aa  96.3  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  33.33 
 
 
209 aa  95.9  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.66 
 
 
224 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2520  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.83 
 
 
207 aa  95.9  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09270  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.69 
 
 
209 aa  95.9  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36456  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1529  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.2 
 
 
207 aa  95.9  4e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.691821  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0593  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 
206 aa  95.5  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.29 
 
 
211 aa  95.1  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.37 
 
 
219 aa  95.1  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.08 
 
 
228 aa  95.1  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2663  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.56 
 
 
209 aa  95.1  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.989358 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1824  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 
222 aa  95.1  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.106561 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1811  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.23 
 
 
221 aa  94.7  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.645451  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0090  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.64 
 
 
221 aa  94.7  8e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.65 
 
 
360 aa  94.7  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0014  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.45 
 
 
225 aa  94.7  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3508  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.78 
 
 
223 aa  94.7  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0511603  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  36.21 
 
 
490 aa  94  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.9 
 
 
212 aa  94.4  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1558  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.87 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.536172  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.19 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.40521  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.22 
 
 
214 aa  94  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0711  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.03 
 
 
231 aa  93.2  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06844  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.27 
 
 
204 aa  93.2  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2471  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.2 
 
 
219 aa  93.2  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>