More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3286 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3286  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  100 
 
 
214 aa  441  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000497087  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1712  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.16 
 
 
220 aa  121  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0573115  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1500  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.33 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  43.11 
 
 
212 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2520  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.69 
 
 
207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.44 
 
 
211 aa  118  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000752501  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  39.26 
 
 
217 aa  115  5e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  49.61 
 
 
213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  39.88 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1282  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.88 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536618  normal  0.780941 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1989  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.9 
 
 
210 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1918  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.41 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3318  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.22 
 
 
220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.195577  normal  0.0232291 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.18 
 
 
220 aa  112  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.96 
 
 
214 aa  112  6e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0364  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.46 
 
 
217 aa  112  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1532  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.36 
 
 
206 aa  111  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.91 
 
 
224 aa  111  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0358  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.36 
 
 
219 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.17 
 
 
379 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0246  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.56 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0349  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.81 
 
 
219 aa  109  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.5 
 
 
346 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16941  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.42 
 
 
350 aa  109  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.06 
 
 
219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.36 
 
 
219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0353  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.36 
 
 
219 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0363  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.81 
 
 
219 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.45254  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1502  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.76 
 
 
346 aa  107  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.63479  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0377  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.81 
 
 
219 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.67 
 
 
365 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1463  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.78 
 
 
211 aa  107  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4884  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.88 
 
 
218 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.62 
 
 
206 aa  106  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0840  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.52 
 
 
350 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0276  hypothetical protein  38.85 
 
 
212 aa  106  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.714214 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0607  thiamin biosynthesis protein  48.85 
 
 
208 aa  106  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.380998  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3314  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.85 
 
 
347 aa  105  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3508  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.79 
 
 
223 aa  105  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0511603  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14731  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.3 
 
 
351 aa  105  6e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.161501  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1811  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.42 
 
 
221 aa  105  6e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.645451  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.41 
 
 
353 aa  105  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.706748 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1155  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.9 
 
 
197 aa  105  7e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149529  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0896  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.96 
 
 
352 aa  104  9e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.833365  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.77 
 
 
202 aa  104  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.67 
 
 
211 aa  104  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1379  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.32 
 
 
215 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000146383  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0440  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.71 
 
 
219 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06844  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.65 
 
 
204 aa  104  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2469  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.43 
 
 
207 aa  103  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.77 
 
 
218 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0645  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.46 
 
 
216 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.31 
 
 
205 aa  103  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2908  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.91 
 
 
368 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.53 
 
 
343 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.38 
 
 
212 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000869  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  37.65 
 
 
204 aa  102  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1375  thiamine monophosphate synthase  38.17 
 
 
218 aa  102  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2684  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.18 
 
 
343 aa  101  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.67 
 
 
218 aa  101  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0209  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.79 
 
 
211 aa  101  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  42.52 
 
 
484 aa  101  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2347  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.25 
 
 
221 aa  101  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1691  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.51 
 
 
209 aa  101  9e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0247781  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14351  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.91 
 
 
353 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.56 
 
 
213 aa  100  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00215489  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2128  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.56 
 
 
213 aa  100  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000263441  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.39 
 
 
351 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0730  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.78 
 
 
216 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0124065  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0601  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.87 
 
 
356 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3432  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.18 
 
 
343 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.92 
 
 
223 aa  100  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2015  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.69 
 
 
204 aa  100  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.0030252  normal  0.0171267 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0593  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.66 
 
 
206 aa  99.8  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.15 
 
 
236 aa  99.8  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0076  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.92 
 
 
215 aa  99  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0077197  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  40.94 
 
 
484 aa  99.4  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10858  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.75 
 
 
208 aa  99.4  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.84468  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0014  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.11 
 
 
225 aa  98.6  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.36 
 
 
360 aa  99  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2162  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.91 
 
 
210 aa  98.6  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00137501  hitchhiker  0.0000728866 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.2 
 
 
344 aa  98.2  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1937  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.59 
 
 
219 aa  98.2  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0505249  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1558  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.42 
 
 
214 aa  98.2  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.536172  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3286  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.31 
 
 
211 aa  98.2  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450735  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2062  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.32 
 
 
216 aa  97.8  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0114882  normal  0.0947623 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6573  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.41 
 
 
212 aa  97.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.775235  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0492  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.16 
 
 
206 aa  97.8  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0446  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.97 
 
 
207 aa  97.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0390  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.46 
 
 
207 aa  97.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.312895 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1824  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.32 
 
 
222 aa  96.7  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.106561 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1348  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.02 
 
 
206 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1683  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.71 
 
 
218 aa  96.3  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000047745  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0116  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.76 
 
 
205 aa  96.3  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1529  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.25 
 
 
207 aa  95.5  5e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.691821  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0773  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.53 
 
 
216 aa  95.5  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3476  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.08 
 
 
223 aa  95.9  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2103  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.18 
 
 
219 aa  95.1  8e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0797  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.51 
 
 
217 aa  94.7  9e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.961406 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2460  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.51 
 
 
409 aa  94  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>