More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2520 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2520  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  100 
 
 
207 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  51.71 
 
 
209 aa  215  4e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1989  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  51.22 
 
 
210 aa  212  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  53.72 
 
 
211 aa  194  9e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000752501  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1463  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  50 
 
 
211 aa  189  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3508  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  50.25 
 
 
223 aa  189  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0511603  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1379  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.09 
 
 
215 aa  186  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000146383  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  49.02 
 
 
211 aa  185  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  51 
 
 
221 aa  182  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.040851  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1155  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.96 
 
 
197 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149529  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.99 
 
 
228 aa  177  7e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2471  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.92 
 
 
219 aa  174  9e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1159  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.99 
 
 
212 aa  172  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.21 
 
 
236 aa  171  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2162  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  50 
 
 
210 aa  171  7.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00137501  hitchhiker  0.0000728866 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1811  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.5 
 
 
221 aa  171  7.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.645451  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3318  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43 
 
 
220 aa  169  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.195577  normal  0.0232291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45 
 
 
206 aa  168  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0593  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.35 
 
 
206 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.96 
 
 
344 aa  165  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06844  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.12 
 
 
204 aa  165  5.9999999999999996e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2015  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.72 
 
 
204 aa  165  5.9999999999999996e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.0030252  normal  0.0171267 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.1 
 
 
220 aa  164  8e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0116  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.37 
 
 
205 aa  164  8e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0645  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  49 
 
 
216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  41.87 
 
 
213 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3007  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.45 
 
 
213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.6 
 
 
218 aa  162  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2103  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.08 
 
 
219 aa  162  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000869  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  43.5 
 
 
204 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  42.86 
 
 
217 aa  161  6e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.1 
 
 
218 aa  160  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0829  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.5 
 
 
213 aa  158  4e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.982504  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1122  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.12 
 
 
208 aa  158  6e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2347  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  52.38 
 
 
221 aa  157  8e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.87 
 
 
214 aa  156  2e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0246  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.19 
 
 
222 aa  156  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1532  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40 
 
 
206 aa  155  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0353  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  49.21 
 
 
219 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0492  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.79 
 
 
206 aa  153  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0782  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.91 
 
 
352 aa  153  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0349  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.69 
 
 
219 aa  153  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  49.21 
 
 
219 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.69 
 
 
224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4827  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.16 
 
 
224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.72 
 
 
219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03710  thiamine biosynthetic bifunctional enzyme, putative  39.62 
 
 
555 aa  151  5e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.036727  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10858  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.41 
 
 
208 aa  151  8e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.84468  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0358  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.12 
 
 
219 aa  151  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.87 
 
 
206 aa  150  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1282  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.54 
 
 
206 aa  149  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536618  normal  0.780941 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1657  hypothetical protein  40.49 
 
 
210 aa  149  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000901813 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0900  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.84 
 
 
219 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17535  predicted protein  43.68 
 
 
478 aa  149  3e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.274913 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_688  ThiE-associated domain protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.9 
 
 
352 aa  149  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000736904  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0363  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.12 
 
 
219 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.45254  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0377  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.12 
 
 
219 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  44.22 
 
 
492 aa  149  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2205  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.83 
 
 
220 aa  149  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.29 
 
 
202 aa  149  4e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0446  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39 
 
 
207 aa  148  6e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0461  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.5 
 
 
206 aa  148  7e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.037147  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0037  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.64 
 
 
206 aa  147  8e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  44.5 
 
 
497 aa  147  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1712  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.02 
 
 
220 aa  147  8e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0573115  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  42.08 
 
 
212 aa  147  9e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.74 
 
 
343 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77822  predicted protein  39.46 
 
 
533 aa  146  2.0000000000000003e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00729956  normal  0.350827 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1529  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.5 
 
 
207 aa  145  3e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.691821  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0261  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.72 
 
 
211 aa  145  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.243144  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1558  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.37 
 
 
214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.536172  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.33 
 
 
346 aa  144  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1099  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.28 
 
 
210 aa  144  8.000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.238552  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  44.78 
 
 
484 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2062  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.5 
 
 
216 aa  144  9e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0114882  normal  0.0947623 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0390  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.5 
 
 
207 aa  144  9e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.312895 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.1 
 
 
379 aa  144  9e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4884  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.55 
 
 
218 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1015  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.27 
 
 
215 aa  144  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0364  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.49 
 
 
217 aa  143  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0440  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.03 
 
 
219 aa  143  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0403  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.13 
 
 
211 aa  142  3e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.647684  normal  0.48024 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1224  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.29 
 
 
210 aa  141  5e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.71764  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.62 
 
 
212 aa  141  5e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1500  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.8 
 
 
207 aa  142  5e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1937  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.11 
 
 
219 aa  141  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0505249  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  44.74 
 
 
484 aa  141  7e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1223  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.02 
 
 
217 aa  141  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.3 
 
 
205 aa  141  8e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.40521  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2684  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.61 
 
 
343 aa  141  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5185  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.87 
 
 
228 aa  140  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1824  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.84 
 
 
222 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.106561 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0708  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.64 
 
 
352 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1502  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.98 
 
 
346 aa  139  3e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.63479  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3432  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.1 
 
 
343 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1683  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.21 
 
 
218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000047745  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.6 
 
 
205 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1918  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.36 
 
 
212 aa  138  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0061  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.11 
 
 
205 aa  138  6e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221396  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  41.24 
 
 
479 aa  137  7.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>