More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0816 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  100 
 
 
217 aa  436  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1500  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  58.62 
 
 
207 aa  236  2e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  52.74 
 
 
212 aa  208  5e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1532  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  51.96 
 
 
206 aa  205  5e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.45 
 
 
202 aa  190  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1282  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.22 
 
 
206 aa  186  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536618  normal  0.780941 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2162  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  55.69 
 
 
210 aa  184  9e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00137501  hitchhiker  0.0000728866 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1406  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  54.95 
 
 
210 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0116  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.95 
 
 
205 aa  177  1e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  50.25 
 
 
221 aa  176  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.040851  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1463  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.52 
 
 
211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1811  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.59 
 
 
221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.645451  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3508  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.8 
 
 
223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0511603  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.93 
 
 
228 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2520  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.86 
 
 
207 aa  161  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  44.76 
 
 
492 aa  159  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0645  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  49.13 
 
 
216 aa  158  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.24 
 
 
344 aa  158  7e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.93 
 
 
343 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1379  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.45 
 
 
215 aa  157  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000146383  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.62 
 
 
211 aa  156  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000752501  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.07 
 
 
211 aa  156  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1989  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.68 
 
 
210 aa  153  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.39 
 
 
379 aa  153  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.52 
 
 
236 aa  152  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1712  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.44 
 
 
220 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0573115  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_688  ThiE-associated domain protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.01 
 
 
352 aa  151  8.999999999999999e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000736904  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0782  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.45 
 
 
352 aa  150  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  43.41 
 
 
213 aa  150  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.78 
 
 
212 aa  150  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17535  predicted protein  48.04 
 
 
478 aa  150  1e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.274913 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3318  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.26 
 
 
220 aa  150  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.195577  normal  0.0232291 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10858  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.41 
 
 
208 aa  149  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.84468  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  42.19 
 
 
490 aa  148  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0446  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.15 
 
 
207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2471  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.5 
 
 
219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.09 
 
 
220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  44.38 
 
 
497 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.86 
 
 
353 aa  145  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.706748 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0390  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.5 
 
 
207 aa  145  5e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.312895 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1155  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.01 
 
 
197 aa  144  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149529  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  45.2 
 
 
484 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14351  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.3 
 
 
353 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.47 
 
 
218 aa  143  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000869  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  39.9 
 
 
204 aa  143  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  44.32 
 
 
479 aa  142  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.11 
 
 
365 aa  142  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.09 
 
 
206 aa  142  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.7 
 
 
223 aa  142  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2684  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.7 
 
 
343 aa  141  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3314  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.39 
 
 
347 aa  141  7e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3432  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.7 
 
 
343 aa  141  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.22 
 
 
346 aa  141  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.94 
 
 
218 aa  141  9e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0593  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.38 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1529  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.94 
 
 
207 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.691821  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  44.97 
 
 
484 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1691  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.24 
 
 
209 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0247781  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1558  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.11 
 
 
214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.536172  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1543  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.78 
 
 
207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0451009  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1336  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.32 
 
 
207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.44 
 
 
206 aa  139  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0358  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.62 
 
 
219 aa  139  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0461  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.68 
 
 
206 aa  139  3e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.037147  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0061  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.88 
 
 
205 aa  139  3.9999999999999997e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221396  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0349  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.33 
 
 
219 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.82 
 
 
224 aa  138  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  46.93 
 
 
497 aa  138  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0364  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.93 
 
 
217 aa  138  7e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1502  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.95 
 
 
346 aa  138  7e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.63479  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  39.49 
 
 
209 aa  138  7e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1139  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.38 
 
 
226 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.123471 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0896  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.31 
 
 
352 aa  137  1e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.833365  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.97 
 
 
205 aa  137  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.40521  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2788  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.09 
 
 
208 aa  137  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.31 
 
 
219 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0708  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.94 
 
 
352 aa  137  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0440  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.3 
 
 
219 aa  136  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.46 
 
 
219 aa  136  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2908  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.22 
 
 
368 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5776  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.33 
 
 
211 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0281488  normal  0.147904 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2347  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.7 
 
 
221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0353  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.31 
 
 
219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2395  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.82 
 
 
252 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1918  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.28 
 
 
212 aa  135  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4884  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.3 
 
 
218 aa  135  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14731  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.7 
 
 
351 aa  135  4e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.161501  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6680  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.44 
 
 
211 aa  135  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842807  normal  0.587855 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.29 
 
 
219 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.86 
 
 
205 aa  135  5e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.78 
 
 
360 aa  134  9e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0797  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.1 
 
 
217 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.961406 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1657  hypothetical protein  40.98 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000901813 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0246  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.57 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0601  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.72 
 
 
356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0076  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.51 
 
 
215 aa  132  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0077197  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1683  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.71 
 
 
218 aa  132  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000047745  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3007  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.9 
 
 
213 aa  132  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1824  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.17 
 
 
222 aa  132  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.106561 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0209  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41 
 
 
211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>