More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1600 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1600  thiamine-phosphate diphosphorylase  100 
 
 
212 aa  431  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0624  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  50.25 
 
 
204 aa  208  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6573  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.31 
 
 
212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.775235  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0242  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.67 
 
 
203 aa  191  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.784761 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2460  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.16 
 
 
409 aa  186  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2469  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.59 
 
 
207 aa  185  5e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2109  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.84 
 
 
647 aa  161  8.000000000000001e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.671125 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.62 
 
 
365 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1502  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.25 
 
 
346 aa  122  3e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.63479  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14351  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.54 
 
 
353 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.6 
 
 
353 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.706748 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.83 
 
 
343 aa  117  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.52 
 
 
351 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0119  Thiamine-phosphate diphosphorylase  36.55 
 
 
210 aa  116  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1282  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.55 
 
 
206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536618  normal  0.780941 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14731  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.13 
 
 
351 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.161501  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1532  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.52 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0440  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.83 
 
 
219 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4884  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.83 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.38 
 
 
205 aa  112  3e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.40521  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0364  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.98 
 
 
217 aa  112  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1712  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.4 
 
 
220 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0573115  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0349  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.68 
 
 
219 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.51 
 
 
379 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.19 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1122  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.04 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0593  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.97 
 
 
206 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.69 
 
 
219 aa  108  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3318  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.51 
 
 
220 aa  108  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.195577  normal  0.0232291 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2684  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.02 
 
 
343 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16941  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.43 
 
 
350 aa  108  5e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0358  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.31 
 
 
219 aa  108  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10858  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.17 
 
 
208 aa  108  7.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.84468  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.81 
 
 
224 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17535  predicted protein  34.33 
 
 
478 aa  108  8.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.274913 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.06 
 
 
202 aa  107  9.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0353  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.69 
 
 
219 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2788  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.63 
 
 
208 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3432  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.48 
 
 
343 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0390  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.82 
 
 
207 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.312895 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0842  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.52 
 
 
223 aa  106  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.385725  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3314  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.63 
 
 
347 aa  105  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1989  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.36 
 
 
210 aa  106  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  33.33 
 
 
217 aa  105  5e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0840  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.36 
 
 
350 aa  105  7e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.09 
 
 
346 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  34.05 
 
 
209 aa  104  8e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0363  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.2 
 
 
219 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.45254  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0377  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.2 
 
 
219 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  32.42 
 
 
212 aa  103  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0896  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.93 
 
 
352 aa  103  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.833365  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  30.85 
 
 
494 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.7 
 
 
221 aa  102  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.040851  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2520  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.67 
 
 
207 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.98 
 
 
223 aa  102  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0828  thiamine-phosphate diphosphorylase  35.06 
 
 
217 aa  102  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0090  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.8 
 
 
221 aa  102  4e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0911  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.98 
 
 
218 aa  102  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.302839 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  29.1 
 
 
492 aa  102  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1811  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.26 
 
 
221 aa  101  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.645451  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.07 
 
 
228 aa  101  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2347  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.93 
 
 
221 aa  101  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.97 
 
 
213 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00215489  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0116  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.68 
 
 
205 aa  101  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2128  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.97 
 
 
213 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000263441  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  32.77 
 
 
490 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0061  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.06 
 
 
205 aa  100  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221396  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0342  thiamine monophosphate synthase  28.57 
 
 
206 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0446  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.07 
 
 
207 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.99 
 
 
219 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.29 
 
 
211 aa  99.8  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.02 
 
 
344 aa  99.8  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1529  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.16 
 
 
207 aa  98.2  7e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.691821  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2908  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.85 
 
 
368 aa  98.2  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1500  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.81 
 
 
207 aa  98.2  9e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3508  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.64 
 
 
223 aa  97.8  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0511603  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0461  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.54 
 
 
206 aa  97.4  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.037147  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1057  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.8 
 
 
343 aa  97.4  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.004946  normal  0.0997928 
 
 
-
 
NC_002936  DET0782  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.23 
 
 
352 aa  97.1  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.12 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1240  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.25 
 
 
216 aa  96.3  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.42 
 
 
360 aa  96.3  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0246  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.16 
 
 
222 aa  95.9  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1558  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.29 
 
 
214 aa  95.9  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.536172  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2471  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.15 
 
 
219 aa  95.5  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1375  thiamine monophosphate synthase  27 
 
 
218 aa  95.9  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.67 
 
 
220 aa  95.1  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4946  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.94 
 
 
207 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4280  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.61 
 
 
208 aa  94.4  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147204  hitchhiker  0.00418182 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0604  thiamine-phosphate diphosphorylase  35.06 
 
 
217 aa  94  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0199515  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0829  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.32 
 
 
213 aa  94  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.982504  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  33.14 
 
 
497 aa  93.2  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  32.16 
 
 
213 aa  93.2  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0645  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.44 
 
 
216 aa  93.6  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.93 
 
 
236 aa  94  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0708  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.61 
 
 
352 aa  93.6  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  35.29 
 
 
479 aa  93.2  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1463  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.03 
 
 
211 aa  92.8  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0601  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.37 
 
 
356 aa  92.8  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  32.07 
 
 
497 aa  92.8  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>