More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3851 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  68.78 
 
 		 497 aa  648    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 497 aa  994    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  66.6 
 
 		 490 aa  632  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  66.6 
 
 		 484 aa  619  1e-176  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  65.97 
 
 		 484 aa  600  1e-170  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  62.78 
 
 		 492 aa  565  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  61.3 
 
 		 494 aa  545  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  54.45 
 
 		 479 aa  443  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  54.12 
 
 		 270 aa  262  8.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  51.95 
 
 		 272 aa  251  2e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  52.53 
 
 		 271 aa  250  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  53.1 
 
 		 264 aa  249  6e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  53.36 
 
 		 264 aa  247  3e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  51.92 
 
 		 262 aa  246  9e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  50.39 
 
 		 270 aa  243  5e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  50.39 
 
 		 270 aa  242  1e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  48.36 
 
 		 288 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  48.36 
 
 		 288 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  54.2 
 
 		 263 aa  240  4e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  51.36 
 
 		 267 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  47.71 
 
 		 266 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  49.61 
 
 		 270 aa  239  1e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 267 aa  238  2e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  47.91 
 
 		 266 aa  237  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  51.95 
 
 		 270 aa  237  4e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  47.53 
 
 		 266 aa  236  6e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  47.53 
 
 		 266 aa  236  6e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  47.53 
 
 		 266 aa  236  6e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  47.53 
 
 		 266 aa  236  6e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  47.53 
 
 		 266 aa  236  6e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  47.53 
 
 		 266 aa  236  6e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  47.53 
 
 		 266 aa  236  9e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  47.53 
 
 		 266 aa  236  9e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  50.39 
 
 		 266 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  51.89 
 
 		 268 aa  234  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  46.95 
 
 		 266 aa  233  5e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  52.36 
 
 		 267 aa  233  6e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  49.61 
 
 		 264 aa  232  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0552  phosphomethylpyrimidine kinase  53.49 
 
 		 269 aa  232  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00628299 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  50.96 
 
 		 265 aa  231  2e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  49.22 
 
 		 264 aa  231  3e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  49.41 
 
 		 270 aa  230  5e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  51.89 
 
 		 268 aa  229  8e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  51.89 
 
 		 268 aa  229  9e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  46.36 
 
 		 267 aa  229  9e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  46.74 
 
 		 267 aa  229  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1265  phosphomethylpyrimidine kinase  53.7 
 
 		 267 aa  229  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  47.13 
 
 		 267 aa  228  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  49.8 
 
 		 270 aa  229  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  46.95 
 
 		 266 aa  229  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  49.8 
 
 		 270 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  46.56 
 
 		 266 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  46.56 
 
 		 266 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  46.56 
 
 		 266 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  49.41 
 
 		 270 aa  227  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  49.41 
 
 		 270 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  46.24 
 
 		 285 aa  226  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  50.58 
 
 		 270 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  49.41 
 
 		 270 aa  226  7e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  49.41 
 
 		 270 aa  226  7e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  49.41 
 
 		 270 aa  226  7e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  49.41 
 
 		 270 aa  226  7e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  46.18 
 
 		 288 aa  226  8e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  51.57 
 
 		 285 aa  226  9e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  47.73 
 
 		 268 aa  225  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  49.41 
 
 		 273 aa  225  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  49.24 
 
 		 269 aa  226  1e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  53.94 
 
 		 266 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  44.91 
 
 		 269 aa  225  2e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  46.18 
 
 		 266 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  48.03 
 
 		 270 aa  224  3e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  53.1 
 
 		 271 aa  224  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  48.45 
 
 		 269 aa  224  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  47.57 
 
 		 264 aa  223  7e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1658  phosphomethylpyrimidine kinase  53.64 
 
 		 268 aa  223  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  48.45 
 
 		 266 aa  223  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  49.29 
 
 		 283 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  47.73 
 
 		 271 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  45.59 
 
 		 266 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1361  phosphomethylpyrimidine kinase  52.87 
 
 		 268 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  48.13 
 
 		 285 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  49.29 
 
 		 308 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  46.74 
 
 		 267 aa  221  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  45.77 
 
 		 266 aa  221  3e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  52.17 
 
 		 260 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  45.21 
 
 		 266 aa  219  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  53.31 
 
 		 268 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  47.06 
 
 		 260 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  49.63 
 
 		 280 aa  218  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  48.03 
 
 		 263 aa  218  2e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2479  phosphomethylpyrimidine kinase  52.49 
 
 		 268 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0351011  hitchhiker  0.000627669 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1236  phosphomethylpyrimidine kinase  51.71 
 
 		 269 aa  217  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.252768 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  51.34 
 
 		 283 aa  216  5e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  51.56 
 
 		 268 aa  216  7e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 264 aa  216  9e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 297 aa  216  9e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  43.75 
 
 		 297 aa  216  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  45.53 
 
 		 269 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  48.46 
 
 		 265 aa  215  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 		 284 aa  215  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>