More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1545 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 264 aa  530  1e-149  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  96.59 
 
 		 264 aa  511  1e-144  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  63.32 
 
 		 267 aa  334  1e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  56.37 
 
 		 267 aa  299  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  53.7 
 
 		 272 aa  287  9e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  56.2 
 
 		 262 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  50.97 
 
 		 270 aa  276  4e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  57.14 
 
 		 260 aa  273  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  52.76 
 
 		 260 aa  269  4e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  56.47 
 
 		 264 aa  265  5e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 262 aa  263  2e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  52.92 
 
 		 285 aa  256  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  48.66 
 
 		 263 aa  252  4.0000000000000004e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  49.22 
 
 		 270 aa  250  2e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 		 266 aa  249  4e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  51.91 
 
 		 270 aa  248  8e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  52.94 
 
 		 265 aa  248  1e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  45.91 
 
 		 260 aa  245  6e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  45.17 
 
 		 264 aa  244  6.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 		 271 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  48.5 
 
 		 268 aa  241  9e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  46.39 
 
 		 270 aa  240  2e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  46.39 
 
 		 270 aa  239  2.9999999999999997e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  50.37 
 
 		 268 aa  238  5.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  46.01 
 
 		 270 aa  238  9e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  47.73 
 
 		 283 aa  238  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  47.57 
 
 		 268 aa  237  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  46.56 
 
 		 268 aa  236  3e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  48.26 
 
 		 264 aa  236  4e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  47.19 
 
 		 268 aa  234  9e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  46.18 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  48.86 
 
 		 266 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 		 268 aa  233  3e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  48.83 
 
 		 264 aa  233  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  46.59 
 
 		 269 aa  232  4.0000000000000004e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  47.37 
 
 		 323 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  51.15 
 
 		 271 aa  231  9e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  44.15 
 
 		 290 aa  231  9e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  48.67 
 
 		 269 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 		 269 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  42.7 
 
 		 267 aa  229  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4962  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 		 266 aa  229  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal  0.0189851 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  44.15 
 
 		 267 aa  229  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  45.88 
 
 		 266 aa  229  5e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  48.03 
 
 		 257 aa  228  7e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  43.07 
 
 		 267 aa  228  8e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  52.08 
 
 		 270 aa  227  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  52.08 
 
 		 270 aa  227  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  51.32 
 
 		 270 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  52.08 
 
 		 270 aa  227  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  52.65 
 
 		 270 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  52.08 
 
 		 270 aa  227  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  52.27 
 
 		 270 aa  227  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  52.08 
 
 		 270 aa  227  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  44.53 
 
 		 285 aa  227  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  42.59 
 
 		 267 aa  226  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0042  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 284 aa  226  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0834315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  47.66 
 
 		 268 aa  226  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  48.65 
 
 		 267 aa  226  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  43.98 
 
 		 266 aa  226  4e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  43.98 
 
 		 266 aa  226  4e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  43.98 
 
 		 266 aa  226  4e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  43.98 
 
 		 266 aa  226  4e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  43.98 
 
 		 266 aa  226  4e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  43.98 
 
 		 266 aa  226  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  46.67 
 
 		 263 aa  225  4e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  43.98 
 
 		 266 aa  225  6e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  50.94 
 
 		 270 aa  225  7e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  46.39 
 
 		 288 aa  224  8e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  46.39 
 
 		 288 aa  224  8e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  43.61 
 
 		 266 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  43.61 
 
 		 266 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  47.73 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  50.94 
 
 		 273 aa  224  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  47.74 
 
 		 270 aa  224  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  48.83 
 
 		 266 aa  223  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  51.52 
 
 		 270 aa  223  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  46.89 
 
 		 266 aa  223  3e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  47.51 
 
 		 268 aa  220  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1561  phosphomethylpyrimidine kinase  47.74 
 
 		 335 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  43.73 
 
 		 266 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  43.61 
 
 		 266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  48.67 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  41.57 
 
 		 267 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  49.41 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  43.73 
 
 		 266 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  43.58 
 
 		 276 aa  219  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  45.42 
 
 		 265 aa  219  3e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0867  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 		 264 aa  219  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  43.58 
 
 		 276 aa  219  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  43.73 
 
 		 266 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  43.23 
 
 		 266 aa  218  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  45.31 
 
 		 271 aa  218  7e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  43.73 
 
 		 266 aa  218  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  46.12 
 
 		 297 aa  217  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  44.49 
 
 		 273 aa  218  1e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1942  phosphomethylpyrimidine kinase  47.92 
 
 		 269 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 		 308 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  42.48 
 
 		 266 aa  216  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  42.16 
 
 		 266 aa  216  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.385467 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>