More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0928 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
271 aa  545  1e-154  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  63.81 
 
 
268 aa  303  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  58.78 
 
 
266 aa  293  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  56.7 
 
 
266 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  58.33 
 
 
268 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  59.11 
 
 
270 aa  281  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  57.58 
 
 
268 aa  279  4e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  57.2 
 
 
268 aa  276  4e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  57.09 
 
 
269 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  57.09 
 
 
271 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  58.24 
 
 
272 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  58.33 
 
 
308 aa  259  4e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  54.07 
 
 
288 aa  257  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  53.88 
 
 
265 aa  256  2e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  52.85 
 
 
267 aa  256  2e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  57.09 
 
 
268 aa  256  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  52.65 
 
 
267 aa  256  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  57.58 
 
 
283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4493  phosphomethylpyrimidine kinase  55.17 
 
 
266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  54.02 
 
 
260 aa  253  3e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 
267 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  51.15 
 
 
264 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  51.15 
 
 
264 aa  250  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  55.94 
 
 
284 aa  247  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  51.71 
 
 
268 aa  246  3e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
267 aa  246  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 
267 aa  245  6.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  51.1 
 
 
297 aa  245  6.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  54.96 
 
 
264 aa  244  8e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  51.91 
 
 
262 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  52.26 
 
 
288 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  52.26 
 
 
288 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  49.44 
 
 
269 aa  243  3e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2392  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  52.21 
 
 
531 aa  242  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171536  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 
264 aa  242  6e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  46.79 
 
 
269 aa  241  1e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2146  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  52.04 
 
 
518 aa  241  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000135123 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
270 aa  240  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
266 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  52.69 
 
 
264 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  48.47 
 
 
267 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1361  phosphomethylpyrimidine kinase  53.87 
 
 
268 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
266 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
266 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3294  phosphomethylpyrimidine kinase  57.36 
 
 
293 aa  239  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6036  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  55.06 
 
 
269 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190496  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2041  phosphomethylpyrimidine kinase  55.06 
 
 
269 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1658  phosphomethylpyrimidine kinase  55.13 
 
 
268 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
267 aa  238  6.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
266 aa  238  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
266 aa  238  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4968  phosphomethylpyrimidine kinase  57.6 
 
 
267 aa  238  9e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.949163  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5350  phosphomethylpyrimidine kinase  54.85 
 
 
269 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.120967 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2060  phosphomethylpyrimidine kinase  54.31 
 
 
269 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.373143 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  52.09 
 
 
264 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  48.47 
 
 
266 aa  235  6e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  48.47 
 
 
266 aa  235  6e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  48.47 
 
 
266 aa  235  6e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  48.47 
 
 
266 aa  235  6e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  48.47 
 
 
266 aa  235  6e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  48.47 
 
 
266 aa  235  6e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  48.47 
 
 
266 aa  234  8e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  48.09 
 
 
266 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  48.09 
 
 
266 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  51.14 
 
 
323 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  53.41 
 
 
297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  48.09 
 
 
266 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  53.56 
 
 
273 aa  232  5e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
295 aa  232  6e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  52.08 
 
 
269 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  45.52 
 
 
267 aa  231  8.000000000000001e-60  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  46.77 
 
 
270 aa  231  1e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  53.28 
 
 
497 aa  231  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  47.92 
 
 
266 aa  231  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  48.3 
 
 
263 aa  231  1e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2479  phosphomethylpyrimidine kinase  53.99 
 
 
268 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0351011  hitchhiker  0.000627669 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 
286 aa  230  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  46.39 
 
 
270 aa  230  2e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  46.39 
 
 
270 aa  229  3e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  57.14 
 
 
484 aa  229  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0889  phosphomethylpyrimidine kinase  53.87 
 
 
293 aa  229  3e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000698623  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  48.11 
 
 
272 aa  229  3e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  49.05 
 
 
266 aa  229  4e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  49.05 
 
 
266 aa  229  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  49.05 
 
 
266 aa  228  7e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1236  phosphomethylpyrimidine kinase  53.79 
 
 
269 aa  228  7e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.252768 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  53.49 
 
 
490 aa  227  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  53.05 
 
 
280 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  53.41 
 
 
263 aa  228  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  44.68 
 
 
510 aa  226  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 
285 aa  227  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  49.23 
 
 
270 aa  226  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1942  phosphomethylpyrimidine kinase  53.56 
 
 
269 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1561  phosphomethylpyrimidine kinase  51.14 
 
 
335 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2073  phosphomethylpyrimidine kinase  53.56 
 
 
269 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  48.89 
 
 
285 aa  226  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2378  phosphomethylpyrimidine kinase  51.15 
 
 
283 aa  226  3e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  51.52 
 
 
271 aa  225  6e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 
270 aa  224  9e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  53.1 
 
 
497 aa  224  9e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>