More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1935 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 283 aa  554  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  98.94 
 
 		 308 aa  546  1e-154  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  75.52 
 
 		 297 aa  392  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3067  phosphomethylpyrimidine kinase  77.94 
 
 		 299 aa  360  2e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.119732  normal  0.199028 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3294  phosphomethylpyrimidine kinase  77.21 
 
 		 293 aa  350  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  66.43 
 
 		 288 aa  350  1e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  66.43 
 
 		 288 aa  350  1e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2399  phosphomethylpyrimidine kinase  75.09 
 
 		 287 aa  344  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  66.55 
 
 		 288 aa  342  4e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  67.16 
 
 		 280 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  64.06 
 
 		 285 aa  316  3e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  55.72 
 
 		 273 aa  271  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  55.89 
 
 		 268 aa  263  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2204  phosphomethylpyrimidine kinase  73.23 
 
 		 294 aa  260  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.811485 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  58.24 
 
 		 268 aa  258  6e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  57.47 
 
 		 268 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  57.58 
 
 		 271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  57.09 
 
 		 268 aa  253  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  54.23 
 
 		 271 aa  248  6e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0100  bifunctional hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase/hydroxy-methylpyrimidine kinase  57.09 
 
 		 301 aa  246  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.504997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3651  phosphomethylpyrimidine kinase  57.09 
 
 		 303 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  53.49 
 
 		 266 aa  245  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  52.9 
 
 		 262 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3328  phosphomethylpyrimidine kinase  56.72 
 
 		 303 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  48.67 
 
 		 264 aa  242  6e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  53.79 
 
 		 270 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  48.67 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  46.74 
 
 		 269 aa  240  2e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  50.77 
 
 		 267 aa  238  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  52.31 
 
 		 268 aa  236  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  49.03 
 
 		 270 aa  237  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  51.14 
 
 		 264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  54.17 
 
 		 270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  49.82 
 
 		 285 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  52.9 
 
 		 266 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 		 267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4493  phosphomethylpyrimidine kinase  56.59 
 
 		 266 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  52.14 
 
 		 264 aa  232  5e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  52.99 
 
 		 297 aa  231  7.000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  47.69 
 
 		 272 aa  231  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  50.58 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  51.74 
 
 		 269 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  51.94 
 
 		 260 aa  229  4e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  52.26 
 
 		 323 aa  229  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  52.31 
 
 		 267 aa  229  6e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  50.38 
 
 		 295 aa  227  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  47.53 
 
 		 269 aa  225  7e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0212  phosphomethylpyrimidine kinase  57.09 
 
 		 290 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  48.83 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1004  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 275 aa  223  2e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  50.36 
 
 		 492 aa  223  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 264 aa  223  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  49.29 
 
 		 497 aa  223  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  51.47 
 
 		 490 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  50.58 
 
 		 260 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  51.15 
 
 		 284 aa  222  6e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  49.23 
 
 		 286 aa  222  6e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  51.36 
 
 		 269 aa  222  7e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  53.12 
 
 		 497 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1407  phosphomethylpyrimidine kinase  50.38 
 
 		 267 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0169  phosphomethylpyrimidine kinase  58.21 
 
 		 276 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 		 268 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  52.67 
 
 		 269 aa  218  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.432529 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  45.16 
 
 		 510 aa  218  7.999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  53.31 
 
 		 263 aa  218  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 		 494 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  48.28 
 
 		 436 aa  216  2e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1236  phosphomethylpyrimidine kinase  56.15 
 
 		 269 aa  217  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.252768 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0285  phosphomethylpyrimidine kinase  50.92 
 
 		 295 aa  217  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  50.97 
 
 		 269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  51.17 
 
 		 271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1561  phosphomethylpyrimidine kinase  51.5 
 
 		 335 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  53.26 
 
 		 265 aa  215  5e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  44.96 
 
 		 267 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 		 266 aa  215  8e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 		 266 aa  215  8e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 		 266 aa  215  8e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 		 266 aa  215  8e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 		 266 aa  215  8e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 		 266 aa  215  8e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  49.82 
 
 		 484 aa  214  9e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  51.12 
 
 		 264 aa  214  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0209  phosphomethylpyrimidine kinase  50.96 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.606568  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2060  phosphomethylpyrimidine kinase  54.62 
 
 		 269 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.373143 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  46.33 
 
 		 266 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  46.33 
 
 		 266 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  43.02 
 
 		 270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 		 266 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  44.96 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6036  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  54.62 
 
 		 269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190496  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2041  phosphomethylpyrimidine kinase  54.62 
 
 		 269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  44.81 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  44.81 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  54.05 
 
 		 272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  51.54 
 
 		 267 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  49.82 
 
 		 484 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  46.12 
 
 		 267 aa  212  5.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0218  phosphomethylpyrimidine kinase  50.57 
 
 		 291 aa  212  7e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.940459  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1361  phosphomethylpyrimidine kinase  53.03 
 
 		 268 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.92591 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>