More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2399 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2399  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 287 aa  565  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  75.46 
 
 		 308 aa  365  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  75.09 
 
 		 283 aa  364  1e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  68.77 
 
 		 288 aa  361  7.0000000000000005e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  68.77 
 
 		 288 aa  361  7.0000000000000005e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  73.58 
 
 		 297 aa  352  5e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  69.23 
 
 		 288 aa  348  8e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3294  phosphomethylpyrimidine kinase  76.89 
 
 		 293 aa  337  9e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3067  phosphomethylpyrimidine kinase  73.38 
 
 		 299 aa  325  5e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.119732  normal  0.199028 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  67.28 
 
 		 285 aa  322  3e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  66.17 
 
 		 280 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2204  phosphomethylpyrimidine kinase  74.09 
 
 		 294 aa  279  4e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.811485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  59.25 
 
 		 273 aa  273  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3651  phosphomethylpyrimidine kinase  58.15 
 
 		 303 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3328  phosphomethylpyrimidine kinase  57.41 
 
 		 303 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  53.08 
 
 		 268 aa  255  7e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  56.32 
 
 		 268 aa  251  7e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0100  bifunctional hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase/hydroxy-methylpyrimidine kinase  56.3 
 
 		 301 aa  249  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.504997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  55.94 
 
 		 268 aa  249  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  55.89 
 
 		 268 aa  249  5e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  54.79 
 
 		 268 aa  246  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  53.52 
 
 		 266 aa  241  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  53.21 
 
 		 271 aa  241  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  55.43 
 
 		 270 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  54.68 
 
 		 270 aa  238  8e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  51.16 
 
 		 266 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  48.45 
 
 		 267 aa  233  3e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  51.5 
 
 		 285 aa  231  8.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  54.58 
 
 		 271 aa  231  9e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  52.34 
 
 		 271 aa  231  9e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  51.95 
 
 		 269 aa  231  9e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  53.25 
 
 		 272 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0212  phosphomethylpyrimidine kinase  56.34 
 
 		 290 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  48.28 
 
 		 268 aa  225  5.0000000000000005e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  48.65 
 
 		 260 aa  225  8e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  47.31 
 
 		 267 aa  225  8e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  54.09 
 
 		 263 aa  225  8e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 		 262 aa  224  9e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  50.58 
 
 		 267 aa  223  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0169  phosphomethylpyrimidine kinase  55.64 
 
 		 276 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  51.55 
 
 		 260 aa  222  4e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  46.33 
 
 		 270 aa  222  4e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  49.03 
 
 		 264 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  48.61 
 
 		 285 aa  222  6e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  52.87 
 
 		 269 aa  222  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  47.13 
 
 		 264 aa  222  6e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  52.65 
 
 		 490 aa  220  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  44.49 
 
 		 264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1407  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 267 aa  218  7.999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  44.49 
 
 		 264 aa  216  4e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  44.7 
 
 		 267 aa  216  4e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  44.66 
 
 		 267 aa  216  5e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1004  phosphomethylpyrimidine kinase  48.86 
 
 		 275 aa  215  5e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  48.67 
 
 		 270 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1958  phosphomethylpyrimidine kinase  55.51 
 
 		 271 aa  215  7e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0610158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4968  phosphomethylpyrimidine kinase  54.51 
 
 		 267 aa  215  8e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.949163  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  43.89 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0285  phosphomethylpyrimidine kinase  50.61 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  48.29 
 
 		 270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  46.3 
 
 		 265 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4493  phosphomethylpyrimidine kinase  52.31 
 
 		 266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  48.3 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  52.73 
 
 		 497 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0209  phosphomethylpyrimidine kinase  48.03 
 
 		 304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.606568  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0134  phosphomethylpyrimidine kinase  53.99 
 
 		 271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  42.69 
 
 		 269 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  44.62 
 
 		 272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  48.29 
 
 		 270 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  48.29 
 
 		 270 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  48.67 
 
 		 270 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  48.29 
 
 		 270 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  47.91 
 
 		 270 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  48.29 
 
 		 270 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  48.29 
 
 		 270 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  44.93 
 
 		 510 aa  212  5.999999999999999e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  52.61 
 
 		 275 aa  212  5.999999999999999e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  43.89 
 
 		 267 aa  211  7.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  40.91 
 
 		 269 aa  211  9e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  45.04 
 
 		 266 aa  211  9e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  45.42 
 
 		 266 aa  211  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  51.33 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  45.42 
 
 		 266 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0218  phosphomethylpyrimidine kinase  47.67 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.940459  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  48.55 
 
 		 497 aa  211  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  53.28 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  48.67 
 
 		 270 aa  210  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  49.42 
 
 		 323 aa  210  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  49.03 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  52.71 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  50.38 
 
 		 284 aa  210  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  45.42 
 
 		 436 aa  209  3e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  48.29 
 
 		 273 aa  209  5e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5777  phosphomethylpyrimidine kinase  50.56 
 
 		 277 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269735  normal  0.0629461 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  44.15 
 
 		 266 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0889  phosphomethylpyrimidine kinase  48.38 
 
 		 293 aa  206  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000698623  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  48.65 
 
 		 269 aa  206  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  43.12 
 
 		 263 aa  207  2e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  47.31 
 
 		 295 aa  206  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  45.15 
 
 		 286 aa  206  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3649  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  47.74 
 
 		 267 aa  206  5e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>