More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1305 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
323 aa  635    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1561  phosphomethylpyrimidine kinase  93.55 
 
 
335 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0060  phosphomethylpyrimidine kinase  93.19 
 
 
335 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1473  phosphomethylpyrimidine kinase  93.19 
 
 
336 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.021769  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  57.79 
 
 
267 aa  276  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  57.79 
 
 
266 aa  275  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  57.03 
 
 
266 aa  275  8e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  57.03 
 
 
266 aa  275  8e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  57.03 
 
 
266 aa  275  8e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  57.03 
 
 
266 aa  275  8e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  57.03 
 
 
266 aa  275  8e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  57.03 
 
 
266 aa  275  8e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  57.03 
 
 
266 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  56.65 
 
 
266 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  56.65 
 
 
266 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  57.79 
 
 
266 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  57.41 
 
 
266 aa  272  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  57.41 
 
 
266 aa  272  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  57.03 
 
 
266 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  55.51 
 
 
266 aa  269  5e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  55.47 
 
 
297 aa  267  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  55.4 
 
 
285 aa  267  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  56.02 
 
 
268 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  55.3 
 
 
267 aa  265  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  56.27 
 
 
266 aa  265  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  55.89 
 
 
267 aa  264  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  56.27 
 
 
266 aa  263  3e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  54.68 
 
 
264 aa  262  4.999999999999999e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  55.51 
 
 
266 aa  262  6e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1236  phosphomethylpyrimidine kinase  60.53 
 
 
269 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.252768 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  56.27 
 
 
266 aa  261  8.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  57.2 
 
 
265 aa  261  1e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  56.27 
 
 
266 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1361  phosphomethylpyrimidine kinase  56.98 
 
 
268 aa  259  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  54.37 
 
 
267 aa  259  4e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  59.93 
 
 
269 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  53.53 
 
 
285 aa  259  6e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  54.75 
 
 
267 aa  258  9e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1658  phosphomethylpyrimidine kinase  58.87 
 
 
268 aa  257  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  53.18 
 
 
268 aa  256  4e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2060  phosphomethylpyrimidine kinase  57.74 
 
 
269 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.373143 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  53.18 
 
 
268 aa  255  8e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2479  phosphomethylpyrimidine kinase  57.74 
 
 
268 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0351011  hitchhiker  0.000627669 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  52.24 
 
 
268 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6036  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  57.36 
 
 
269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190496  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2041  phosphomethylpyrimidine kinase  57.36 
 
 
269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1942  phosphomethylpyrimidine kinase  58.49 
 
 
269 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2073  phosphomethylpyrimidine kinase  58.49 
 
 
269 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  54.58 
 
 
270 aa  250  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3133  phosphomethylpyrimidine kinase  51.48 
 
 
277 aa  247  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  54.1 
 
 
274 aa  248  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5350  phosphomethylpyrimidine kinase  56.6 
 
 
269 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.120967 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  50.75 
 
 
267 aa  246  4e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  53.58 
 
 
268 aa  244  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  54.85 
 
 
270 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  51.92 
 
 
266 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  46.42 
 
 
267 aa  242  5e-63  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  48.87 
 
 
264 aa  242  7.999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5777  phosphomethylpyrimidine kinase  57.82 
 
 
277 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269735  normal  0.0629461 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  47.15 
 
 
267 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  51.54 
 
 
269 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  47.37 
 
 
264 aa  237  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  54.62 
 
 
268 aa  235  6e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1636  phosphomethylpyrimidine kinase  55.77 
 
 
499 aa  235  6e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431333  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  51.54 
 
 
271 aa  235  8e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4968  phosphomethylpyrimidine kinase  57.83 
 
 
267 aa  233  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.949163  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0209  phosphomethylpyrimidine kinase  52.85 
 
 
304 aa  230  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.606568  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0285  phosphomethylpyrimidine kinase  49.31 
 
 
295 aa  229  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0218  phosphomethylpyrimidine kinase  52.47 
 
 
291 aa  228  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.940459  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  48.01 
 
 
284 aa  226  4e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2005  phosphomethylpyrimidine kinase  54.72 
 
 
269 aa  226  4e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  53.08 
 
 
272 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  45.42 
 
 
269 aa  224  1e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2516  phosphomethylpyrimidine kinase  55.47 
 
 
269 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1577  phosphomethylpyrimidine kinase  55.47 
 
 
269 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.299671  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1352  phosphomethylpyrimidine kinase  55.47 
 
 
269 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00443333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3232  phosphomethylpyrimidine kinase  55.47 
 
 
269 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2080  phosphomethylpyrimidine kinase  55.47 
 
 
269 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2604  phosphomethylpyrimidine kinase  55.09 
 
 
778 aa  222  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.354014  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  48.09 
 
 
262 aa  222  8e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2460  phosphomethylpyrimidine kinase  55.09 
 
 
269 aa  222  8e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  46.18 
 
 
272 aa  221  9e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  51.14 
 
 
271 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  53.96 
 
 
267 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0042  phosphomethylpyrimidine kinase  52.65 
 
 
284 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0834315  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  50.95 
 
 
260 aa  221  1.9999999999999999e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  52.26 
 
 
308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4493  phosphomethylpyrimidine kinase  53.46 
 
 
266 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  51.32 
 
 
297 aa  219  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  52.26 
 
 
283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  46.92 
 
 
265 aa  217  2e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  47.51 
 
 
295 aa  217  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  47.51 
 
 
286 aa  217  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2146  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  49.81 
 
 
518 aa  215  7e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000135123 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  48.31 
 
 
288 aa  215  7e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  48.31 
 
 
288 aa  215  7e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  49.03 
 
 
436 aa  214  9.999999999999999e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1958  phosphomethylpyrimidine kinase  56 
 
 
271 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0610158  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  50.76 
 
 
264 aa  213  3.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  46.18 
 
 
264 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>